Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia

En este estudio se caracterizaron e identificaron 102 aislados de una colección bacteriana del género Bacillus obtenida del subsuelo profundo de zonas carboníferas de Colombia (Guajira y Cucunubá) mediante taxonomía polifásica. Como descriptores genotípicos se usaron el análisis de homología de secu...

Full description

Autores:
Rivera Giraldo, Catalina Lucero
Tipo de recurso:
http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
Fecha de publicación:
2014
Institución:
Universidad Industrial de Santander
Repositorio:
Repositorio UIS
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/30980
Acceso en línea:
https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/30980
https://noesis.uis.edu.co
Palabra clave:
Bacillus
Gen Arnr 16S
Ardra
Taxonomía Polifásica.
Bacillus
16S Rrna Gene
Ardra
Polyphasic Taxonomy.
Rights
License
Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
Description
Summary:En este estudio se caracterizaron e identificaron 102 aislados de una colección bacteriana del género Bacillus obtenida del subsuelo profundo de zonas carboníferas de Colombia (Guajira y Cucunubá) mediante taxonomía polifásica. Como descriptores genotípicos se usaron el análisis de homología de secuencias del gen ARNr 16S y un Análisis de Restricción del ADN Ribosomal Amplificado (ARDRA) con las enzimas AluI, DdeI, HaeIII, TaqI y XbaI; y como descriptores fenotípicos se utilizaron 12 pruebas morfológicas, fisiológicas y metabólicas. El análisis de homología de secuencias del gen ARNr 16S resultó poco efectivo en la distinción de especies dentro de la colección. Por el contrario, los perfiles de bandas del ARDRA obtenidos con las enzimas AluI y DdeI resultaron los más informativos permitiendo identificar la mayoría de las especies encontradas en la colección; así como revelar la existencia de un posible híbrido entre las especies B. subtilis y B. licheniformis. De conjunto, los 12 descriptores fenotípicos y los 5 descriptores genotípicos ARDRA se usaron para construir una clave interactiva que permitió identificar de forma rápida y precisa siete especies de Bacillus altamente relacionadas: B. cereus, B. thuringiensis, B. licheniformis, B. subtilis, B. safensis, B, altitudinis y B. megaterium. En el trabajo se discute la utilidad de combinar métodos fenotípicos y genotípicos para la identificación de especies altamente relacionadas del género Bacillus que habitan el subsuelo profundo de zonas carboníferas de Colombia.