Efecto de la presión mecánica en el atrapamiento celular en el ciclo de envejecimiento de poblaciones Single-Cell de S. cerevisiae

El envejecimiento es un fenómeno biológico complejo e importante para comprender la estructura de la vida, definido como un proceso natural en el que muchas funciones celulares cambian evidenciando deterioro por el paso del tiempo. Este ha sido un campo de bastante interés de estudio ya que si se ra...

Full description

Autores:
Rozo Bautista, Francisco Steven
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2024
Institución:
Universidad Distrital Francisco José de Caldas
Repositorio:
RIUD: repositorio U. Distrital
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.udistrital.edu.co:11349/93408
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/11349/93408
Palabra clave:
Presión
Envejecimiento
Microfluidos
Sigle-cell
GEMs
Difusión
Licenciatura en Física -- Tesis y disertaciones académicas
Envejecimiento celular
Dispositivo microfluídico
Chips (Computadores)
Pressure
Aging
Microfluidics
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Diffusion
Rights
License
Abierto (Texto Completo)
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description El envejecimiento es un fenómeno biológico complejo e importante para comprender la estructura de la vida, definido como un proceso natural en el que muchas funciones celulares cambian evidenciando deterioro por el paso del tiempo. Este ha sido un campo de bastante interés de estudio ya que si se ralentiza el envejecimiento significa alargar el ciclo de vida y prevenir muchas enfermedades que se generan a raíz de él. En este trabajo se obtuvieron resultados específicos de la incidencia de la presión mecánica sobre células de levadura en estudios de envejecimiento a “nivel Single-Cell” por medio de un dispositivo microfluídico denominado Mother Machine, que permite analizar el envejecimiento y sus cambios en el tiempo al variar la presión junto con otros parámetros. El estudio de envejecimiento se realiza tanto a nivel cronológico como replicativo. La ejecución se da por etapas que van desde la construcción del dispositivo microfluídico, la obtención de la muestra celular a estudiar, el experimento y obtención de los datos a analizar, finalmente el procesamiento y análisis de los resultados obtenidos a nivel replicativo. En la segunda línea de análisis se analiza la difusión en la célula producto del envejecimiento cronológico con arreglos experimentales específicos con GEM’S.
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En este trabajo se obtuvieron resultados específicos de la incidencia de la presión mecánica sobre células de levadura en estudios de envejecimiento a “nivel Single-Cell” por medio de un dispositivo microfluídico denominado Mother Machine, que permite analizar el envejecimiento y sus cambios en el tiempo al variar la presión junto con otros parámetros. El estudio de envejecimiento se realiza tanto a nivel cronológico como replicativo. La ejecución se da por etapas que van desde la construcción del dispositivo microfluídico, la obtención de la muestra celular a estudiar, el experimento y obtención de los datos a analizar, finalmente el procesamiento y análisis de los resultados obtenidos a nivel replicativo. En la segunda línea de análisis se analiza la difusión en la célula producto del envejecimiento cronológico con arreglos experimentales específicos con GEM’S.Aging is a complex and important biological phenomenon to understand the structure of life, defined as a natural process in which many cellular functions change, evidencing deterioration due to the passage of time. This has been a field of great interest for study since slowing down aging means lengthening the life cycle and preventing many diseases that are generated as a result of it. In this work, specific results were obtained on the incidence of mechanical pressure on yeast cells in aging studies at the “Single-Cell level” by means of a microfluidic device called Mother Machine, which allows the analysis of aging and its changes over time by varying the pressure along with other parameters. The aging study is performed at both chronological and replicative levels. The execution is carried out in stages ranging from the construction of the microfluidic device, obtaining the cell sample to be studied, the experiment and obtaining the data to be analyzed, and finally the processing and analysis of the results obtained at the replicative level. In the second line of analysis, the diffusion in the cell as a result of chronological aging is analyzed with specific experimental arrangements with GEM'S.pdfspaUniversidad Distrital Francisco José de CaldasPresiónEnvejecimientoMicrofluidosSigle-cellGEMsDifusiónLicenciatura en Física -- Tesis y disertaciones académicasEnvejecimiento celularDispositivo microfluídicoChips (Computadores)PressureAgingMicrofluidicsSingle-cellGEMsDiffusionEfecto de la presión mecánica en el atrapamiento celular en el ciclo de envejecimiento de poblaciones Single-Cell de S. cerevisiaeEffect of mechanical pressure on cell trapping in the aging cycle of S. cerevisiae single-cell populations.bachelorThesisPasantíainfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fAbierto (Texto Completo)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Acosta, I. M. (2021). Simulación con COMSOL Multiphysics de atrapamiento hidrodinámico de la levadura S. cerevisiae. BogotáBono Soler, P. L. (Julio de 2021). Determinación del espectro mutacional y respuesta al estrés oxidativo de saccharomyces cerevisiae y06240 tras diversificación genética mediante evolución experimental. efecto del método de extracción de dna genómico y metodo de creación de librerías DNAse. Valencia, España.Chen, K., Crane, M., & Kaeberlein, M. (4 de febrero de 2016). Microfluidic technologies for yeast replicative lifespan studies. Obtenido de Elsevier:Durán, D., Pedraza, J. M., Suesca, E., Forero, D., Acevedo, R., Rozo, F., . . . Hernández, C. (22 de Diciembre de 2020). Slipstreaming Mother Machine: A Microfluidic Device for Single-Cell Dynamic Imaging of Yeast. Micromachines. Obtenido de https://www.mdpi.com/2072-666X/12/1/4Eddington, S. (1928). In Nature of the Physical World. Cambridge Univ. Fernandez Rivas, D. (Diciembre de 2008). Microfluidics: How much is there new? Revista Cubana de Física, 25(2B), 142-149. 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Obtenido de https://acortar.link/1BQiWgMortimer, R., & Jhonston, J. (1959). Life span of individual yeast. Nature, 1751-1756.Nguyen, N.-T., & Wereley, S. (2006). Fundamentals and Applications of Microfluidics. Norwood, MA: Artech House microelectromechanical system seriesNIKON, & Spring , K. R. (s.f.). MicroscopyU. Recuperado el 28 de 05 de 2023, de Introduction to Fluorescence Microscopy: https://www.microscopyu.com/techniques/fluorescence/introduction-tofluorescence-microscopyO'Laughlin, R., Jin, M., Li, Y., Pillus, L., & Tsimring, L. (2019). Advances in quantitative biology methods for studying replicative aging in Saccharomyces cerevisiae. Obtenido de https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2468501119300112PhD Ramírez Lepe, M. (26 de abril de 2023). Universidad Veracruzana. Dirección de Comunicación de la Ciencia. Obtenido de https://www.uv.mx/cienciauv/blog/levaduravinoenvejecimiento/Potvin-Trottier, L., Luro, S., & Paulsson, J. (2018). Microfluidics and single-cell microscopy to study stochastic processes in bacteria. ELSEVIER, 186-192.Ramirez Lopez, N., & PhD Torres Guzman, J. (2017). CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE CEPAS DE SACCHAROMYCES CEREVISIAE. Jovenes en La ciencia UGTORuijie Song, E. A. (2018). The systems biology of single-cell aging. iScience 7 , págs. 154- 159.Schindelin, J., Cardona, A., Longair, M., Schmid, B. y otros. (2011). Fiji - ImageJ . [software de computador]. fabricante. https://fiji.sc/Settles, G. (2006). Fluid Mechanics and Homeland Security. Annual Review of Fluid Mechanics, 38, 87-110. Obtenido de https://www.annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev.fluid.38.050304.092111Steinkraus, K., Kaeberlein, M., & Kennedy, B. K. (2008). Replicative aging in yeast: the means to the end. Annual review of cell and, 24, 29-54.Thomas, N. J., & Wolyniak, M. J. (7 de Mayo de 2015). The Role of Yeast Nuclear Membrane Proteins Brr6 and Brl1 in Cell Wall. Journal of the Sciences (researchgate). 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Obtenido de https://www.nature.com/articles/nrmicro1616ORIGINALRozoBautistaFranciscoSteven2024.pdfRozoBautistaFranciscoSteven2024.pdfTrabajo de Gradoapplication/pdf5113544https://repository.udistrital.edu.co/bitstreams/1e476cc1-14d1-490d-951c-0338826dfed3/downloadf54a600c7e9aba5a53d5a4d97bd10000MD51Licencia de uso y publicacion.pdfLicencia de uso y publicacion.pdfapplication/pdf181101https://repository.udistrital.edu.co/bitstreams/dba7ac6a-5ab5-40a2-99e8-4927e7910642/download316cd6ab408f11ab4fc6254e917e6f87MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-87167https://repository.udistrital.edu.co/bitstreams/1a1c9208-bffe-47c6-be9b-48304bc51b8a/download997daf6c648c962d566d7b082dac908dMD52THUMBNAILinforme final último.pdf.jpginforme final último.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg4914https://repository.udistrital.edu.co/bitstreams/d3d20f9e-27af-41c4-b86f-f08e98c3a758/download5dd21c92e1d251712b9facdb5d90c66aMD54Licencia de uso y publicacion.pdf.jpgLicencia de uso y publicacion.pdf.jpgIM 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