Diseño y síntesis de un péptido con y sin restricción conformacional de una proteína expresada por el Gen Pb-1 de Oryza sativa involucrada en el mecanismo de defensa contra la pyricularia

El hongo Pyricularia Oryzae es el agente causante de la piriculariosis, enfermedad de alto impacto en la producción de arroz (Oryza sativa) en el mundo, causando graves lesiones en la planta y pérdida parcial o total del grano. La reacción natural de las plantas a especies patógenas es de corta dura...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2016
Institución:
Universidad Distrital Francisco José de Caldas
Repositorio:
RIUD: repositorio U. Distrital
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.udistrital.edu.co:11349/3467
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/11349/3467
Palabra clave:
Síntesis de péptidos en fase sólida, Pyricularia, Gen Pb-1 de Oryza sativa, Restricción conformacional, sitio de nucleación.
Química
Licenciatura en química - Tesis y disertaciones académicas
Péptidos
Gen Pb1
Oryza sativa
Synthesis of peptides in solid phase, Pyricularia, Pb-1 gene of Oryza sativa, conformational restriction, nucleation site.
Rights
License
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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description El hongo Pyricularia Oryzae es el agente causante de la piriculariosis, enfermedad de alto impacto en la producción de arroz (Oryza sativa) en el mundo, causando graves lesiones en la planta y pérdida parcial o total del grano. La reacción natural de las plantas a especies patógenas es de corta duración debido a las condiciones bióticas y abióticas del cultivo; sin embargo, este mecanismo de defensa ha fomentado el estudio y desarrollo de variedades resistentes, que se emplean para el control de la enfermedad. Con la visión de aportar a la ampliación del germoplasma en variedades de resistencia de este cereal, la Federación Nacional de Arroceros de Colombia y los grupos de investigación Biomolc y Proteoma UD de la Universidad Distrital Francisco José de Caldas, han estudiado genes que confieren resistencia a la Pyricularia, como es el caso del Gen Pb-1 de Oryza sativa, el cual expresa una proteína de resistencia involucrada en el mecanismo de defensa ante esta enfermedad. En este trabajo se seleccionaron los fragmentos LHEDQYAQILQE y DEEEKDNDDN con tendencia alfa helical de dicha proteína, se sintetizaron las secuencias lineales y sus correspondientes análogos con restricción conformacional a alfa hélice siguiendo el modelo de doble dímero (en proceso de patente). Los resultados por cromatografía líquida de alta eficiencia en fase reversa (RP-HPLC), espectrometría de masas (EM) y dicroísmo circular (CD) muestran que se pudo obtener los productos propuestos y se demostró la utilidad del sitio de nucleación JAZ (en proceso de patente) para estabilizar fragmentos de proteínas con tendencia helical
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Con la visión de aportar a la ampliación del germoplasma en variedades de resistencia de este cereal, la Federación Nacional de Arroceros de Colombia y los grupos de investigación Biomolc y Proteoma UD de la Universidad Distrital Francisco José de Caldas, han estudiado genes que confieren resistencia a la Pyricularia, como es el caso del Gen Pb-1 de Oryza sativa, el cual expresa una proteína de resistencia involucrada en el mecanismo de defensa ante esta enfermedad. En este trabajo se seleccionaron los fragmentos LHEDQYAQILQE y DEEEKDNDDN con tendencia alfa helical de dicha proteína, se sintetizaron las secuencias lineales y sus correspondientes análogos con restricción conformacional a alfa hélice siguiendo el modelo de doble dímero (en proceso de patente). Los resultados por cromatografía líquida de alta eficiencia en fase reversa (RP-HPLC), espectrometría de masas (EM) y dicroísmo circular (CD) muestran que se pudo obtener los productos propuestos y se demostró la utilidad del sitio de nucleación JAZ (en proceso de patente) para estabilizar fragmentos de proteínas con tendencia helicalThe fungus Pyricularia Oryzae is the causative agent of the antagonist, disease of high impact in the production of rice (Oryza sativa) in the world, causing serious injuries on the ground and partial or total loss of the grain. The natural reaction of plants to pathogenic species is of short duration due to biotic and abiotic conditions of cultivation; however, this defense mechanism has promoted the study and development of resistant varieties, which are used for the control of the disease. With the vision to contribute to the expansion of the germplasm on resistance of rice varieties, the National Federation of Colombia rice and research groups Biomolc and UD proteome of the Universidad Distrital Francisco José de Caldas, have studied genes that confer resistance to the Pyricularia, as it is the case of the gene Pb - 1 of Oryza sativa, which expresses a protein involved in the mechanism of defense against this disease resistance. In this work were selected fragments LHEDQYAQILQE and DEEEKDNDDN with trend Alpha helical of this protein, is synthesized linear sequences and their corresponding analogues with conformational restriction of Alpha Helix modeled Dimer double (in patent process). The results by liquid chromatography high efficiency reverse phase (RP-HPLC), mass spectrometry (MS) and Dichroism circular (CD) show that the proposed products could be obtained and demonstrated the usefulness of the site of nucleation JAZ (in process of patent) to stabilize fragments of proteins with helical trend.FEDEARROZ, Agencia Internacional de Energía Atómica y Universidad Pontificia Católica de ValparaisopdfspaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Abierto (Texto Completo)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Síntesis de péptidos en fase sólida, Pyricularia, Gen Pb-1 de Oryza sativa, Restricción conformacional, sitio de nucleación.QuímicaLicenciatura en química - Tesis y disertaciones académicasPéptidosGen Pb1Oryza sativaSynthesis of peptides in solid phase, Pyricularia, Pb-1 gene of Oryza sativa, conformational restriction, nucleation site.Diseño y síntesis de un péptido con y sin restricción conformacional de una proteína expresada por el Gen Pb-1 de Oryza sativa involucrada en el mecanismo de defensa contra la pyriculariaDiseño and synthesis of a peptide with and without restriction conformacional of a protein expressed by the Gene Pb-1 of Oryza sativa involved in the mechanism of defense against the Pyriculariainfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTHUMBNAILGómezMorenoDianaMilena2016.pdf.jpgGómezMorenoDianaMilena2016.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6233http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/3467/6/G%c3%b3mezMorenoDianaMilena2016.pdf.jpg6e68d40182b239d31cdfc01bce65635cMD56open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-85896http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/3467/5/license.txtb204d61d4cc8bf0ee3a2b0e84c5755ddMD55open accessORIGINALGómezMorenoDianaMilena2016.pdfGómezMorenoDianaMilena2016.pdfTrabajo de 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