Evolución de la variación estructural del receptor endocannabinoide CB1 frente a candidatos endógenos y exógenos
La determinación de la respuesta del receptor endocannabinoide CB1 frente a moduladores de actividad biológica se realizó a través de técnicas In silico de química computacional; se tuvo en cuenta en general el comportamiento del receptor sin ligando y con cinco ligandos seleccionado (Rimonabant, An...
- Autores:
-
Cifuentes López, Andrés Camilo
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2020
- Institución:
- Universidad Distrital Francisco José de Caldas
- Repositorio:
- RIUD: repositorio U. Distrital
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.udistrital.edu.co:11349/25414
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/11349/25414
- Palabra clave:
- Anandamida
Receptor CB1
Dinámica molecular
Enfermedades de Parkinson y Alzheimer
Licenciatura en Química - Tesis y Disertaciones Académicas
Marihuana -Efectos fisiológicos
Inhibidores - Clasificación
Inhibidores - Análisis químico
Anandamide
CB1 Receptor
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Parkinson and Alzheimer diseases
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- License
- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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La determinación de la respuesta del receptor endocannabinoide CB1 frente a moduladores de actividad biológica se realizó a través de técnicas In silico de química computacional; se tuvo en cuenta en general el comportamiento del receptor sin ligando y con cinco ligandos seleccionado (Rimonabant, Anandamida, Tetrahidrocannabinol, AA06 y AE09). Se empleo la técnica de docking y docking molecular masivo para la ubicación de cada ligando en el sitio activo del receptor mediante el software Autodock vina y dinámica molecular para el análisis de la estructural mediante el software GROMACS y el campo fuerza CHARMM, donde el comportamiento dinámico del sistema se obtiene mediante las interacciones de estiramiento, flexión y torsión del receptor. Se determino que mediante el análisis de las interacciones no enlazantes entre cada ligando y los aminoácidos del sistema no es suficiente para determinar la actividad biológica de los candidatos evaluados. Se encuentra que la región del receptor con mayor variación estructural a lo largo de la dinámica molecular está conformada por el loop intracelular 3, así como la variación de la estructura secundaria del receptor producto de la interacción con los diferentes ligandos evaluados, donde la mayor pérdida de estructura secundaria se asoció al candidato AA06, el cual se constituyó como potencial antagonista frente al candidato AE09 como potencial agonista. |
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Se determino que mediante el análisis de las interacciones no enlazantes entre cada ligando y los aminoácidos del sistema no es suficiente para determinar la actividad biológica de los candidatos evaluados. Se encuentra que la región del receptor con mayor variación estructural a lo largo de la dinámica molecular está conformada por el loop intracelular 3, así como la variación de la estructura secundaria del receptor producto de la interacción con los diferentes ligandos evaluados, donde la mayor pérdida de estructura secundaria se asoció al candidato AA06, el cual se constituyó como potencial antagonista frente al candidato AE09 como potencial agonista.The determination of the response of the endocannabinoid CB1 receptor against modulators of biological activity was carried out through In silico techniques of computational chemistry; The behavior of the receptor without ligand and with five selected ligands was generally taken into account (Rimonabant, Anandamide, Tetrahydrocannabinol, AA06, and AE09). The massive molecular docking and docking technique was used for the location of each ligand in the active site of the receptor using the Autodock vina and molecular dynamics software for the analysis of the structure using the GROMACS software and the CHARMM force field, where the dynamic behavior The system is obtained through the interactions of stretching, bending and torsion of the receptor. It was determined that by analyzing the non-binding interactions between each ligand and the amino acids of the system it is not enough to determine the biological activity of the evaluated candidates. It is found that the receptor region with the greatest structural variation throughout molecular dynamics is made up of intracellular loop 3, as well as the variation of the receptor's secondary structure as a result of interaction with the different ligands evaluated, where the greatest loss of secondary structure, it was associated with candidate AA06, which was established as a potential antagonist against candidate AE09 as a potential agonist.pdfspaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Restringido (Solo Referencia)http://purl.org/coar/access_right/c_16ecAnandamidaReceptor CB1Dinámica molecularEnfermedades de Parkinson y AlzheimerLicenciatura en Química - Tesis y Disertaciones AcadémicasMarihuana -Efectos fisiológicosInhibidores - ClasificaciónInhibidores - Análisis químicoAnandamideCB1 ReceptorMolecular dynamicsParkinson and Alzheimer diseasesEvolución de la variación estructural del receptor endocannabinoide CB1 frente a candidatos endógenos y exógenosEvolution of the structural variation of the endocannabinoid CB1 receptor against endogenous and exogenous candidatesMonografíainfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTHUMBNAILCifuentesLopezAndresCamilo2020.pdf.jpgCifuentesLopezAndresCamilo2020.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6033https://repository.udistrital.edu.co/bitstreams/73a94090-89d8-4daf-91b8-6f63bb21dede/download01e3aef02e1f5cb72e4c6fab89300133MD512Licencia y autorización de los autores para publicar.pdf.jpgLicencia y autorización de los autores para publicar.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg13147https://repository.udistrital.edu.co/bitstreams/366a8c07-f3ee-45a4-b8dc-070dd025ed03/download327d6e4507f9dfae6bb868f18c82f5c0MD513CifuentesLopezAndresCamilo2020Anexos.pdf.jpgCifuentesLopezAndresCamilo2020Anexos.pdf.jpgIM 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