Herramientas y estrategias de biología molecular para la ingeniería de la biosíntesis de ácido clavulánico en Streptomyces clavuligerus ATCC27064
RESUMEN : La resistencia a los antibióticos es actualmente una de las mayores amenazas para la salud mundial, la seguridad alimentaria y el desarrollo socioeconómico, según la OMS al menos 700.000 personas mueren cada año por esta causa. Un número creciente de bacterias se han vuelto resistentes a l...
- Autores:
-
Ramírez Herrera, July Tatiana
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad de Antioquia
- Repositorio:
- Repositorio UdeA
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/24984
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10495/24984
- Palabra clave:
- Sobreexpresión génica
Compuesto químico
Chemical compounds
Bioquímica
Biochemistry
Antibióticos
Antibiotics
Ingeniería bioquímica
Biochemical engineering
Ácido clavulánico
Streptomyces clavuligerus
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_492
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27461
http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh2014000980
http://vocabularies.unesco.org/thesaurus/concept138
http://vocabularies.unesco.org/thesaurus/concept218
- Rights
- openAccess
- License
- http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/
id |
UDEA2_f4fd59221424a5b846308a998b35fd4d |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/24984 |
network_acronym_str |
UDEA2 |
network_name_str |
Repositorio UdeA |
repository_id_str |
|
dc.title.spa.fl_str_mv |
Herramientas y estrategias de biología molecular para la ingeniería de la biosíntesis de ácido clavulánico en Streptomyces clavuligerus ATCC27064 |
title |
Herramientas y estrategias de biología molecular para la ingeniería de la biosíntesis de ácido clavulánico en Streptomyces clavuligerus ATCC27064 |
spellingShingle |
Herramientas y estrategias de biología molecular para la ingeniería de la biosíntesis de ácido clavulánico en Streptomyces clavuligerus ATCC27064 Sobreexpresión génica Compuesto químico Chemical compounds Bioquímica Biochemistry Antibióticos Antibiotics Ingeniería bioquímica Biochemical engineering Ácido clavulánico Streptomyces clavuligerus http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_492 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27461 http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh2014000980 http://vocabularies.unesco.org/thesaurus/concept138 http://vocabularies.unesco.org/thesaurus/concept218 |
title_short |
Herramientas y estrategias de biología molecular para la ingeniería de la biosíntesis de ácido clavulánico en Streptomyces clavuligerus ATCC27064 |
title_full |
Herramientas y estrategias de biología molecular para la ingeniería de la biosíntesis de ácido clavulánico en Streptomyces clavuligerus ATCC27064 |
title_fullStr |
Herramientas y estrategias de biología molecular para la ingeniería de la biosíntesis de ácido clavulánico en Streptomyces clavuligerus ATCC27064 |
title_full_unstemmed |
Herramientas y estrategias de biología molecular para la ingeniería de la biosíntesis de ácido clavulánico en Streptomyces clavuligerus ATCC27064 |
title_sort |
Herramientas y estrategias de biología molecular para la ingeniería de la biosíntesis de ácido clavulánico en Streptomyces clavuligerus ATCC27064 |
dc.creator.fl_str_mv |
Ramírez Herrera, July Tatiana |
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv |
Patiño Cervantes, Luisa Fernanda |
dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Ramírez Herrera, July Tatiana |
dc.subject.lcsh.none.fl_str_mv |
Sobreexpresión génica |
topic |
Sobreexpresión génica Compuesto químico Chemical compounds Bioquímica Biochemistry Antibióticos Antibiotics Ingeniería bioquímica Biochemical engineering Ácido clavulánico Streptomyces clavuligerus http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_492 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27461 http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh2014000980 http://vocabularies.unesco.org/thesaurus/concept138 http://vocabularies.unesco.org/thesaurus/concept218 |
dc.subject.unesco.none.fl_str_mv |
Compuesto químico Chemical compounds Bioquímica Biochemistry |
dc.subject.agrovoc.none.fl_str_mv |
Antibióticos Antibiotics Ingeniería bioquímica Biochemical engineering |
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Ácido clavulánico Streptomyces clavuligerus |
dc.subject.agrovocuri.none.fl_str_mv |
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_492 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27461 |
dc.subject.lcshuri.none.fl_str_mv |
http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh2014000980 |
dc.subject.unescouri.none.fl_str_mv |
http://vocabularies.unesco.org/thesaurus/concept138 http://vocabularies.unesco.org/thesaurus/concept218 |
description |
RESUMEN : La resistencia a los antibióticos es actualmente una de las mayores amenazas para la salud mundial, la seguridad alimentaria y el desarrollo socioeconómico, según la OMS al menos 700.000 personas mueren cada año por esta causa. Un número creciente de bacterias se han vuelto resistentes a los antibióticos, por ejemplo, a través de la producción de β-lactamasas. El ácido clavulánico (AC) es uno de los compuestos capaces de inhibir las β-lactamasas, sin embargo, este tiene un alto costo en el mercado, en parte debido a los bajos niveles de producción obtenidos con la cepa de tipo salvaje, Streptomyces clavuligerus (S. clavuligerus). Con el fin de generar estrategias que permitan mejorar la producción del AC, en el presente trabajo de investigación, se aplicaron herramientas de biología molecular para generar un organismo recombinante de S. clavuligerus ATCC27064 con el gen bldD sobreexpresado. El gen bldD, es un regulador global asociado con la formación de hifas aéreas y la esporulación durante el crecimiento en algunas especies de Streptomyces, sin embargo, se desconoce su efecto regulador sobre la producción del AC en S. clavuligerus. La sobreexpresión del gen bldD en el plásmido integrativo pIB139, permitió evaluar su efecto sobre la biosíntesis del compuesto de interés (AC), el crecimiento de la biomasa y el efecto fisiológico sobre el fenotipo morfológico. La medición del AC se realizó mediante cromatografía líquida (HPLC) y los datos obtenidos mostraron una mayor producción del AC en las bacterias recombinantes con el gen bldD sobreexpresado cuando se comparó con el control durante las primeras fases de crecimiento. Así mismo, la sobreexpresión del gen bldD afectó la morfología de la bacteria, favoreciendo la formación de hifas aéreas asociadas con la producción de metabolitos secundarios en Streptomyces spp. |
publishDate |
2021 |
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2021-12-13T15:16:49Z |
dc.date.available.none.fl_str_mv |
2021-12-13T15:16:49Z |
dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2021 |
dc.type.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
dc.type.coarversion.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce |
dc.type.hasversion.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/draft |
dc.type.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
https://purl.org/redcol/resource_type/TP |
dc.type.local.spa.fl_str_mv |
Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado |
format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
status_str |
draft |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10495/24984 |
url |
http://hdl.handle.net/10495/24984 |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.rights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
dc.rights.uri.*.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/ |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
dc.rights.creativecommons.spa.fl_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
rights_invalid_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ |
dc.format.extent.spa.fl_str_mv |
31 |
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.group.spa.fl_str_mv |
Bioprocesos |
dc.publisher.place.spa.fl_str_mv |
El Carmen de Viboral |
institution |
Universidad de Antioquia |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/24984/3/license_rdf http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/24984/4/license.txt http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/24984/5/RamirezJuly_2021_HerramientasEstrategiasBiologia.pdf |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
e2060682c9c70d4d30c83c51448f4eed 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 ca755d992dd9c1fc7d9a66f004f13e05 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad de Antioquia |
repository.mail.fl_str_mv |
andres.perez@udea.edu.co |
_version_ |
1812173155362406400 |
spelling |
Patiño Cervantes, Luisa FernandaRamírez Herrera, July Tatiana2021-12-13T15:16:49Z2021-12-13T15:16:49Z2021http://hdl.handle.net/10495/24984RESUMEN : La resistencia a los antibióticos es actualmente una de las mayores amenazas para la salud mundial, la seguridad alimentaria y el desarrollo socioeconómico, según la OMS al menos 700.000 personas mueren cada año por esta causa. Un número creciente de bacterias se han vuelto resistentes a los antibióticos, por ejemplo, a través de la producción de β-lactamasas. El ácido clavulánico (AC) es uno de los compuestos capaces de inhibir las β-lactamasas, sin embargo, este tiene un alto costo en el mercado, en parte debido a los bajos niveles de producción obtenidos con la cepa de tipo salvaje, Streptomyces clavuligerus (S. clavuligerus). Con el fin de generar estrategias que permitan mejorar la producción del AC, en el presente trabajo de investigación, se aplicaron herramientas de biología molecular para generar un organismo recombinante de S. clavuligerus ATCC27064 con el gen bldD sobreexpresado. El gen bldD, es un regulador global asociado con la formación de hifas aéreas y la esporulación durante el crecimiento en algunas especies de Streptomyces, sin embargo, se desconoce su efecto regulador sobre la producción del AC en S. clavuligerus. La sobreexpresión del gen bldD en el plásmido integrativo pIB139, permitió evaluar su efecto sobre la biosíntesis del compuesto de interés (AC), el crecimiento de la biomasa y el efecto fisiológico sobre el fenotipo morfológico. La medición del AC se realizó mediante cromatografía líquida (HPLC) y los datos obtenidos mostraron una mayor producción del AC en las bacterias recombinantes con el gen bldD sobreexpresado cuando se comparó con el control durante las primeras fases de crecimiento. Así mismo, la sobreexpresión del gen bldD afectó la morfología de la bacteria, favoreciendo la formación de hifas aéreas asociadas con la producción de metabolitos secundarios en Streptomyces spp.ABSTRACT : Antibiotic resistance is currently one of the greatest threats to global health, food security and socioeconomic development, according to the WHO at least 700,000 people die each year from this cause. An increasing number of bacteria have become resistant to antibiotics, for example, through the production of β lactamases. Clavulanic acid (CA) is one of the compounds capable of inhibiting β-lactamases, however, it has a high cost in the market, partly due to the low production levels obtained with wild-type strain, Streptomyces clavuligerus (S. clavuligerus). In order to generate strategies to improve CA production, in the present research work, molecular biology tools were applied to generate a recombinant organism of S. clavuligerus ATCC27064 with the bldD gene overexpressed. The bldD gene is a global regulator associated with formation of aerial hyphae and sporulation during growth in some species of Streptomyces, however, its regulatory effect on CA production by S. clavuligerus is unknown. The bldD overexpression in the integrative plasmid pIB139, allowed to evaluate its effect on the biosynthesis of the compound of interest (CA), the growth of the biomass and the physiological effect on the morphological phenotype. Measurement of CA was carried out by liquid chromatography (HPLC) and the data obtained showed a higher CA production by the recombinant strain with the bldD gene overexpressed compared the control strain during the first growth phases. Likewise, the overexpression of the bldD gene affected the bacteria morphology, favoring the formation of aerial hyphae associated with production of secondary metabolites in Streptomyces spp.31application/pdfspainfo:eu-repo/semantics/draftinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttps://purl.org/redcol/resource_type/TPTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Sobreexpresión génicaCompuesto químicoChemical compoundsBioquímicaBiochemistryAntibióticosAntibioticsIngeniería bioquímicaBiochemical engineeringÁcido clavulánicoStreptomyces clavuligerushttp://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_492http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27461http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh2014000980http://vocabularies.unesco.org/thesaurus/concept138http://vocabularies.unesco.org/thesaurus/concept218Herramientas y estrategias de biología molecular para la ingeniería de la biosíntesis de ácido clavulánico en Streptomyces clavuligerus ATCC27064BioprocesosEl Carmen de ViboralIngeniera BioquímicaPregradoFacultad de Ingeniería. Ingeniería BioquímicaUniversidad de AntioquiaCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81051http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/24984/3/license_rdfe2060682c9c70d4d30c83c51448f4eedMD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/24984/4/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD54ORIGINALRamirezJuly_2021_HerramientasEstrategiasBiologia.pdfRamirezJuly_2021_HerramientasEstrategiasBiologia.pdfTrabajo de grado de pregradoapplication/pdf1338231http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/24984/5/RamirezJuly_2021_HerramientasEstrategiasBiologia.pdfca755d992dd9c1fc7d9a66f004f13e05MD5510495/24984oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/249842022-01-17 15:45:33.345Repositorio Institucional Universidad de Antioquiaandres.perez@udea.edu.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 |