Estudio in silico dirigido al descubrimiento de inhibidores de la enzima FlaA1 de la Helicobacter pylori
H. pylori es una bacteria gram negativa, se encuentra en dos tercios de la población mundial y está relacionada con la mayoría de enfermedades gástricas, por lo que su erradicación constituye un problema de salud pública. Una de las enzimas relacionadas con esta bacteria y que se ha encontrado ser u...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad Distrital Francisco José de Caldas
- Repositorio:
- RIUD: repositorio U. Distrital
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.udistrital.edu.co:11349/26756
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/11349/26756
- Palabra clave:
- Helicobacter pylori
Enfermedades gástricas
Dinámica molecular
Docking molecular
Inhibidores
Licenciatura en Química - Tesis y Disertaciones Académicas
Helicobacter pylori.
Helicobacter pylori -Tratamiento - Medicamentos .
Enfermedades gástricas
Helicobacter pylori
Gastric diseases
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Molecular docking
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- License
- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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H. pylori es una bacteria gram negativa, se encuentra en dos tercios de la población mundial y está relacionada con la mayoría de enfermedades gástricas, por lo que su erradicación constituye un problema de salud pública. Una de las enzimas relacionadas con esta bacteria y que se ha encontrado ser un blanco molecular prometedor es la FlaA1. Se trata de la primera enzima involucrada en la ruta del ácido pseudamínico, un azúcar único en microorganismos, encargado de la glucosilación de la flagelina que es importante para el ensamblaje flagelar en Helicobacter pylori. Además, está relacionado con la síntesis de lipopolisacáridos, los cuales facilitan la adhesión y posterior colonización de la bacteria en el epitelio gástrico. Hasta la fecha, se han reportado seis inhibidores contra FlaA1. Sin embargo, estos no han sido tan efectivos al momento de aplicarse en pruebas celulares, por lo que se requiere el descubrimiento de compuestos mas eficientes con respecto a los que ya están reportados. Para esto, una alternativa son los productos naturales, ya que presentan andamios moleculares y patrones de farmacóforo que son biológicamente relevantes y por ello son ampliamente utilizados en el descubrimiento de fármacos. Por lo tanto, en este trabajo de tesis, se desarrolló un estudio computacional en el que se identificaron varios compuestos provenientes de productos naturales como posibles inhibidores de la enzima. Estas moléculas presentaron en común, un anillo de fenilo con sustituciones para-OH y/o meta-OH que también se encuentran en los compuestos reportados como inhibidores. Además, varios de estos compuestos tuvieron interacciones con los residuos del sitio activo de la enzima, por lo que se espera que también tengan actividad experimental. |
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Hasta la fecha, se han reportado seis inhibidores contra FlaA1. Sin embargo, estos no han sido tan efectivos al momento de aplicarse en pruebas celulares, por lo que se requiere el descubrimiento de compuestos mas eficientes con respecto a los que ya están reportados. Para esto, una alternativa son los productos naturales, ya que presentan andamios moleculares y patrones de farmacóforo que son biológicamente relevantes y por ello son ampliamente utilizados en el descubrimiento de fármacos. Por lo tanto, en este trabajo de tesis, se desarrolló un estudio computacional en el que se identificaron varios compuestos provenientes de productos naturales como posibles inhibidores de la enzima. Estas moléculas presentaron en común, un anillo de fenilo con sustituciones para-OH y/o meta-OH que también se encuentran en los compuestos reportados como inhibidores. Además, varios de estos compuestos tuvieron interacciones con los residuos del sitio activo de la enzima, por lo que se espera que también tengan actividad experimental.H. pylori is a gram negative bacterium, it is found in two thirds of the world population and it is related to the majority of gastric diseases, therefore its eradication constitutes a public health problem. One of the enzymes related to this bacterium that has been found to be a promising molecular target is FlaA1. It is the first enzyme involved in the pseudaminic acid pathway, a unique sugar in microorganisms, responsible for the glycosylation of flagellin that is important for flagellar assembly in Helicobacter pylori. In addition, it is related to the synthesis of lipopolysaccharides, which facilitate the adhesion and subsequent colonization of the bacteria in the gastric epithelium. To date, six inhibitors against FlaA1 have been reported. However, these have not been as effective when applied in cell tests, so the discovery of more efficient compounds is required with respect to those already reported. For this, an alternative is natural products, since they present molecular scaffolds and pharmacophore patterns that are biologically relevant and therefore are widely used in drug discovery. Therefore, in this thesis work, a computational study was developed in which several compounds from natural products were identified as possible inhibitors of the enzyme. These molecules presented in common, a phenyl ring with substitutions for-OH and / or meta-OH that are also found in the compounds reported as inhibitors. In addition, several of these compounds had interactions with the active site residues of the enzyme, so it is expected that they also have experimental activity.Universidad de los AndespdfspaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Restringido (Solo Referencia)http://purl.org/coar/access_right/c_16ecHelicobacter pyloriEnfermedades gástricasDinámica molecularDocking molecularInhibidoresLicenciatura en Química - Tesis y Disertaciones AcadémicasHelicobacter pylori.Helicobacter pylori -Tratamiento - Medicamentos .Enfermedades gástricasHelicobacter pyloriGastric diseasesMolecular dynamicsMolecular dockingInhibitorsEstudio in silico dirigido al descubrimiento de inhibidores de la enzima FlaA1 de la Helicobacter pyloriThe silico study aimed to the discovery of inhibitors of the Helicobacter pylori enzyme FlaA1Investigación-Innovacióninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-87167http://repository.udistrital.edu.co/bitstream/11349/26756/8/license.txt997daf6c648c962d566d7b082dac908dMD58open accessORIGINALMatallanaRincónSebastián2021.Estudio in silico dirigido al descubrimiento de inhibidores de la enzima FlaA1 de la Helicobacter pylori.pdfMatallanaRincónSebastián2021.Estudio in silico dirigido al descubrimiento de inhibidores de la enzima FlaA1 de la Helicobacter pylori.pdfMatallanaRincónSebastián2021.Estudio in silico dirigido al descubrimiento de inhibidores de la enzima FlaA1 de la Helicobacter 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