Efectividad del gen ITS (código de barras) en la determinación de especies de la liquenobiota del Alto el Tablazo, Subachoque

Buscando evaluar la efectividad del uso del gen ITS Código de barras como herramienta en la determinación a especie de líquenes en inventarios florísticos, se realizó la recolección de 130 individuos en un minitransecto del Alto del Tablazo (Cundinamarca-Colombia.). Para la evaluación se realizó una...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2016
Institución:
Universidad Distrital Francisco José de Caldas
Repositorio:
RIUD: repositorio U. Distrital
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.udistrital.edu.co:11349/8944
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/11349/8944
Palabra clave:
Parmotrema
Líquenes de Colombia
Inventarios florísticos
Diversidad alfa
Licenciatura en Biología - Tesis y disertaciones académicas
Líquenes - Identificación
Especímenes botánicos
Genética de líquenes
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description Buscando evaluar la efectividad del uso del gen ITS Código de barras como herramienta en la determinación a especie de líquenes en inventarios florísticos, se realizó la recolección de 130 individuos en un minitransecto del Alto del Tablazo (Cundinamarca-Colombia.). Para la evaluación se realizó una comparación de determinaciones por tres métodos: 1) La determinación clásica realizada por un estudiante, 2) la determinación clásica hecha por un experto y la determinación por medio de la comparación en el Banco de Genética (GENBank) de las secuencias del Gen ITS código de barras. Para cada uno de los casos se evaluó el tiempo, la precisión de la determinación y los costos. Los resultados permiten inferir, que en cuanto al tiempo se nota un ahorro significativo con el método del Gen ITS código de barras, promoviendo asi la utilidad de este tiempo en investigaciones alternas o en procesos de enseñanza y preparación de futuros investigadores, para el caso de la precisión en la determinacion se reafirma la certeza frente los géneros presentados por los diferentes métodos pero en cuanto a las especies se posee un margen de incertidumbre debido al no compendio de todas las secuencias de líquenes existentes en el (GENBank), y por último en cuanto al costo se ve un aumento significativo en el desarrollo de la determinación por el Gen ITS. Con base en estos resultados se concluye que la efectividad del Gen ITS código de barras para la elaboración de inventarios florísticos es una herramienta muy buena que está sujeta a factores positivos como la disminución del tiempo invertido y precisión en la determinación; y negativos como aumento notable de costos y carencia de secuencias de código de barras de la totalidad de especies existentes en GENBank.
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Los resultados permiten inferir, que en cuanto al tiempo se nota un ahorro significativo con el método del Gen ITS código de barras, promoviendo asi la utilidad de este tiempo en investigaciones alternas o en procesos de enseñanza y preparación de futuros investigadores, para el caso de la precisión en la determinacion se reafirma la certeza frente los géneros presentados por los diferentes métodos pero en cuanto a las especies se posee un margen de incertidumbre debido al no compendio de todas las secuencias de líquenes existentes en el (GENBank), y por último en cuanto al costo se ve un aumento significativo en el desarrollo de la determinación por el Gen ITS. Con base en estos resultados se concluye que la efectividad del Gen ITS código de barras para la elaboración de inventarios florísticos es una herramienta muy buena que está sujeta a factores positivos como la disminución del tiempo invertido y precisión en la determinación; y negativos como aumento notable de costos y carencia de secuencias de código de barras de la totalidad de especies existentes en GENBank.Looking to evaluate the effectiveness of the use of ITS Gene barcode as a tool in the determination of lichens species in floristic inventories, the collection of 130 individuals was carried out in a minitransect of Alto Tablazo (Cundinamarca- Colombia.). For the evaluation, a comparison of determinations was made by three methods: 1) The classical determination was made by a student, 2) The classical determination made by an expert and the determination by means of the comparison in the Bank of Genetics (GENBank) of the Gene ITS barcode. For each of the cases, the time, the precision of the determination and the costs were evaluated. The results allow us to infer that in terms of time there is a significant change with the ITS Gene barcode method, thus promoting the usefulness of this time in alternative investigations or in the teaching and preparation processes of future researchers, in the case of the precision in the determination reaffirms the certainty in front of the genus presented by the different methods but with respect to the species, there is a margin of uncertainty because the non-compendium of all the lichen sequences existing in the (GENBank), and finally, in terms of costs, there is a significant increase in the development of the determination by the ITS Gene. Based on these results, it is concluded that the effectiveness of the ITS Gene barcode for the making of floristic inventories is a very good tool that is subject to positive factors such as the reduction of time invested and precison in the determination; and negative as a significant increase in costs and lack of barcode sequences of all existing species in GENBank.pdfspaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Abierto (Texto Completo)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2ParmotremaLíquenes de ColombiaInventarios florísticosDiversidad alfaLicenciatura en Biología - Tesis y disertaciones académicasLíquenes - IdentificaciónEspecímenes botánicosGenética de líquenesParmotremaLichens of ColombiaFloristic inventoriesAlpha diversityEfectividad del gen ITS (código de barras) en la determinación de especies de la liquenobiota del Alto el Tablazo, SubachoqueEffectiveness of the ITS gene (bar code) in the determination of liquenobiota species of the Alto Tablazo, SubachoqueInvestigación-Innovacióninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTHUMBNAILRiveraRubianoDanielaLucia2017.pdf.jpgRiveraRubianoDanielaLucia2017.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg4995http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/8944/4/RiveraRubianoDanielaLucia2017.pdf.jpg16959be1240a6e8f9641e66ea064ebf9MD54open accessRiveraRubianoDanielaLucia2017 A1.pdf.jpgRiveraRubianoDanielaLucia2017 A1.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg21607http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/8944/5/RiveraRubianoDanielaLucia2017%20A1.pdf.jpg39524bf97e5c19b72761c39aa330df46MD55open accessORIGINALRiveraRubianoDanielaLucia2017.pdfRiveraRubianoDanielaLucia2017.pdfapplication/pdf1865111http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/8944/1/RiveraRubianoDanielaLucia2017.pdfe5a294b54382f9b1a1e6a7b3856f6290MD51open accessRiveraRubianoDanielaLucia2017 A1.pdfRiveraRubianoDanielaLucia2017 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