Diseño de un Marcador Molecular para Identificar el Segmento VS4 el Gen omp1 de Chlamydia Trachomatis en Mujeres Embarazadas con Presión Arterial Alta Asociada a Preeclampsia

Chlamydia trachomatis es una bacteria gram negativa intracelular obligada que causa grandes afecciones a la salud (ITS) de mujeres, hombres y niños y que en la mayoría de los casos no presenta síntomas dificultando su detección. Adicionalmente, causa diferentes patologías dependiendo del hospedero y...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2015
Institución:
Universidad Distrital Francisco José de Caldas
Repositorio:
RIUD: repositorio U. Distrital
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.udistrital.edu.co:11349/2925
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/11349/2925
Palabra clave:
Chlamydia trachomatis
Gen omp1
ITS
Marcador molecular
Bioinformática
HotStartPCR
Serovariante
Segmento VS4
Proteína MOMP
Chlamydia trachomatis
Gene omp1
STD
Molecular marker
Bioinformatic
HotStartPCR
Serovar
VS4 segment
MOMP protein
Rights
License
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
Description
Summary:Chlamydia trachomatis es una bacteria gram negativa intracelular obligada que causa grandes afecciones a la salud (ITS) de mujeres, hombres y niños y que en la mayoría de los casos no presenta síntomas dificultando su detección. Adicionalmente, causa diferentes patologías dependiendo del hospedero y el lugar de infección. Ante esta problemática se planteó diseñar un marcador molecular eficaz, especifico, sensible y económico para identificar el segmento VS4 del gen omp1 de la proteína MOMP de Chlamydia trachomatis en mujeres embarazadas con preeclampsia de un sector de Bogotá e identificar las serovariantes presentes en este segmento que causan enfermedades o infecciones genitales. Para lograrlo se recurrió a programas y herramientas bioinformáticas como, por un lado GenBank, PickPrimer y Blast de NCBI, por otro lado NetPrimer y Primer3 para el diseño y comprobación teórica de estos marcadores moleculares; mientras que para la amplificación del segmento se realizaron Reacciones en Cadena de Polimerasa (PCR) convencional, en caliente y en tiempo real para, finalmente, dar lectura en electroforesis con gel de agarosa. Posteriormente, se obtuvo como resultado tres pares de marcadores moleculares llamados SV2, SV4 y SV3 que amplificaron segmentos de 128 pb (región VS3), 277 pb (región VS4) y 282 pb (región VS3-VS4) respectivamente, en mujeres y hombres por medio de la técnica HotStartPCR; adicionalmente, el par de marcadores moleculares SV3 mostró una alta sensibilidad y especificidad ya que pudo identificar la presencia de C. trachomitis en muestras de ADN de tan solo 3ng/µl al realizarse la prueba con qPCR y en cuanto a las seroviariantes, se reconocieron diez derivadas de las variantes B, D, E, F, G y L, causantes de enfermedades genitourinarias y oculares. Se puede concluir que los marcadores moleculares diseñados en este trabajo cumplen con los requisitos deseados pero necesitan ser aplicados con la técnica de HotStartPCR o qPCR y permite detectar esta ITS tanto en hombre como mujeres, sin embargo se recomienda realizar un estudio enfocado a mujeres embarazadas con preeclampsia porque esta parte del estudio no pudo ser completada.