Una mirada pedagógica sobre el diseño de isoxazolil-penicilinas del receptor 1fcm de la betalactamasa ampc empleando la técnica de acoplamiento molecular
El presente trabajo expone Expone principalmente el resultado de la búsqueda de moléculas, derivadas de los cambios estructurales del fármaco Cloxacilina en su radical fenilo, el cual se encuentra clorado. Así mismo, pone en evidencia la selección del grupo farmacóforo, el cual permitió concretar el...
- Autores:
-
Vigoya Ovalle, Edson Armando
Heredia Parra, Laura Alejandra
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad Distrital Francisco José de Caldas
- Repositorio:
- RIUD: repositorio U. Distrital
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.udistrital.edu.co:11349/28590
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/11349/28590
- Palabra clave:
- Isoxazolil penicilinas
Docking molecular
Betalactamasa
Cloxacilina
Molecular docking
Cloxacillin
Isoxazolyl penicillins,
Betalactamase
- Rights
- License
- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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A pedagogical view about the desing of isoxazolyl-penicilins of the ampc betalactamase receptor 1fcm using the docking molecular technique |
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El presente trabajo expone Expone principalmente el resultado de la búsqueda de moléculas, derivadas de los cambios estructurales del fármaco Cloxacilina en su radical fenilo, el cual se encuentra clorado. Así mismo, pone en evidencia la selección del grupo farmacóforo, el cual permitió concretar el objetivo anteriormente mencionado. En segundo lugar, el target seleccionado fue la betalactamasa, con nomenclatura 1FCM, registrada en la base de datos, Protein Data Bank. De igual manera se encuentran los aminoácidos involucrados en las interacciones no covalentes. En este orden de ideas, se plantearon 22 moléculas que presentaron una energía de afinidad menor a -8.0 Kcal/mol, dato que sirve de referencia para postular 6 moléculas que hayan registrado una afinidad menor, generada por el software autodock vina. Finalmente, como resultado se obtiene la optimización estructural del fármaco líder junto con sus nuevas interacciones en los aminoácidos LYS64, ASN149, THR313 y SER61. |
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Ramírez Valencia, AstridPeña Prieto, Luis EduardoVigoya Ovalle, Edson ArmandoHeredia Parra, Laura Alejandra2022-03-18T17:21:32Z2022-03-18T17:21:32Z2021-06-28http://hdl.handle.net/11349/28590El presente trabajo expone Expone principalmente el resultado de la búsqueda de moléculas, derivadas de los cambios estructurales del fármaco Cloxacilina en su radical fenilo, el cual se encuentra clorado. Así mismo, pone en evidencia la selección del grupo farmacóforo, el cual permitió concretar el objetivo anteriormente mencionado. En segundo lugar, el target seleccionado fue la betalactamasa, con nomenclatura 1FCM, registrada en la base de datos, Protein Data Bank. De igual manera se encuentran los aminoácidos involucrados en las interacciones no covalentes. En este orden de ideas, se plantearon 22 moléculas que presentaron una energía de afinidad menor a -8.0 Kcal/mol, dato que sirve de referencia para postular 6 moléculas que hayan registrado una afinidad menor, generada por el software autodock vina. Finalmente, como resultado se obtiene la optimización estructural del fármaco líder junto con sus nuevas interacciones en los aminoácidos LYS64, ASN149, THR313 y SER61.The present work mainly exposes the result of the search for molecules, derived from the structural changes of the drug Cloxacillin in its phenyl radical, which is chlorinated, likewise, the selection of the pharmacophore group is evidenced, which allowed to specify the aforementioned objective. Secondly, the selected target was beta-lactamase, with 1FCM nomenclature, registered in the database, Protein Data Bank, in the same way, the amino acids involved in non-covalent interactions are found, in this order of ideas, they were raised, 22 molecules that presented an affinity energy lower than -8.0 Kcal/mol, this data stated above, will become the reference value, to postulate 6 molecules that have registered a lower affinity, generated by the Autodock Vina software. To conclude, the structural optimization of the leading drug is given as a result, together with its new interactions in the amino acidsLYS64, ASN149, THR313 and SER61.pdfspaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Abierto (Texto Completo)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Isoxazolil penicilinasDocking molecularBetalactamasaCloxacilinaMolecular dockingCloxacillinIsoxazolyl penicillins,BetalactamaseUna mirada pedagógica sobre el diseño de isoxazolil-penicilinas del receptor 1fcm de la betalactamasa ampc empleando la técnica de acoplamiento molecularA pedagogical view about the desing of isoxazolyl-penicilins of the ampc betalactamase receptor 1fcm using the docking molecular techniqueProducción Académicainfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; 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