Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia

En este estudio se caracterizaron e identificaron 102 aislados de una colección bacteriana del género Bacillus obtenida del subsuelo profundo de zonas carboníferas de Colombia (Guajira y Cucunubá) mediante taxonomía polifásica. Como descriptores genotípicos se usaron el análisis de homología de secu...

Full description

Autores:
Rivera Giraldo, Catalina Lucero
Tipo de recurso:
http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
Fecha de publicación:
2014
Institución:
Universidad Industrial de Santander
Repositorio:
Repositorio UIS
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/30980
Acceso en línea:
https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/30980
https://noesis.uis.edu.co
Palabra clave:
Bacillus
Gen Arnr 16S
Ardra
Taxonomía Polifásica.
Bacillus
16S Rrna Gene
Ardra
Polyphasic Taxonomy.
Rights
License
Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
id UISANTADR2_307fe65f5af8d43a5810e0215628163e
oai_identifier_str oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/30980
network_acronym_str UISANTADR2
network_name_str Repositorio UIS
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia
dc.title.english.none.fl_str_mv Polyphasic identification of a bacterial collection of the genus bacillus obtained from subsurface deep in carboniferous zones of Colombia
title Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia
spellingShingle Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia
Bacillus
Gen Arnr 16S
Ardra
Taxonomía Polifásica.
Bacillus
16S Rrna Gene
Ardra
Polyphasic Taxonomy.
title_short Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia
title_full Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia
title_fullStr Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia
title_full_unstemmed Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia
title_sort Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia
dc.creator.fl_str_mv Rivera Giraldo, Catalina Lucero
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv Fuentes Lorenzo, Jorge Luis
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Rivera Giraldo, Catalina Lucero
dc.subject.none.fl_str_mv Bacillus
Gen Arnr 16S
Ardra
Taxonomía Polifásica.
topic Bacillus
Gen Arnr 16S
Ardra
Taxonomía Polifásica.
Bacillus
16S Rrna Gene
Ardra
Polyphasic Taxonomy.
dc.subject.keyword.none.fl_str_mv Bacillus
16S Rrna Gene
Ardra
Polyphasic Taxonomy.
description En este estudio se caracterizaron e identificaron 102 aislados de una colección bacteriana del género Bacillus obtenida del subsuelo profundo de zonas carboníferas de Colombia (Guajira y Cucunubá) mediante taxonomía polifásica. Como descriptores genotípicos se usaron el análisis de homología de secuencias del gen ARNr 16S y un Análisis de Restricción del ADN Ribosomal Amplificado (ARDRA) con las enzimas AluI, DdeI, HaeIII, TaqI y XbaI; y como descriptores fenotípicos se utilizaron 12 pruebas morfológicas, fisiológicas y metabólicas. El análisis de homología de secuencias del gen ARNr 16S resultó poco efectivo en la distinción de especies dentro de la colección. Por el contrario, los perfiles de bandas del ARDRA obtenidos con las enzimas AluI y DdeI resultaron los más informativos permitiendo identificar la mayoría de las especies encontradas en la colección; así como revelar la existencia de un posible híbrido entre las especies B. subtilis y B. licheniformis. De conjunto, los 12 descriptores fenotípicos y los 5 descriptores genotípicos ARDRA se usaron para construir una clave interactiva que permitió identificar de forma rápida y precisa siete especies de Bacillus altamente relacionadas: B. cereus, B. thuringiensis, B. licheniformis, B. subtilis, B. safensis, B, altitudinis y B. megaterium. En el trabajo se discute la utilidad de combinar métodos fenotípicos y genotípicos para la identificación de especies altamente relacionadas del género Bacillus que habitan el subsuelo profundo de zonas carboníferas de Colombia.
publishDate 2014
dc.date.available.none.fl_str_mv 2014
2024-03-03T20:46:47Z
dc.date.created.none.fl_str_mv 2014
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2014
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2024-03-03T20:46:47Z
dc.type.local.none.fl_str_mv Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dc.type.hasversion.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
format http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/30980
dc.identifier.instname.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co
url https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/30980
https://noesis.uis.edu.co
identifier_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.none.fl_str_mv Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri.none.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.rights.creativecommons.none.fl_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty.none.fl_str_mv Facultad de Ciencias
dc.publisher.program.none.fl_str_mv Biología
dc.publisher.school.none.fl_str_mv Escuela de Biología
publisher.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
institution Universidad Industrial de Santander
bitstream.url.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/24edcad5-dcc2-4641-98a6-e110c4b66305/download
https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/bd2cb8ee-c4c0-4aa7-b1f9-a45611126d06/download
https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/9f43304d-6a33-4461-a98e-e768ecedc49c/download
bitstream.checksum.fl_str_mv a729204fc33a106477a5bbd212864d51
b5271a32fe7a22882431b6e01826a4d3
606ed64a476861b72724cb90ecc01f66
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv DSpace at UIS
repository.mail.fl_str_mv noesis@uis.edu.co
_version_ 1831929755946975232
spelling Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Fuentes Lorenzo, Jorge LuisRivera Giraldo, Catalina Lucero2024-03-03T20:46:47Z20142024-03-03T20:46:47Z20142014https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/30980Universidad Industrial de SantanderUniversidad Industrial de Santanderhttps://noesis.uis.edu.coEn este estudio se caracterizaron e identificaron 102 aislados de una colección bacteriana del género Bacillus obtenida del subsuelo profundo de zonas carboníferas de Colombia (Guajira y Cucunubá) mediante taxonomía polifásica. Como descriptores genotípicos se usaron el análisis de homología de secuencias del gen ARNr 16S y un Análisis de Restricción del ADN Ribosomal Amplificado (ARDRA) con las enzimas AluI, DdeI, HaeIII, TaqI y XbaI; y como descriptores fenotípicos se utilizaron 12 pruebas morfológicas, fisiológicas y metabólicas. El análisis de homología de secuencias del gen ARNr 16S resultó poco efectivo en la distinción de especies dentro de la colección. Por el contrario, los perfiles de bandas del ARDRA obtenidos con las enzimas AluI y DdeI resultaron los más informativos permitiendo identificar la mayoría de las especies encontradas en la colección; así como revelar la existencia de un posible híbrido entre las especies B. subtilis y B. licheniformis. De conjunto, los 12 descriptores fenotípicos y los 5 descriptores genotípicos ARDRA se usaron para construir una clave interactiva que permitió identificar de forma rápida y precisa siete especies de Bacillus altamente relacionadas: B. cereus, B. thuringiensis, B. licheniformis, B. subtilis, B. safensis, B, altitudinis y B. megaterium. En el trabajo se discute la utilidad de combinar métodos fenotípicos y genotípicos para la identificación de especies altamente relacionadas del género Bacillus que habitan el subsuelo profundo de zonas carboníferas de Colombia.PregradoBiólogoIn this study we used a polyphasic taxonomy test to characterize and identify 102 isolated from bacterial collection of the genus Bacillus obtained from two deep subsoil carboniferous zones in Colombia (Guajira, department and Cucunubá, municipality). We used genotypic and phenotypic descriptors; for the first descriptor we evaluated the 16S rRNA gene sequences homology and an Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis (ARDRA) using the following enzymes Alul, Ddel, Haelll, Taql and Xbal. For the second descriptor we used 12 morphologic, physiologic and metabolic tests. We found that the 16S rRNA gene sequences homology was not sufficient in the distinction among the bacteria species from the collection. Nevertheless, the Alul and Ddel ARDRA profile bands allowed us not only a better taxonomic identification but the possible existence of and hybrid between B. subtilis and B. licheniformis. We also developed an interactive taxonomic key using the 12 phenotypic descriptors and 5 ARDRA genotypic descriptors; this taxonomic key allows precise and easy identification of 7 Bacillus species highly related such as: B. cereus, B. thuringiensis, B. licheniformis, B. subtilis, B. safensis, B, altitudinis y B. megaterium. Here we discuss the importance and usefulness of implement combine phenotypic and genotypic methods in the identification of species highly related of the Bacillus genus that inhabit subsurface deep in carboniferous zones of Colombia.application/pdfspaUniversidad Industrial de SantanderFacultad de CienciasBiologíaEscuela de BiologíaBacillusGen Arnr 16SArdraTaxonomía Polifásica.Bacillus16S Rrna GeneArdraPolyphasic Taxonomy.Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de ColombiaPolyphasic identification of a bacterial collection of the genus bacillus obtained from subsurface deep in carboniferous zones of ColombiaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceORIGINALCarta de autorización.pdfapplication/pdf102931https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/24edcad5-dcc2-4641-98a6-e110c4b66305/downloada729204fc33a106477a5bbd212864d51MD51Documento.pdfapplication/pdf3341907https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/bd2cb8ee-c4c0-4aa7-b1f9-a45611126d06/downloadb5271a32fe7a22882431b6e01826a4d3MD52Nota de proyecto.pdfapplication/pdf263929https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/9f43304d-6a33-4461-a98e-e768ecedc49c/download606ed64a476861b72724cb90ecc01f66MD5320.500.14071/30980oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/309802024-03-03 15:46:47.393http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/open.accesshttps://noesis.uis.edu.coDSpace at UISnoesis@uis.edu.co