Estandarización de una PCR en tiempo real para evaluar la expresión de genes implicados en la diferenciación de células estromales mesenquimales infectadas con Histoplasma capsulatum
RESUMEN: Las células estromales mesenquimales (MSC, por sus siglas en inglés) son cada vez más utilizadas en la terapia regenerativa por su potencial de diferenciación a diferentes linajes celulares. El objetivo de este trabajo fue estandarizar una PCR en tiempo real para determinar si la infección,...
- Autores:
-
Tamayo González, Tatiana
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Universidad de Antioquia
- Repositorio:
- Repositorio UdeA
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/32203
- Acceso en línea:
- https://hdl.handle.net/10495/32203
- Palabra clave:
- Células madre mesenquimales
Histoplasma capsulatum
Diferenciación celular
Osteogénesis
Adipogénesis
Reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
Expresión génica
Gene Expression
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Polymerase Chain Reaction
Cell Differentiation
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Estandarización de una PCR en tiempo real para evaluar la expresión de genes implicados en la diferenciación de células estromales mesenquimales infectadas con Histoplasma capsulatum Células madre mesenquimales Histoplasma capsulatum Diferenciación celular Osteogénesis Adipogénesis Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) Expresión génica Gene Expression Mesenchymal Stem Cells Polymerase Chain Reaction Cell Differentiation https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015870 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006658 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D059630 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016133 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D002454 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D010012 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D050156 |
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RESUMEN: Las células estromales mesenquimales (MSC, por sus siglas en inglés) son cada vez más utilizadas en la terapia regenerativa por su potencial de diferenciación a diferentes linajes celulares. El objetivo de este trabajo fue estandarizar una PCR en tiempo real para determinar si la infección, in vitro, con levaduras de Histoplasma capsulatum afecta el proceso de diferenciación de las MSCs, a través de la evaluación de la expresión de genes asociado con la diferenciación a adipocitos (genes que codifican para adiponectina y lipoproteinlipasa) y osteocitos (genes que codifican para la proteína factor de transcripción 2 relacionado con Runt (RUNX2) y osteocalcina). Las MSCs fueron cultivadas en medios de cultivo especiales que contenían cocteles de moléculas que inducen la diferenciación hacia linaje adipogénico y osteogénico, e incubadas a tres tiempos diferentes (0, 2 y 4 semanas), para luego ser infectadas con levaduras de Histoplasma capsulatum e incubadas nuevamente por 24 horas, para después realizar una extracción del RNA por el método fenol cloroformo y, finalmente realizar una PCR en tiempo real (qPCR). Para la qPCR se utilizaron cinco pares de primers, uno para cada gen a evaluar y otro para el gen gliceraldehido 3-fostafo deshidrogenasa (GAPDH) como gen constitutivo o normalizador. Al analizar los datos arrojados por la PCR se pudo observar que la expresión relativa de genes asociados al proceso de adipogénesis disminuyó significativamente cuando las MSCs se infectaron con las levaduras del hongo, por el contrario, los genes asociados al proceso de osteogénesis aumentaron su expresión cuando estas fueron infectadas. Los anteriores resultados permiten concluir que H. capsulatum afecta el proceso de diferenciación de las células estromales mesenquimales hacia los linajes adipogénicos y osteogénicos. Mas estudios son necesarios para evaluar las implicaciones de estos hallazgos |
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Las MSCs fueron cultivadas en medios de cultivo especiales que contenían cocteles de moléculas que inducen la diferenciación hacia linaje adipogénico y osteogénico, e incubadas a tres tiempos diferentes (0, 2 y 4 semanas), para luego ser infectadas con levaduras de Histoplasma capsulatum e incubadas nuevamente por 24 horas, para después realizar una extracción del RNA por el método fenol cloroformo y, finalmente realizar una PCR en tiempo real (qPCR). Para la qPCR se utilizaron cinco pares de primers, uno para cada gen a evaluar y otro para el gen gliceraldehido 3-fostafo deshidrogenasa (GAPDH) como gen constitutivo o normalizador. Al analizar los datos arrojados por la PCR se pudo observar que la expresión relativa de genes asociados al proceso de adipogénesis disminuyó significativamente cuando las MSCs se infectaron con las levaduras del hongo, por el contrario, los genes asociados al proceso de osteogénesis aumentaron su expresión cuando estas fueron infectadas. Los anteriores resultados permiten concluir que H. capsulatum afecta el proceso de diferenciación de las células estromales mesenquimales hacia los linajes adipogénicos y osteogénicos. Mas estudios son necesarios para evaluar las implicaciones de estos hallazgos24application/pdfspainfo:eu-repo/semantics/draftinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttps://purl.org/redcol/resource_type/TPTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Células madre mesenquimalesHistoplasma capsulatumDiferenciación celularOsteogénesisAdipogénesisReacción en cadena de la polimerasa (PCR)Expresión génicaGene ExpressionMesenchymal Stem CellsPolymerase Chain ReactionCell Differentiationhttps://id.nlm.nih.gov/mesh/D015870https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006658https://id.nlm.nih.gov/mesh/D059630https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016133https://id.nlm.nih.gov/mesh/D002454https://id.nlm.nih.gov/mesh/D010012https://id.nlm.nih.gov/mesh/D050156Estandarización de una PCR en tiempo real para evaluar la expresión de genes implicados en la diferenciación de células estromales mesenquimales infectadas con Histoplasma capsulatumGrupo de Investigación en Microbiología Básica y Aplicada-MicrobaMedellín - ColombiaMicrobiólogo y bioanalistaPregradoEscuela de Microbiología. Microbiología y BioanálisisUniversidad de AntioquiaORIGINALTamayoTatiana_2022_PCR_Diferenciacion_Celulasmadre.pdfTamayoTatiana_2022_PCR_Diferenciacion_Celulasmadre.pdfTrabajo de grado de pregradoapplication/pdf356400https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/32203/1/TamayoTatiana_2022_PCR_Diferenciacion_Celulasmadre.pdf1efee01186f15dca23a1991c8fd8c76bMD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8823https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/32203/3/license_rdfb88b088d9957e670ce3b3fbe2eedbc13MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/32203/4/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD5410495/32203oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/322032022-11-22 13:05:25.632Repositorio Institucional Universidad de Antioquiaandres.perez@udea.edu.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 |