Estandarización de una PCR-SSP para la identificación del fitopatógeno phythophtora infestans (Oomycete) a partir de muestras de ADN en frutos inoculados en la berenjena (Solanum Melongena)

La infección causada por Phytophtora infestans ocasiona la enfermedad de gota, marchitez, gotera, lancha o tizón tardío que afecta a la mayoría de especies de la familia Solanaceae. En la berenjena (Solanum melongena) aún no se tiene claro cuál es la especie, o las especies del género Phytophtora que afectan a la planta y que es la causante de la podredumbre de los frutos, y, muchas veces, llega a ser confundido con otros géneros de hongos como Fusarium spp y Botrytis spp. En consecuencia, no se puede determinar qué tipo de control se puede utilizar frente al patógeno y que tipo de funguicida emplear. Inoculando hasta 25 frutos de berenjena utilizando el linaje clonal EC-1, se realizaron extracciones de ADN, que luego fueron cuantificadas por el equipo Nanodrop 2000c; para estandarizar una PCR-SPP empleando Cebadores o Primers de Secuencias ITS. Los resultados de estas extracciones y de las PCRs, fueron visualizadas en geles de agarosa al 2% y 3%. Para probar la sensibilidad de la prueba, se realizaron diluciones de hasta 10-3. El linaje Clonal de Phytophtora infestans EC-1, no está reportado como agente causal de la enfermedad de gota, marchitez, gotera, lancha o tizón tardío en la berenjena, se propone como nuevo patógeno para Solaum melongena. Se utilizaron 3 juegos de primers de secuencias ITS, solo dos de ellos amplifican el tamaño real de una ITS y cumple con sus características. El tercer juego se descarta como secuencia ITS, pero no se descarta como secuencia de proteína especifica según lo consultado con la base de datos NBCI.

• Tipo de recurso: Trabajo de grado de pregrado
• Fecha de publicación: 2017
• Institución: Universidad Distrital Francisco José de Caldas
• Repositorio: RIUD: repositorio U. Distrital
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repository.udistrital.edu.co:11349/5451
• Acceso en línea: http://hdl.handle.net/11349/5451
• Palabra clave: Secuencias ITS; Electroforesis; Phytophtora Infestans; Inoculación; PCR-SSP; Solanum melongena; Licenciatura en Biología - Tesis y disertaciones académicas; Reacción en cadena de la polimerasa; Patología vegetal; Berenjena; ITS sequences; Inoculation; PCR-SSP; Electrophoresis; Phytophtora infestans; Solanum melongena
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