Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre

ABSTRACT: The PCR without extraction is a key tool in forensic investigation, being a good option when samples with small amounts or degraded DNA are available. The objective of this study was to compare genetic profiles obtained by PCR using: i) DNA samples extracted using Chelex® 100, ii) DNA samp...

Full description

Autores:
Villa Loiza, Mónica Marcela
Granda Agudelo, Juan David
Ibarra Rodríguez, Adriana Alexandra
Gusmão, Leonor
Tipo de recurso:
Article of investigation
Fecha de publicación:
2017
Institución:
Universidad de Antioquia
Repositorio:
Repositorio UdeA
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/11073
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10495/11073
Palabra clave:
Genética forense
Forensic genetics
PCR sin extracción
Extracción de ADN
Perfiles genéticos
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombia (CC BY-NC-SA 2.5 CO)
id UDEA2_b1c2807b3b983461319247539049779f
oai_identifier_str oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/11073
network_acronym_str UDEA2
network_name_str Repositorio UdeA
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre
dc.title.alternative.spa.fl_str_mv Variation of the genetic profiles obtained by PCR with and without DNA extraction from blood stain
title Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre
spellingShingle Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre
Genética forense
Forensic genetics
PCR sin extracción
Extracción de ADN
Perfiles genéticos
title_short Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre
title_full Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre
title_fullStr Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre
title_full_unstemmed Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre
title_sort Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre
dc.creator.fl_str_mv Villa Loiza, Mónica Marcela
Granda Agudelo, Juan David
Ibarra Rodríguez, Adriana Alexandra
Gusmão, Leonor
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Villa Loiza, Mónica Marcela
Granda Agudelo, Juan David
Ibarra Rodríguez, Adriana Alexandra
Gusmão, Leonor
dc.subject.lemb.none.fl_str_mv Genética forense
Forensic genetics
topic Genética forense
Forensic genetics
PCR sin extracción
Extracción de ADN
Perfiles genéticos
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv PCR sin extracción
Extracción de ADN
Perfiles genéticos
description ABSTRACT: The PCR without extraction is a key tool in forensic investigation, being a good option when samples with small amounts or degraded DNA are available. The objective of this study was to compare genetic profiles obtained by PCR using: i) DNA samples extracted using Chelex® 100, ii) DNA samples extracted using an FTA purification reagent, and iii) samples without extraction using the commercial kits AmpFLSTR® Identifiler®, routinely employed in the laboratory IdentiGEN of the University of Antioquia. Blood stains were collected in FTA cards Genecard WhatmanTM, chromatography paper, and in filter papers. PCR without extraction was performed using the buffers EzwayTM, PCRboostTM, STRboostTM, and Buffer 5X Colorless Go Taq® Flexi. The pro les were obtained by capillary electrophoresis. The results show that, using the above-mentioned buffers, all STR markers were amplified, for samples collected in the three different types of support. In conclusion, the PCR without extraction, apart from reducing the cost and time needed for processing the samples, it allows obtaining genetic pro les that meet the quality criteria established by the laboratory, in a more efficiently way, since DNA extraction and purification steps are eliminated. Key words: DNA extraction, forensic genetics, PCR without extraction.
publishDate 2017
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2017
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2019-05-20T17:02:05Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2019-05-20T17:02:05Z
dc.type.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.hasversion.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv https://purl.org/redcol/resource_type/ART
dc.type.local.spa.fl_str_mv Artículo de investigación
format http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.spa.fl_str_mv Villa MM, Granda JD, Ibarra AA, Gusmão L. 2017. Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre. Actual. Biol. 2017;39(106): 79-87. DOI: 10.17533/udea.acbi.v39n106a08
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 0304-3584
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10495/11073
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv 10.17533/udea.acbi.v39n106a08
dc.identifier.eissn.none.fl_str_mv 2145-7166
identifier_str_mv Villa MM, Granda JD, Ibarra AA, Gusmão L. 2017. Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre. Actual. Biol. 2017;39(106): 79-87. DOI: 10.17533/udea.acbi.v39n106a08
0304-3584
10.17533/udea.acbi.v39n106a08
2145-7166
url http://hdl.handle.net/10495/11073
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartofjournalabbrev.spa.fl_str_mv Actual. Biol.
dc.rights.*.fl_str_mv Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombia (CC BY-NC-SA 2.5 CO)
dc.rights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri.*.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons.spa.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombia (CC BY-NC-SA 2.5 CO)
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad de Antioquia, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Instituto de Biología
dc.publisher.place.spa.fl_str_mv Medellín, Colombia
institution Universidad de Antioquia
bitstream.url.fl_str_mv https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11073/1/VillaLoaizaMonica_2017_VariacionPerfilesGeneticos.pdf
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11073/2/license_url
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11073/3/license_text
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11073/4/license_rdf
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11073/5/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 7a9d3d87fcac7e146f7f37943404aba9
4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2f
d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e
d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad de Antioquia
repository.mail.fl_str_mv andres.perez@udea.edu.co
_version_ 1812173294739128320
spelling Villa Loiza, Mónica MarcelaGranda Agudelo, Juan DavidIbarra Rodríguez, Adriana AlexandraGusmão, Leonor2019-05-20T17:02:05Z2019-05-20T17:02:05Z2017Villa MM, Granda JD, Ibarra AA, Gusmão L. 2017. Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangre. Actual. Biol. 2017;39(106): 79-87. DOI: 10.17533/udea.acbi.v39n106a080304-3584http://hdl.handle.net/10495/1107310.17533/udea.acbi.v39n106a082145-7166ABSTRACT: The PCR without extraction is a key tool in forensic investigation, being a good option when samples with small amounts or degraded DNA are available. The objective of this study was to compare genetic profiles obtained by PCR using: i) DNA samples extracted using Chelex® 100, ii) DNA samples extracted using an FTA purification reagent, and iii) samples without extraction using the commercial kits AmpFLSTR® Identifiler®, routinely employed in the laboratory IdentiGEN of the University of Antioquia. Blood stains were collected in FTA cards Genecard WhatmanTM, chromatography paper, and in filter papers. PCR without extraction was performed using the buffers EzwayTM, PCRboostTM, STRboostTM, and Buffer 5X Colorless Go Taq® Flexi. The pro les were obtained by capillary electrophoresis. The results show that, using the above-mentioned buffers, all STR markers were amplified, for samples collected in the three different types of support. In conclusion, the PCR without extraction, apart from reducing the cost and time needed for processing the samples, it allows obtaining genetic pro les that meet the quality criteria established by the laboratory, in a more efficiently way, since DNA extraction and purification steps are eliminated. Key words: DNA extraction, forensic genetics, PCR without extraction.RESUMEN: La PCR sin extracción es una herramienta clave en investigaciones forenses, tratándose de una de las opciones a elegir cuando se tienen muestras con baja cantidad o calidad del ADN. El objetivo de este estudio fue determinar si hay diferencias entre los per les genéticos obtenidos por PCR i) en muestras de ADN extraídas con Chelex® 100, ii) en muestras de ADN obtenidas con el reactivo de purificación de muestras en tarjetas FTA, y iii) por la PCR muestras sin extracción, empleando el kit comercial AmpFLSTR® Identifiler®, utilizado de rutina en el laboratorio IdentiGEN de la Universidad de Antioquia. Manchas de sangre almacenadas en tarjetas FTATM Genecard WhatmanTM, papel de Cromatografía y papel filtro, se amplificaron por PCR sin extracción utilizando los buffers EzwayTM, PCRboostTM, STRboostTM y Buffer 5X Colorless Go Taq® Flexi. Los perfiles obtenidos se analizaron por medio de electroforesis capilar. Los resultados muestran que con los buffers utilizados se obtiene la amplificación de todos los marcadores STRs de las muestras almacenadas en los tres diferentes soportes. Esto permite concluir, que utilizando la PCR sin extracción, además de reducirse los costos y el tiempo de procesamiento de las muestras, se logra obtener per les genéticos que cumplan los criterios de calidad establecidos por el laboratorio, generando resultados de manera más eficiente al no ser necesario realizar la extracción y puri cación del ADN. Palabras clave: PCR sin extracción, extracción de ADN, genética forense.application/pdfspaUniversidad de Antioquia, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Instituto de BiologíaMedellín, Colombiainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1https://purl.org/redcol/resource_type/ARTArtículo de investigaciónhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombia (CC BY-NC-SA 2.5 CO)info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Variación de perfiles genéticos obtenidos por PCR con y sin extracción de ADN a partir de manchas de sangreVariation of the genetic profiles obtained by PCR with and without DNA extraction from blood stainGenética forenseForensic geneticsPCR sin extracciónExtracción de ADNPerfiles genéticosActual. Biol.Actualidades Biológicas798739106ORIGINALVillaLoaizaMonica_2017_VariacionPerfilesGeneticos.pdfVillaLoaizaMonica_2017_VariacionPerfilesGeneticos.pdfArtículo de investigaciónapplication/pdf2996617https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11073/1/VillaLoaizaMonica_2017_VariacionPerfilesGeneticos.pdf7a9d3d87fcac7e146f7f37943404aba9MD51CC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11073/2/license_url4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52license_textlicense_texttext/html; charset=utf-80https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11073/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53license_rdflicense_rdfLicenciaapplication/rdf+xml; charset=utf-80https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11073/4/license_rdfd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11073/5/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD5510495/11073oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/110732023-09-14 11:30:16.815Repositorio Institucional Universidad de Antioquiaandres.perez@udea.edu.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

Publicaciones similares