Evaluación in silico de la actividad biológica de los derivados de 1,2,3-triazol, con las enzimas STAT3, CB1, P450BM, CBP450, CYP51B y CYP51
En este trabajo, se toman 20 derivados de 1,2,3-triazol que actúan como ligando sobre las proteínas STAT3, CB1, P450BM, CBP450, CYP51B y CYP51. Para llevar este proceso a cabo, se usan programas de mecánica molecular y mecánica-cuántica, con los cuales se modelan, optimizan tanto ligandos como recep...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2020
- Institución:
- Universidad Distrital Francisco José de Caldas
- Repositorio:
- RIUD: repositorio U. Distrital
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- Palabra clave:
- Acoplamiento molecular, STAT3, Triazol
Docking molecular
Docking, STAT3, Triazol
Mecánica molecular
Mecánica cuántica
Licenciatura en Química - Tesis y Disertaciones Académicas
Modelos moleculares
Acoplamiento molecular.
Biología computacional
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Docking, STAT3, Triazol
Molecular mechanics
Quantum mechanics
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En este trabajo, se toman 20 derivados de 1,2,3-triazol que actúan como ligando sobre las proteínas STAT3, CB1, P450BM, CBP450, CYP51B y CYP51. Para llevar este proceso a cabo, se usan programas de mecánica molecular y mecánica-cuántica, con los cuales se modelan, optimizan tanto ligandos como receptores y se lleva a cabo el docking molecular. A partir de esto, se analizan los mejores confórmeros, con base en la energía arrojada por dichos softwares y, desde esta información, se procede a realizar un análisis sobre los acoplamientos que presentan los residuos proteicos con las unidades estructurales que conforman el ligando de estudio. Así, se categorizan las interacciones como hidrofóbicas, hidrofílicas, apilamiento aromático, puentes de hidrógeno y repulsión. De esta manera, se identifica un posible potencial inhibitorio de los mejores 5 confórmeros de los ligandos debido a su probable actividad biológica. |
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De esta manera, se identifica un posible potencial inhibitorio de los mejores 5 confórmeros de los ligandos debido a su probable actividad biológica.In this work, 20 1,2,3-triazole derivatives are taken that act as ligand on the STAT3, CB1, P450BM, CBP450, CYP51B and CYP51 proteins. To carry out this process, molecular mechanics and quantum mechanics programs are used, with which both ligands and receptors are modeled, optimized and molecular docking is carried out. From this, the best conformers are analyzed, based on the energy released by said softwares and, from this information, an analysis is made of the couplings that protein residues present with the structural units that make up the study ligand. . Thus, interactions are categorized as hydrophobic, hydrophilic, aromatic stacking, hydrogen bonding, and repulsion. In this way, a possible inhibitory potential of the best 5 ligand conformers is identified due to their probable biological activity.Universidad Distrital Francisco José de CaldaspdfspaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Abierto (Texto Completo)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Acoplamiento molecular, STAT3, TriazolDocking molecularDocking, STAT3, TriazolMecánica molecularMecánica cuánticaLicenciatura en Química - Tesis y Disertaciones AcadémicasModelos molecularesAcoplamiento molecular.Biología computacionalMolecular coupling, STAT3, TriazoleMolecular dockingDocking, STAT3, TriazolMolecular mechanicsQuantum mechanicsEvaluación in silico de la actividad biológica de los derivados de 1,2,3-triazol, con las enzimas STAT3, CB1, P450BM, CBP450, CYP51B y CYP51In silico evaluation of the biological activity of 1,2,3-triazole derivatives, with the enzymes STAT3, CB1, P450BM, CBP450, CYP51B and CYP51Investigación-Innovacióninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTHUMBNAILCobosMontesKevinJohan2020.pdf.jpgCobosMontesKevinJohan2020.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6979http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/25418/8/CobosMontesKevinJohan2020.pdf.jpg2bb768c080cb332a7491b8ef5baaea82MD58open accessCobosMontesKevinJohan2020Anexo.pdf.jpgCobosMontesKevinJohan2020Anexo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg10691http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/25418/9/CobosMontesKevinJohan2020Anexo.pdf.jpg5d427dd2e541764b37b9c7b6bcd0d6dcMD59open accesslicencia de uso y publicacion editable.pdf.jpglicencia de uso y publicacion editable.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg13433http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/25418/10/licencia%20de%20uso%20y%20publicacion%20editable.pdf.jpg9fb7ee3cf45d6e697bff35c858cf0dd9MD510open accessCC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; 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