Desarrollo e implementación de protocolo para la reconstrucción de imágenes por tractografía.

RESUMEN : La tractografía es un método usado en neurociencia para determinar la morfología de los tractos neurales, comúnmente se usa para el diagnóstico de ciertas patologías que pueden afectar estas estructuras, como por ejemplo los tumores, malformaciones arteriovenosas, entre otras. Este método...

Full description

Autores:
Muñoz Cabrera, Carlos José
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2022
Institución:
Universidad de Antioquia
Repositorio:
Repositorio UdeA
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/25836
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10495/25836
Palabra clave:
Imagen por Resonancia Magnética
Magnetic Resonance Imaging
Neurociencias
Neurosciences
Diagnóstico por imagen
Diagnostic imaging
Patología
Pathology
Vías Nerviosas
Neural Pathways
Instrumentación
Instrumentation
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Neurosciences
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description RESUMEN : La tractografía es un método usado en neurociencia para determinar la morfología de los tractos neurales, comúnmente se usa para el diagnóstico de ciertas patologías que pueden afectar estas estructuras, como por ejemplo los tumores, malformaciones arteriovenosas, entre otras. Este método se basa en el análisis de imágenes con tensor de difusión, en el cual se obtiene información de la difusividad que presenta el agua en las estructuras cerebrales; las imágenes de tensor de difusión se obtienen por resonancia magnética y exigen un debido procesamiento de imágenes con el fin de buscar una buena reconstrucción de los tractos neurales. En este estudio se buscó desarrollar e implementar un método que permita procesar los datos del tensor de difusión y hacer una reconstrucción de tractos neurales basándose en la documentación encontrada. Se hizo comparaciones con los resultados obtenidos en dos diferentes softwares que a su vez hacen uso de herramientas de preprocesamiento encontrando la mejor herramienta para tal fin. Se encontró que el software MRTrix 3 presenta una completa línea de preprocesamiento y permite encontrar los tractos de interés de diferentes maneras, de esta manera se obtienen resultados más precisos que pueden ser usados en el diagnóstico en un entorno clínico.
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En este estudio se buscó desarrollar e implementar un método que permita procesar los datos del tensor de difusión y hacer una reconstrucción de tractos neurales basándose en la documentación encontrada. Se hizo comparaciones con los resultados obtenidos en dos diferentes softwares que a su vez hacen uso de herramientas de preprocesamiento encontrando la mejor herramienta para tal fin. Se encontró que el software MRTrix 3 presenta una completa línea de preprocesamiento y permite encontrar los tractos de interés de diferentes maneras, de esta manera se obtienen resultados más precisos que pueden ser usados en el diagnóstico en un entorno clínico.ABSTRACT : Tractography is a method used in neuroscience to determine the morphology of neural tracts, it is commonly used for the diagnosis of certain pathologies that can affect these structures, such as tumors, arteriovenous malformations, among others. This method is based on the analysis of diffusion tensor images, in which information is obtained on the diffusivity that water presents in brain structures; Diffusion tensor images are obtained using magnetic resonance imaging and require adequate image processing to look for good reconstruction of the neural tracts. This study sought to develop and implement a method that allows processing diffusion tensor data and reconstructing neural tracts from the documentation found. Comparisons were made with the results obtained in two different softwares that in turn make use of preprocessing tools, finding the best tool for this purpose. It was found that the MRTrix 3 software presents a complete line of preprocessing and allows finding the tracts of interest in different ways, thus obtaining more precise results that can be used in diagnosis in a clinical setting.60application/pdfspainfo:eu-repo/semantics/draftinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttps://purl.org/redcol/resource_type/TPTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Desarrollo e implementación de protocolo para la reconstrucción de imágenes por tractografía.MedellínImagen por Resonancia MagnéticaMagnetic Resonance ImagingNeurocienciasNeurosciencesDiagnóstico por imagenDiagnostic imagingPatologíaPathologyVías NerviosasNeural PathwaysInstrumentaciónInstrumentationhttps://docs.google.com/document/d/1kl3c_AbLbyYXcaB2_DaoJOz6d87-d_0VRqYgMkJujVA/edit?usp=sharingBioingenieroPregradoFacultad de Ingeniería. BioingenieríaUniversidad de AntioquiaORIGINALMunozCarlos_2022_ProtocoloReconstruccionTractografia.pdfMunozCarlos_2022_ProtocoloReconstruccionTractografia.pdfTrabajo de grado de pregradoapplication/pdf2205120http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/25836/1/MunozCarlos_2022_ProtocoloReconstruccionTractografia.pdf9414699600168212d43f3dbbf796f2bdMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/25836/3/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD53CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81051http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/25836/2/license_rdfe2060682c9c70d4d30c83c51448f4eedMD5210495/25836oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/258362022-02-07 12:13:11.104Repositorio Institucional Universidad de Antioquiaandres.perez@udea.edu.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