Evaluación in vitro del efecto virucida e interacciones in sílico del Lupeol contra los cuatro serotipos del virus Dengue

RESUMEN: Introducción: No se encuentra hasta el momento disponible una terapia antiviral o vacuna específica contra el virus del Dengue (DENV). Debido a esto y a la necesidad de continuar con la búsqueda de agentes antivirales contra este virus, el objetivo de este trabajo fue evaluar in vitro el ef...

Full description

Autores:
Restrepo Méndez, Laura Cristina
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2020
Institución:
Universidad de Antioquia
Repositorio:
Repositorio UdeA
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/17026
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10495/17026
Palabra clave:
Virus del dengue
Dengue virus
Antivirales
Antiviral agents
Técnicas in vitro
In vitro techniques
Simulación por computador
Computer simulation
Lupeol
Epazote : Chenopodium ambrosioides
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D003716
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D000998
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D066298
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D003198
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia
id UDEA2_b5ccf5ca5fdbce21c07bf94e649a3243
oai_identifier_str oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/17026
network_acronym_str UDEA2
network_name_str Repositorio UdeA
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Evaluación in vitro del efecto virucida e interacciones in sílico del Lupeol contra los cuatro serotipos del virus Dengue
title Evaluación in vitro del efecto virucida e interacciones in sílico del Lupeol contra los cuatro serotipos del virus Dengue
spellingShingle Evaluación in vitro del efecto virucida e interacciones in sílico del Lupeol contra los cuatro serotipos del virus Dengue
Virus del dengue
Dengue virus
Antivirales
Antiviral agents
Técnicas in vitro
In vitro techniques
Simulación por computador
Computer simulation
Lupeol
Epazote : Chenopodium ambrosioides
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D003716
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D000998
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D066298
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D003198
title_short Evaluación in vitro del efecto virucida e interacciones in sílico del Lupeol contra los cuatro serotipos del virus Dengue
title_full Evaluación in vitro del efecto virucida e interacciones in sílico del Lupeol contra los cuatro serotipos del virus Dengue
title_fullStr Evaluación in vitro del efecto virucida e interacciones in sílico del Lupeol contra los cuatro serotipos del virus Dengue
title_full_unstemmed Evaluación in vitro del efecto virucida e interacciones in sílico del Lupeol contra los cuatro serotipos del virus Dengue
title_sort Evaluación in vitro del efecto virucida e interacciones in sílico del Lupeol contra los cuatro serotipos del virus Dengue
dc.creator.fl_str_mv Restrepo Méndez, Laura Cristina
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv Martínez Gutiérrez, Marlen
Zapata Cardona, María Isabel
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Restrepo Méndez, Laura Cristina
dc.subject.mesh.none.fl_str_mv Virus del dengue
Dengue virus
Antivirales
Antiviral agents
Técnicas in vitro
In vitro techniques
Simulación por computador
Computer simulation
topic Virus del dengue
Dengue virus
Antivirales
Antiviral agents
Técnicas in vitro
In vitro techniques
Simulación por computador
Computer simulation
Lupeol
Epazote : Chenopodium ambrosioides
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D003716
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D000998
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D066298
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D003198
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv Lupeol
Epazote : Chenopodium ambrosioides
dc.subject.meshuri.none.fl_str_mv http://id.nlm.nih.gov/mesh/D003716
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D000998
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D066298
http://id.nlm.nih.gov/mesh/D003198
description RESUMEN: Introducción: No se encuentra hasta el momento disponible una terapia antiviral o vacuna específica contra el virus del Dengue (DENV). Debido a esto y a la necesidad de continuar con la búsqueda de agentes antivirales contra este virus, el objetivo de este trabajo fue evaluar in vitro el efecto virucida e interacciones in silico del Lupeol, aislado de la planta de la Región Caribe colombiana Chenopodium ambrosioides, contra los cuatro serotipos del DENV. Metodología: Mediante la técnica de MTT se evaluó la viabilidad de células VERO en presencia de Lupeol (7,3- 233,6 uM). Se evaluó el efecto virucida del Lupeol contra DENV-1 a DENV-4 mediante el ensayo TRANS-tratamiento en células VERO, para lo cual se prepararon mezclas 1:1 de Lupeol (7,3 uM) y de cada serotipo de DENV (MOI:1). Se utilizó Heparina como control positivo de inhibición y la cepa DENV-2/16681 como cepa de control de inhibición del Lupeol. Finalmente, se recolectaron los sobrenadantes para cuantificar las partículas virales infecciosas y copias genómicas por ensayo de plaqueo y RT-qPCR , respectivamente. Para establecer diferencias nucleotídicas y aminoacídicas entre los serotipos de DENV utilizados en este estudio, se hizo secuenciación por Sanger para el gen que codifica para la proteína de Envoltura (E) y alineamiento de las secuencias por el método de Clustal W. Además, se evaluó la interacción del Lupeol con la proteína E de DENV 1-4 mediante docking molecular. Las diferencias estadísticas se identificaron usando t-Student o U de MannWhitney. Resultados: La viabilidad celular en VERO fue del 94,0 % a concentraciones de 7,3 µM del Lupeol. El porcentaje de infección en número de copias genómicas fue del 139,6% para DENV-1, 188,2% para DENV-2/16803, 15,6% para DENV-2/16681, 142,7 % para DENV-3 y DENV-4 126,5% respecto al control sin tratamiento. Por otra parte, el porcentaje de infección del número de partículas infecciosas fue del 91,3% para DENV-1, 16,2% para DENV-2/16803, 64,85 % para DENV-2/1668, del 64,8 % para DENV-3 y 35,0% para DENV-4 respecto al control de sobrenadantes de células VERO infectadas sin tratamiento. Se identificaron diferencias y sustituciones en la naturaleza de los aminoácidos que podrían estar relacionadas con el efecto antiviral del Lupeol diferencial para cada serotipo. En los resultados de Docking molecular se obtuvieron energías de unión favorables (-6,8 kcla/mol y 6,9 Kcal/mol) entre el Lupeol y la proteína E de los cuatro serotipos de DENV. Conclusiones: El efecto antiviral del Lupeol usando la estrategia de TRANS-tratamiento fue dependiente de la cepa y serotipo viral. Lupeol inhibió el número de partículas virales infecciosas de DENV-2/16803, DENV-3 y DENV-4.
publishDate 2020
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2020-10-21T17:04:34Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2020-10-21T17:04:34Z
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2020
dc.type.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversion.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/draft
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv https://purl.org/redcol/resource_type/TP
dc.type.local.spa.fl_str_mv Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
format http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
status_str draft
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10495/17026
url http://hdl.handle.net/10495/17026
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.*.fl_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia
dc.rights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons.spa.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.extent.spa.fl_str_mv 34
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.place.spa.fl_str_mv Medellín, Colombia
institution Universidad de Antioquia
bitstream.url.fl_str_mv http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/17026/3/RestrepoLaura_2020_VirucidalupeolDenv.pdf
http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/17026/4/license_rdf
http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/17026/5/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 8420c8d6529ff1e7121627ce10200e61
b88b088d9957e670ce3b3fbe2eedbc13
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad de Antioquia
repository.mail.fl_str_mv andres.perez@udea.edu.co
_version_ 1812173086696407040
spelling Martínez Gutiérrez, MarlenZapata Cardona, María IsabelRestrepo Méndez, Laura Cristina2020-10-21T17:04:34Z2020-10-21T17:04:34Z2020http://hdl.handle.net/10495/17026RESUMEN: Introducción: No se encuentra hasta el momento disponible una terapia antiviral o vacuna específica contra el virus del Dengue (DENV). Debido a esto y a la necesidad de continuar con la búsqueda de agentes antivirales contra este virus, el objetivo de este trabajo fue evaluar in vitro el efecto virucida e interacciones in silico del Lupeol, aislado de la planta de la Región Caribe colombiana Chenopodium ambrosioides, contra los cuatro serotipos del DENV. Metodología: Mediante la técnica de MTT se evaluó la viabilidad de células VERO en presencia de Lupeol (7,3- 233,6 uM). Se evaluó el efecto virucida del Lupeol contra DENV-1 a DENV-4 mediante el ensayo TRANS-tratamiento en células VERO, para lo cual se prepararon mezclas 1:1 de Lupeol (7,3 uM) y de cada serotipo de DENV (MOI:1). Se utilizó Heparina como control positivo de inhibición y la cepa DENV-2/16681 como cepa de control de inhibición del Lupeol. Finalmente, se recolectaron los sobrenadantes para cuantificar las partículas virales infecciosas y copias genómicas por ensayo de plaqueo y RT-qPCR , respectivamente. Para establecer diferencias nucleotídicas y aminoacídicas entre los serotipos de DENV utilizados en este estudio, se hizo secuenciación por Sanger para el gen que codifica para la proteína de Envoltura (E) y alineamiento de las secuencias por el método de Clustal W. Además, se evaluó la interacción del Lupeol con la proteína E de DENV 1-4 mediante docking molecular. Las diferencias estadísticas se identificaron usando t-Student o U de MannWhitney. Resultados: La viabilidad celular en VERO fue del 94,0 % a concentraciones de 7,3 µM del Lupeol. El porcentaje de infección en número de copias genómicas fue del 139,6% para DENV-1, 188,2% para DENV-2/16803, 15,6% para DENV-2/16681, 142,7 % para DENV-3 y DENV-4 126,5% respecto al control sin tratamiento. Por otra parte, el porcentaje de infección del número de partículas infecciosas fue del 91,3% para DENV-1, 16,2% para DENV-2/16803, 64,85 % para DENV-2/1668, del 64,8 % para DENV-3 y 35,0% para DENV-4 respecto al control de sobrenadantes de células VERO infectadas sin tratamiento. Se identificaron diferencias y sustituciones en la naturaleza de los aminoácidos que podrían estar relacionadas con el efecto antiviral del Lupeol diferencial para cada serotipo. En los resultados de Docking molecular se obtuvieron energías de unión favorables (-6,8 kcla/mol y 6,9 Kcal/mol) entre el Lupeol y la proteína E de los cuatro serotipos de DENV. Conclusiones: El efecto antiviral del Lupeol usando la estrategia de TRANS-tratamiento fue dependiente de la cepa y serotipo viral. Lupeol inhibió el número de partículas virales infecciosas de DENV-2/16803, DENV-3 y DENV-4.34application/pdfspainfo:eu-repo/semantics/draftinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttps://purl.org/redcol/resource_type/TPTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceAtribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombiainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Virus del dengueDengue virusAntiviralesAntiviral agentsTécnicas in vitroIn vitro techniquesSimulación por computadorComputer simulationLupeolEpazote : Chenopodium ambrosioideshttp://id.nlm.nih.gov/mesh/D003716http://id.nlm.nih.gov/mesh/D000998http://id.nlm.nih.gov/mesh/D066298http://id.nlm.nih.gov/mesh/D003198Evaluación in vitro del efecto virucida e interacciones in sílico del Lupeol contra los cuatro serotipos del virus DengueMedellín, ColombiaMicrobióloga y BioanálistaPregradoEscuela de Microbiología. Microbiología y BioanálisisUniversidad de AntioquiaORIGINALRestrepoLaura_2020_VirucidalupeolDenv.pdfRestrepoLaura_2020_VirucidalupeolDenv.pdfTrabajo de grado de pregradoapplication/pdf1747495http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/17026/3/RestrepoLaura_2020_VirucidalupeolDenv.pdf8420c8d6529ff1e7121627ce10200e61MD53CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8823http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/17026/4/license_rdfb88b088d9957e670ce3b3fbe2eedbc13MD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/17026/5/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD5510495/17026oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/170262021-06-12 11:33:45.875Repositorio Institucional Universidad de Antioquiaandres.perez@udea.edu.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