Modelamiento y estudio de la dinámica del crecimiento de colonias bacterianas por métodos gráficos

En los últimos veinte años se ha estudiado el crecimiento de colonias bacterianas y las condiciones necesarias para que dicho crecimiento se lleve a cabo, tanto de forma experimental como teórica; dando como resultado imágenes con diferentes patrones de crecimiento de colonias pero en campos de déci...

Full description

Autores:
Guerrero Salazar, Lina Maria
Tipo de recurso:
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Fecha de publicación:
2013
Institución:
Universidad Industrial de Santander
Repositorio:
Repositorio UIS
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/29519
Acceso en línea:
https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/29519
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Palabra clave:
Microscopía De Campo Amplio
Procesamiento Digital De Imágenes
Colonias Bacterianas
Morfología De Colonias
Formación De Patrones Espacio Temporales.
Wide-Field Microscopy
Digital Image Processing
Bacterial Colonies
Colony Morphology
Spatio-Temporal Pattern Formation.
Rights
License
Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
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description En los últimos veinte años se ha estudiado el crecimiento de colonias bacterianas y las condiciones necesarias para que dicho crecimiento se lleve a cabo, tanto de forma experimental como teórica; dando como resultado imágenes con diferentes patrones de crecimiento de colonias pero en campos de décimas de micras, sin ninguna información de rango. El trabajo presentado pretende hacer el estudio morfológico y dinámico del crecimiento de colonias de Bacillus polymyxa, Staphylococcus aureus y Micrococcus sp. por medio de las técnicas de profundidad de campo extendido y ampliación del campo de visión, que consisten en hacer un procesamiento digital de las imágenes proporcionando alta resolución, tanto en textura, como en topografía; esto se hace con el fin de superar las limitaciones que tiene el uso de un microscopio de campo brillante. También se busca modelar este comportamiento por medio del Modelo de Reacción-Difusión, el cual logra reproducir de manera acertada las propiedades y características de los diferentes patrones espacio temporales a través de los cuáles crecen las colonias bacterianas. Hecho esto, se hará un análisis de las imágenes obtenidas tanto por el microscopio como por la simulación para estudiar parámetros como la kurtosis, el skewness y la dimensión fractal; que ayuden a caracterizar la dinámica de dicho crecimiento. El. obtener un comportamiento tridimensional de sistemas biológicos dinámicos, permite crear estructuras y materiales con diferentes propiedades físicas y biológicas para aplicaciones industriales.
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El trabajo presentado pretende hacer el estudio morfológico y dinámico del crecimiento de colonias de Bacillus polymyxa, Staphylococcus aureus y Micrococcus sp. por medio de las técnicas de profundidad de campo extendido y ampliación del campo de visión, que consisten en hacer un procesamiento digital de las imágenes proporcionando alta resolución, tanto en textura, como en topografía; esto se hace con el fin de superar las limitaciones que tiene el uso de un microscopio de campo brillante. También se busca modelar este comportamiento por medio del Modelo de Reacción-Difusión, el cual logra reproducir de manera acertada las propiedades y características de los diferentes patrones espacio temporales a través de los cuáles crecen las colonias bacterianas. Hecho esto, se hará un análisis de las imágenes obtenidas tanto por el microscopio como por la simulación para estudiar parámetros como la kurtosis, el skewness y la dimensión fractal; que ayuden a caracterizar la dinámica de dicho crecimiento. El. obtener un comportamiento tridimensional de sistemas biológicos dinámicos, permite crear estructuras y materiales con diferentes propiedades físicas y biológicas para aplicaciones industriales.PregradoFísicoIn the last twenty years the growth of bacterial colonies has been studied and the conditions for such growth to take place, both experimentally and theoretically, resulting in images with different colony growth patterns but the resolution of those images is in áreas of tenths of microns without range information. On the other hand, theoretical studies considering the bacteria as systems with collective behavior controlled by a reduced number of parameters have been developed. The present work aims to study morphological and dynamic growth of Bacillus polymyxa, Staphylococcus aureus and Micrococcus sp. colonies by the technique of extended depth of field and extended field of view, that involve the digital processing of images by providing high resolution, both in texture and in topography, this is done in order to overcome the limitations has the use of a bright field microscope. It also seeks to model this behaviour by means of Reaction-Diffusión Model, which can reproduce in a proper way the properties and characteristics of different spatiotemporal patterns through which bacterial colonies grow. After this is done, will analyze the images obtained by the microscope so as simulation to study parameters such as the kurtosis, the skewness and the fractal dimensión, that help characterize the dynamics of growth. Getting a three-dimensional behaviour of dynamic biological systems is useful to create structures and materials with different physical and biological properties for industrial applications. 3application/pdfspaUniversidad Industrial de SantanderFacultad de CienciasFísicaEscuela de FísicaMicroscopía De Campo AmplioProcesamiento Digital De ImágenesColonias BacterianasMorfología De ColoniasFormación De Patrones Espacio Temporales.Wide-Field MicroscopyDigital Image ProcessingBacterial ColoniesColony MorphologySpatio-Temporal Pattern Formation.Modelamiento y estudio de la dinámica del crecimiento de colonias bacterianas por métodos gráficosModeling and study of the dynamic of bacterial colony growth by graphics methods.Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceORIGINALCarta de autorización.pdfapplication/pdf295228https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/95f38f8c-de4e-436a-9a55-3e3b768b3bad/downloadab7ed061b91be447df71e2e9f0efd66fMD51Documento.pdfapplication/pdf8906342https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/f4994813-8d31-4690-877c-84ae0c066bac/download320303a562f95f0201900c9ac7b606cdMD52Nota de proyecto.pdfapplication/pdf250296https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/80db4b9e-bca7-4fd2-a39e-627064bb5e23/downloade4fa7e00156306672c57f60714945637MD5320.500.14071/29519oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/295192024-03-03 15:11:48.491http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/open.accesshttps://noesis.uis.edu.coDSpace at UISnoesis@uis.edu.co