Estandarización de marcadores moleculares para la identificación taxonómica del agente causal de la mancha anillada en cultivos de frijol en Colombia
La mancha anillada del fríjol común (Phaseolus vulgaris L), a nivel global, es una enfermedad asociada a tres especies fúngicas (Boeremia diversispora, B. exigua var. exigua y Stagonosporopsis hortensis) que puede ocasionar grandes pérdidas en producción. A pesar del gasto que genera el manejo de es...
- Autores:
-
Sepulveda Castañeda, John Edinson
- Tipo de recurso:
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- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Universidad Industrial de Santander
- Repositorio:
- Repositorio UIS
- Idioma:
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- OAI Identifier:
- oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/37893
- Palabra clave:
- Marcador Molecular
Complejo Phoma
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Ascochyta
Boeremia.
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- License
- Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
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Standardization of molecular markers for the taxonomic identification of the causal agent of ascochyta blight in common bean crops in colombia* |
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Estandarización de marcadores moleculares para la identificación taxonómica del agente causal de la mancha anillada en cultivos de frijol en Colombia Marcador Molecular Complejo Phoma Its Ascochyta Boeremia. Molecular Markers Phoma Complex Its Ascochyta Boeremia. |
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Estandarización de marcadores moleculares para la identificación taxonómica del agente causal de la mancha anillada en cultivos de frijol en Colombia |
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La mancha anillada del fríjol común (Phaseolus vulgaris L), a nivel global, es una enfermedad asociada a tres especies fúngicas (Boeremia diversispora, B. exigua var. exigua y Stagonosporopsis hortensis) que puede ocasionar grandes pérdidas en producción. A pesar del gasto que genera el manejo de esta enfermedad no se conoce cuál de las tres especies asociadas a la mancha anillada es la que afecta a los cultivos de los principales departamentos productores del país. Por esta razón, el presente estudio logró ampliar la colección de patógenos del frijol del Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT) con 206 aislamientos monomiceliales provenientes de los departamentos de Huila y Tolima. Adicional a esto, con fines de realizar la identificación taxonómica del agente causal de esta enfermedad se tomaron ocho aislamientos en los que se evaluaron quince marcadores moleculares: cuatro asociados a regiones del ADN ribosomal, dos al gen del citocromo c oxidasa, tres marcadores especie-específicos de tipo SCAR y seis marcadores asociados a genes codificantes para proteínas. Diez marcadores se estandarizaron, de los cuales se destacan los de actina, calmodulina y -tubulina, dado que permitieron identificar con mayor precisión seis aislamientos como la especie B. noackiana y dos como B. exigua (diferentes variedades). Estos resultados son relevantes ya que es el primer trabajo que se realiza en el país enfocado al estudio de este patógeno, la evaluación preliminar con ocho aislamientos muestra que existen al menos dos especies asociadas a esta enfermedad y por primera vez se identifica a B. noackiana como patógeno asociado a la mancha anillada en frijol. |
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A pesar del gasto que genera el manejo de esta enfermedad no se conoce cuál de las tres especies asociadas a la mancha anillada es la que afecta a los cultivos de los principales departamentos productores del país. Por esta razón, el presente estudio logró ampliar la colección de patógenos del frijol del Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT) con 206 aislamientos monomiceliales provenientes de los departamentos de Huila y Tolima. Adicional a esto, con fines de realizar la identificación taxonómica del agente causal de esta enfermedad se tomaron ocho aislamientos en los que se evaluaron quince marcadores moleculares: cuatro asociados a regiones del ADN ribosomal, dos al gen del citocromo c oxidasa, tres marcadores especie-específicos de tipo SCAR y seis marcadores asociados a genes codificantes para proteínas. Diez marcadores se estandarizaron, de los cuales se destacan los de actina, calmodulina y -tubulina, dado que permitieron identificar con mayor precisión seis aislamientos como la especie B. noackiana y dos como B. exigua (diferentes variedades). Estos resultados son relevantes ya que es el primer trabajo que se realiza en el país enfocado al estudio de este patógeno, la evaluación preliminar con ocho aislamientos muestra que existen al menos dos especies asociadas a esta enfermedad y por primera vez se identifica a B. noackiana como patógeno asociado a la mancha anillada en frijol.PregradoBiólogoAscochyta blight of the common bean (Phaseolus vulgaris L), globally, is a disease associated with three fungal species (Boeremia diversispora, B. exigua var. exigua y Stagonosporopsis hortensis) that can cause large losses in production. Despite the expense generated by the management of this disease, it is not known which of the three species associated to Ascochyta blight is the one that affects the crops of the main producing departments of the country. For this reason, the present study was able to expand the collection of bean pathogens of the International Center for Tropical Agriculture (CIAT) with 206 monomycelial isolates from the departments of Huila and Tolima. In addition to this, for the purpose of taxonomic identification of the causal agent of this disease, eight isolates were taken in which fifteen molecular markers were evaluated: four associated with ribosomal DNA regions, two with the cytochrome c oxidase gene, three species-specific SCAR type molecular markers, and six molecular markers associated with protein-coding genes. Ten molecular markers were standardized, of which actin, calmodulin and -tubulin stand out, since they allowed to identify with greater precision six isolates as the species B. noackiana and two as B. exigua (different varieties). These results are relevant because it is the first work carried out in the country focused on the study of this pathogen, the preliminary evaluation with eight isolates shows that there are at least two species associated with this disease and for the first time B. noackiana is identified as a pathogen associated with the Ascochyta blight of common bean.application/pdfspaUniversidad Industrial de SantanderFacultad de CienciasBiologíaEscuela de BiologíaMarcador MolecularComplejo PhomaItsAscochytaBoeremia.Molecular MarkersPhoma ComplexItsAscochytaBoeremia.Estandarización de marcadores moleculares para la identificación taxonómica del agente causal de la mancha anillada en cultivos de frijol en ColombiaStandardization of molecular markers for the taxonomic identification of the causal agent of ascochyta blight in common bean crops in colombia*Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceORIGINALCarta de autorización.pdfapplication/pdf450383https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/fade3021-d283-4139-aedc-4d825bf5f396/download45ff674f79ee40449d0f48147df164c1MD51Documento.pdfapplication/pdf2170420https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/6649dbd5-f682-47c6-9a89-6e6ca7e4fd66/download2ce42e006abeaaf1cf350f431e4c8b62MD52Nota de proyecto.pdfapplication/pdf387462https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/6dd778fb-c37f-46ec-abda-64857a143435/download6f1b9b9fdc4de1e4d478082ccedf8db7MD5320.500.14071/37893oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/378932024-03-03 18:57:39.205http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/open.accesshttps://noesis.uis.edu.coDSpace at UISnoesis@uis.edu.co |