Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]

La matriz lipídica del estrato córneo (SC) es esencial para la supervivencia humana, puesto que actúa como una barrera que previene la deshidratación rápida, manteniendo al mismo tiempo al cuerpo protegido frente a virus, bacterias y radiación UV. Muchas enfermedades cutáneas, como psoriasis, dermat...

Full description

Autores:
Rivero Arenas, Natalia
Tipo de recurso:
http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
Fecha de publicación:
2019
Institución:
Universidad Industrial de Santander
Repositorio:
Repositorio UIS
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/14158
Acceso en línea:
https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/14158
https://noesis.uis.edu.co
Palabra clave:
Ceramidas
Simulación
Membrana Celular
Matriz Lipídica.
Ceramides
Simulation
Cell Membrane
Lipid Matrix.
Rights
openAccess
License
Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
id UISANTADR2_b473f2b92afbe04b07ad0a26bed89265
oai_identifier_str oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/14158
network_acronym_str UISANTADR2
network_name_str Repositorio UIS
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]
dc.title.english.none.fl_str_mv Study of molecular dynamics of a lipidic bilayer model of the stratum corneum made up of cer[np] and cer[ap]*
title Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]
spellingShingle Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]
Ceramidas
Simulación
Membrana Celular
Matriz Lipídica.
Ceramides
Simulation
Cell Membrane
Lipid Matrix.
title_short Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]
title_full Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]
title_fullStr Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]
title_full_unstemmed Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]
title_sort Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]
dc.creator.fl_str_mv Rivero Arenas, Natalia
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv Oliver Doerr, Markus Hans
Daza Espinosa, Martha Cecilia
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Rivero Arenas, Natalia
dc.subject.none.fl_str_mv Ceramidas
Simulación
Membrana Celular
Matriz Lipídica.
topic Ceramidas
Simulación
Membrana Celular
Matriz Lipídica.
Ceramides
Simulation
Cell Membrane
Lipid Matrix.
dc.subject.keyword.none.fl_str_mv Ceramides
Simulation
Cell Membrane
Lipid Matrix.
description La matriz lipídica del estrato córneo (SC) es esencial para la supervivencia humana, puesto que actúa como una barrera que previene la deshidratación rápida, manteniendo al mismo tiempo al cuerpo protegido frente a virus, bacterias y radiación UV. Muchas enfermedades cutáneas, como psoriasis, dermatitis atópica e ictiosis se derivan de alteraciones en la concentración de las ceramidas en la matriz extracelular lipídica del SC. La compleja estructura del SC presenta un reto para la comunidad científica, ya que es difícil determinar experimentalmente la relación entre su organización molecular y sus propiedades. Por lo tanto, en este trabajo de investigación, para estudiar el efecto de -hidroxifitosfingosina (CER[AP]) sobre las propiedades de la matriz lipídica, se desarrolló un modelo de bicapa con colesterol (CHOL, cholesterol) y ácido lignocérico (LA, lignoceric acid), variando la proporción CER[NP]/CER[AP] en 1:2 y 2:1, adicionalmente, se realizaron simulaciones de dinámica molecular usando el programa GROMACS 2019. Los resultados de este estudio muestran que la CER[NP] y la CER[AP] tienen un impacto diferente sobre la estructura del modelo de bicapa lipídica. En ambas proporciones la CER[NP] mostró una evidente superposición, mientras que la CER[AP] no. Además, las cadenas acilo de los lípidos no presentaron un único ángulo de inclinación durante la simulación, por el contrario, este osciló considerablemente y la CER[AP] exhibió un mayor número de enlaces de hidrógeno de tipo agua-lípido y lípido-lípido en comparación a la CER[NP]. En consecuencia, la solvatación de la CER[NP] es menor, por tanto, se favorecen las interacciones hidrofóbicas con las cadenas acilo de la capa opuesta.
publishDate 2019
dc.date.created.none.fl_str_mv 2019
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2019
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2023-04-06T20:50:44Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2023
2023-04-06T20:50:44Z
dc.type.local.none.fl_str_mv Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dc.type.hasversion.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
format http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/14158
dc.identifier.instname.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co
url https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/14158
https://noesis.uis.edu.co
identifier_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.license.none.fl_str_mv Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri.none.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommons.none.fl_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty.none.fl_str_mv Facultad de Ciencias
dc.publisher.program.none.fl_str_mv Química
dc.publisher.school.none.fl_str_mv Escuela de Química
publisher.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
institution Universidad Industrial de Santander
bitstream.url.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/088821bc-cf68-4259-b8dd-bfab1667629f/download
https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/44816e75-9ef8-4942-8fda-c0fc8a042310/download
https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/08757d50-459d-46b7-80a0-7050bdf1fd34/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 2b5c400def11e208bbd6c97ed1baf3a6
4d2861f09674e8c4b67f4b41e322c2b1
ad74f3f0578f26af095cfda608913424
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv DSpace at UIS
repository.mail.fl_str_mv noesis@uis.edu.co
_version_ 1814095215731933184
spelling Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)Oliver Doerr, Markus HansDaza Espinosa, Martha CeciliaRivero Arenas, Natalia2023-04-06T20:50:44Z20232023-04-06T20:50:44Z20192019https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/14158Universidad Industrial de SantanderUniversidad Industrial de Santanderhttps://noesis.uis.edu.coLa matriz lipídica del estrato córneo (SC) es esencial para la supervivencia humana, puesto que actúa como una barrera que previene la deshidratación rápida, manteniendo al mismo tiempo al cuerpo protegido frente a virus, bacterias y radiación UV. Muchas enfermedades cutáneas, como psoriasis, dermatitis atópica e ictiosis se derivan de alteraciones en la concentración de las ceramidas en la matriz extracelular lipídica del SC. La compleja estructura del SC presenta un reto para la comunidad científica, ya que es difícil determinar experimentalmente la relación entre su organización molecular y sus propiedades. Por lo tanto, en este trabajo de investigación, para estudiar el efecto de -hidroxifitosfingosina (CER[AP]) sobre las propiedades de la matriz lipídica, se desarrolló un modelo de bicapa con colesterol (CHOL, cholesterol) y ácido lignocérico (LA, lignoceric acid), variando la proporción CER[NP]/CER[AP] en 1:2 y 2:1, adicionalmente, se realizaron simulaciones de dinámica molecular usando el programa GROMACS 2019. Los resultados de este estudio muestran que la CER[NP] y la CER[AP] tienen un impacto diferente sobre la estructura del modelo de bicapa lipídica. En ambas proporciones la CER[NP] mostró una evidente superposición, mientras que la CER[AP] no. Además, las cadenas acilo de los lípidos no presentaron un único ángulo de inclinación durante la simulación, por el contrario, este osciló considerablemente y la CER[AP] exhibió un mayor número de enlaces de hidrógeno de tipo agua-lípido y lípido-lípido en comparación a la CER[NP]. En consecuencia, la solvatación de la CER[NP] es menor, por tanto, se favorecen las interacciones hidrofóbicas con las cadenas acilo de la capa opuesta.PregradoQuímicoThe lipid matrix of the stratum corneum (SC) is essential for human survival, as it acts as a barrier that prevents rapid dehydration while keeping the body protected against viruses, bacteria and UV radiation. Many skin diseases such as psoriasis, atopic dermatitis and ichthyosis result from alterations in the concentration of ceramides in the extracellular lipid matrix of SC. The complex structure of SC presents a challenge to the scientific community, as it is difficult to determine experimentally the relationship between its molecular organization and its properties. Therefore, in this research work, to study the effect of the concentration of non-hydroxyphitosphingosine ceramide (CER[NP]) and hydroxyphitosphingosine ceramide (CER[AP]) on the properties of the lipid matrix, a membrane model with cholesterol and lignoceric acid was developed, varying the CER[NP]/CER[AP] ratio in 1:2 and 2:1, and molecular dynamics simulations were performed using the GROMACS 2019 program. The results of this study show that CER[NP] and [AP] have a different influence on the structure of the lipid bilayer model. In both proportions CER[NP] showed an evident overlap while CER[AP] did not. Furthermore, the acylo chains of the lipids did not have a single angle of inclination during the simulation, on the contrary, it oscillated considerably. CER[AP] exhibited a higher number of water-lipid and lipid-lipid type hydrogen bonds compared to CER[NP]. Consequently, CER[NP] solvation is lower, therefore hydrophobic interactions with the acylo chains of the opposite layer are favored. *application/pdfspaUniversidad Industrial de SantanderFacultad de CienciasQuímicaEscuela de QuímicaCeramidasSimulaciónMembrana CelularMatriz Lipídica.CeramidesSimulationCell MembraneLipid Matrix.Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]Study of molecular dynamics of a lipidic bilayer model of the stratum corneum made up of cer[np] and cer[ap]*Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceORIGINALCarta de autorización.pdfapplication/pdf301977https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/088821bc-cf68-4259-b8dd-bfab1667629f/download2b5c400def11e208bbd6c97ed1baf3a6MD51Documento.pdfapplication/pdf3859599https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/44816e75-9ef8-4942-8fda-c0fc8a042310/download4d2861f09674e8c4b67f4b41e322c2b1MD52Nota de proyecto.pdfapplication/pdf199781https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/08757d50-459d-46b7-80a0-7050bdf1fd34/downloadad74f3f0578f26af095cfda608913424MD5320.500.14071/14158oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/141582023-04-17 14:26:29.744http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessembargohttps://noesis.uis.edu.coDSpace at UISnoesis@uis.edu.co