Análisis de la expresión del Gen CDPK7 y evaluación del Gen EIN2 en papa criolla Solanum Tuberosum Vf. Phureja, ( Variedad Criolla Colombiana) Irradiada con Cobalto 60
En Colombia, las prácticas agrícolas se constituyen como una de las principales actividades económicas que contribuyen al desarrollo interno y seguridad alimentaria, del cual dependen la mayoría de familias productoras del país, siendo la papa criolla “Solanum tuberosum vf. Phureja” el cuarto cultiv...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad Distrital Francisco José de Caldas
- Repositorio:
- RIUD: repositorio U. Distrital
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.udistrital.edu.co:11349/23235
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/11349/23235
- Palabra clave:
- Solanum Tuberosum vf Phureja
Dormancia
CDPK7
EIN2
Tuberización
Licenciatura en Química - Tesis y disertaciones académicas
Solanum Tuberosum
Papas (Tubérculos) - Genética
Hormonas vegetales
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Analysis of the CDPK7 Gene expression and evaluation of the EIN2 Gene in Creole Potato Solanum Tuberosum Vf. Phureja, (Colombian Creole Variety) Irradiated with Cobalt 60 |
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En Colombia, las prácticas agrícolas se constituyen como una de las principales actividades económicas que contribuyen al desarrollo interno y seguridad alimentaria, del cual dependen la mayoría de familias productoras del país, siendo la papa criolla “Solanum tuberosum vf. Phureja” el cuarto cultivo de mayor consumo en el mundo, y materia prima de interés en el presente trabajo. Por consiguiente, la investigación realizada en el grupo de investigación BIOMOLC con el apoyo del Organismo Internacional de Energía Atómica IAEA, tiene como fin la identificación de los genes CDPK7 presente en tuberización y EIN2 presente en la ruta del etileno involucrado en el periodo de dormancia. En este estudio, se realizó la extracción y cuantificación del ADN de muestras de hojas y tubérculos; seleccionando 5 muestras de 121 familias de Solanum tuberosum vf, Phureja en un cultivo irradiado con cobalto 60 por su número de tubérculos y peso, a las cuales se le realizaron PCR convencional y RT-PCR, para determinar la presencia de los genes propuestos y posteriormente visualizarlos mediante electroforesis en gel de agarosa y analizar la expresión génica relativa y absoluta del gen CDPK7 en 100 ng/µL de muestra respectivamente, para elucidar una ruta de señalización adecuada que involucre los dos genes y la interacción entre ellos. Finalmente, del análisis realizado se logra evidenciar la presencia de los genes EIN2 y CDPK7, este último presentando bajos niveles de expresión debido a que la planta no fue sometida a estrés abiótico. |
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Becerra Galindo, Luis FranciscoSánchez Álvarez, Elssy LorenaBaracaldo Pinto, Daniela María2020-04-15T17:51:04Z2020-04-15T17:51:04Z2019-10-08http://hdl.handle.net/11349/23235En Colombia, las prácticas agrícolas se constituyen como una de las principales actividades económicas que contribuyen al desarrollo interno y seguridad alimentaria, del cual dependen la mayoría de familias productoras del país, siendo la papa criolla “Solanum tuberosum vf. Phureja” el cuarto cultivo de mayor consumo en el mundo, y materia prima de interés en el presente trabajo. Por consiguiente, la investigación realizada en el grupo de investigación BIOMOLC con el apoyo del Organismo Internacional de Energía Atómica IAEA, tiene como fin la identificación de los genes CDPK7 presente en tuberización y EIN2 presente en la ruta del etileno involucrado en el periodo de dormancia. En este estudio, se realizó la extracción y cuantificación del ADN de muestras de hojas y tubérculos; seleccionando 5 muestras de 121 familias de Solanum tuberosum vf, Phureja en un cultivo irradiado con cobalto 60 por su número de tubérculos y peso, a las cuales se le realizaron PCR convencional y RT-PCR, para determinar la presencia de los genes propuestos y posteriormente visualizarlos mediante electroforesis en gel de agarosa y analizar la expresión génica relativa y absoluta del gen CDPK7 en 100 ng/µL de muestra respectivamente, para elucidar una ruta de señalización adecuada que involucre los dos genes y la interacción entre ellos. Finalmente, del análisis realizado se logra evidenciar la presencia de los genes EIN2 y CDPK7, este último presentando bajos niveles de expresión debido a que la planta no fue sometida a estrés abiótico.Solanum In Colombia, agricultural practices are constituted as one of the main economic activities that contribute to internal development and food security, on which the majority of producing families in the country depend, being the Creole potato “Solanum tuberosum vf. Phureja” the fourth crop with the highest consumption in the world, and raw material of interest in this work. Therefore, the research carried out in the BIOMOLC research group with the support of the International Atomic Energy Agency IAEA, aims to identify the CDPK7 genes present in tuberization and EIN2 present in the ethylene route involved in the dormancy period. In this study, DNA extraction and quantification of leaf and tuber samples was performed; selecting 5 samples from 121 families of Solanum tuberosum vf, Phureja in a crop irradiated with cobalt 60 for their number of tubers and weight, to which conventional PCR and RT-PCR were performed, to determine the presence of the proposed genes and subsequently visualize them by agarose gel electrophoresis and analyze the relative and absolute gene expression of the CDPK7 gene in 100 ng / µL of sample respectively, to elucidate an adequate signaling pathway that involves the two genes and the interaction between them. Finally, the analysis carried out shows the presence of the EIN2 and CDPK7 genes, the latter presenting low levels of expression because the plant was not subjected.I.A.E.A. Organismo Internacional de Energía AtómicapdfspaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Restringido (Solo Referencia)http://purl.org/coar/access_right/c_16ecSolanum Tuberosum vf PhurejaDormanciaCDPK7EIN2TuberizaciónLicenciatura en Química - Tesis y disertaciones académicasSolanum TuberosumPapas (Tubérculos) - GenéticaHormonas vegetalesSolanum Tuberosum vf PhurejaDormancyCDPK7EIN2PipelineAnálisis de la expresión del Gen CDPK7 y evaluación del Gen EIN2 en papa criolla Solanum Tuberosum Vf. Phureja, ( Variedad Criolla Colombiana) Irradiada con Cobalto 60Analysis of the CDPK7 Gene expression and evaluation of the EIN2 Gene in Creole Potato Solanum Tuberosum Vf. Phureja, (Colombian Creole Variety) Irradiated with Cobalt 60Investigación-Innovacióninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTHUMBNAILSánchezÁlvarezElssyLorena2019.pdf.jpgSánchezÁlvarezElssyLorena2019.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5570http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/23235/4/S%c3%a1nchez%c3%81lvarezElssyLorena2019.pdf.jpg5f71e85420b7628dde3993699b945a85MD54open accessORIGINALSánchezÁlvarezElssyLorena2019.pdfSánchezÁlvarezElssyLorena2019.pdfapplication/pdf3894857http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/23235/2/S%c3%a1nchez%c3%81lvarezElssyLorena2019.pdfe9ebda84d5af6f3e36247fb5f2994cc5MD52metadata only accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-87163http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/23235/3/license.txtda5c6a3ca62d5dd4853000a60fee7083MD53open access11349/23235oai:repository.udistrital.edu.co:11349/232352023-06-13 11:03:01.981metadata only accessRepositorio Institucional Universidad Distrital - 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