Análisis del ADN mitocondrial de dos especies de Siluriformes en Colombia

En el presente estudio analizamos una muestra antigua de espina pectoral de un Siluriforme hallada en excavaciones arqueológicas al sur de la Sabana de Bogotá. Se consideraron dos posibles especies a las que pertenecería dicha muestra, Eremophilus mutisii y Pimelodus yuma. La muestra fue analizada m...

Full description

Autores:
Correa Bonilla, Diana Marcela
Linares Anzola, Ingrid Tatiana
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2024
Institución:
Universidad Distrital Francisco José de Caldas
Repositorio:
RIUD: repositorio U. Distrital
Idioma:
spa
OAI Identifier:
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Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/11349/40991
Palabra clave:
Siluriformes
Pimelodus yuma
Eremophilus mutisii
Río Tunjuelo
Ictioarqueología
ADN antiguo
Licenciatura en Biología -- Tesis y disertaciones académicas
Arqueología
Zoología
Animales acuáticos
Biología
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Tunjuelo River
Ictioarchaeology
Ancient DNA
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description En el presente estudio analizamos una muestra antigua de espina pectoral de un Siluriforme hallada en excavaciones arqueológicas al sur de la Sabana de Bogotá. Se consideraron dos posibles especies a las que pertenecería dicha muestra, Eremophilus mutisii y Pimelodus yuma. La muestra fue analizada mediante NGS, se obtuvo un total aproximado de 8 millones de reads pareados y aproximadamente 24000 reads alineados. Así mismo, se calculó un contenido de ADN endógeno cercano al 38% y mediante su comparación con genomas completos reportados previamente, se confirma que la secuencia de ADN antiguo esta más cercana a la especie Pimelodus yuma que a otras especies del género. Es evidente que este pez no fue capturado localmente, pero si hacía parte importante de la dieta y consumo de grupos humanos asociados a la región del Magdalena, por lo tanto, no se puede excluir que la espina hiciera parte de los artículos comercializados desde dicha región. En próximos estudios, esta información permitirá mejorar la comprensión de la posición y relaciones filogenéticas y biogeográficas de la especie a través del tiempo. Además de apoyar el análisis de las especies que pueden estar asociadas al “comercio de peces” hacia el siglo XVI entre las poblaciones de la Sabana de Bogotá y el valle del Magdalena, siendo esta una tarea por adelantar y de amplia discusión.
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Es evidente que este pez no fue capturado localmente, pero si hacía parte importante de la dieta y consumo de grupos humanos asociados a la región del Magdalena, por lo tanto, no se puede excluir que la espina hiciera parte de los artículos comercializados desde dicha región. En próximos estudios, esta información permitirá mejorar la comprensión de la posición y relaciones filogenéticas y biogeográficas de la especie a través del tiempo. Además de apoyar el análisis de las especies que pueden estar asociadas al “comercio de peces” hacia el siglo XVI entre las poblaciones de la Sabana de Bogotá y el valle del Magdalena, siendo esta una tarea por adelantar y de amplia discusión.In the present study we analyzed an ancient sample of pectoral spine of a Siluriform found in archaeological excavations in the south of the Sabana of Bogotá. Two possible species were considered, Eremophilus mutisii and Pimelodus yuma. The sample was analyzed by NGS, a total of approximately 8 million paired reads and approximately 24,000 aligned reads were obtained. Likewise, an endogenous DNA content close to 38% was calculated and by comparison with previously reported complete genomes, it is confirmed that the ancient DNA sequence is closer to the species Pimelodus yuma than to other species of the genus. It is evident that this fish was not captured locally, but it was an important part of the diet of human groups associated with the Magdalena region, therefore, it cannot be excluded that the spine was part of the items traded from that region. In future studies, this information will improve the understanding of the phylogenetic and biogeographic relationships of the species through time. In addition to supporting the analysis of the species that may be associated with the "fish trade" around the sixteenth century between the populations of the Sabana de Bogotá and the Magdalena Valley, this being a task to be advanced and discussed.pdfspaAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Abierto (Texto Completo)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2SiluriformesPimelodus yumaEremophilus mutisiiRío TunjueloIctioarqueologíaADN antiguoLicenciatura en Biología -- Tesis y disertaciones académicasArqueologíaZoologíaAnimales acuáticosBiologíaSiluriformesPimelodus yumaEremophilus mutisiiTunjuelo RiverIctioarchaeologyAncient DNAAnálisis del ADN mitocondrial de dos especies de Siluriformes en ColombiaMitochondrial DNA analysis of two species of Siluriformes in Colombia.bachelorThesisInvestigación-Innovacióninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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