Presence of Bovine Leukemia Virus Genotypes 1 and 3 in Antioquia, Colombia

RESUMEN: El virus de la leucosis bovina (BLV) es un retrovirus inmuno- supresor que afecta, principalmente, al ganado lechero; sus células diana son los linfocitos B, en los cuales, integra su genoma, infectando al ganado de por vida. Es importante identificar la distribución del BLV en la región y...

Full description

Autores:
Díaz Castrillón, Francisco Javier
Úsuga Monroy, Cristina
Echeverri Zuluaga, José Julián
González Herrera, Luis Gabriel
López Herrera, Albeiro
Tipo de recurso:
Article of investigation
Fecha de publicación:
2018
Institución:
Universidad de Antioquia
Repositorio:
Repositorio UdeA
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/27904
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10495/27904
https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/view/670
Palabra clave:
Leukemia Virus, Bovine
Virus de la Leucemia Bovina
Genes, env
Genes env
Genotype
Genotipo
Phylogeny
Filogenia
Rights
openAccess
License
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/co/
id UDEA2_44b0ca55cf9b824b03ef7b66f57c82d6
oai_identifier_str oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/27904
network_acronym_str UDEA2
network_name_str Repositorio UdeA
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Presence of Bovine Leukemia Virus Genotypes 1 and 3 in Antioquia, Colombia
dc.title.alternative.spa.fl_str_mv Presencia de los genotipos 1 y 3 del virus de la leucosis bovina en Antioquia, Colombia
title Presence of Bovine Leukemia Virus Genotypes 1 and 3 in Antioquia, Colombia
spellingShingle Presence of Bovine Leukemia Virus Genotypes 1 and 3 in Antioquia, Colombia
Leukemia Virus, Bovine
Virus de la Leucemia Bovina
Genes, env
Genes env
Genotype
Genotipo
Phylogeny
Filogenia
title_short Presence of Bovine Leukemia Virus Genotypes 1 and 3 in Antioquia, Colombia
title_full Presence of Bovine Leukemia Virus Genotypes 1 and 3 in Antioquia, Colombia
title_fullStr Presence of Bovine Leukemia Virus Genotypes 1 and 3 in Antioquia, Colombia
title_full_unstemmed Presence of Bovine Leukemia Virus Genotypes 1 and 3 in Antioquia, Colombia
title_sort Presence of Bovine Leukemia Virus Genotypes 1 and 3 in Antioquia, Colombia
dc.creator.fl_str_mv Díaz Castrillón, Francisco Javier
Úsuga Monroy, Cristina
Echeverri Zuluaga, José Julián
González Herrera, Luis Gabriel
López Herrera, Albeiro
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Díaz Castrillón, Francisco Javier
Úsuga Monroy, Cristina
Echeverri Zuluaga, José Julián
González Herrera, Luis Gabriel
López Herrera, Albeiro
dc.subject.decs.none.fl_str_mv Leukemia Virus, Bovine
Virus de la Leucemia Bovina
Genes, env
Genes env
Genotype
Genotipo
Phylogeny
Filogenia
topic Leukemia Virus, Bovine
Virus de la Leucemia Bovina
Genes, env
Genes env
Genotype
Genotipo
Phylogeny
Filogenia
description RESUMEN: El virus de la leucosis bovina (BLV) es un retrovirus inmuno- supresor que afecta, principalmente, al ganado lechero; sus células diana son los linfocitos B, en los cuales, integra su genoma, infectando al ganado de por vida. Es importante identificar la distribución del BLV en la región y reconstruir su historia evolutiva, a través de árboles filogenéticos; para el departamento de Antioquia, este es el primer reporte de los genotipos del BLV . El objetivo de este estudio fue identificar el genotipo de BLV que circula en ganado lechero de diferentes regiones del departamento de Antioquia, Colombia . Se extrajo ADN de 8 vacas Holstein . Se realizó una PCR anidada, para amplificar un fragmento del gen env de 444 pb . El gen env viral codifica la proteína de superficie gp51, altamente conservado y es usado en análisis filogenéticos . Los amplicones obtenidos se secuenciaron, se alinearon manualmente en el programa MEGA V7 y se compararon con 53 secuencias del gen env viral, registradas en GenBank . El análisis filogenético, se realizó por métodos de Máxima Verosimilitud y Bayesianos . Se encontraron dos genotipos circulantes: el genotipo más común fue 1, hallado en siete muestras, agrupadas con secuencias de EE . UU, Argentina y Japón; solo una muestra se clasificó como genotipo 3 y se agrupó con muestras de EE . UU y Japón . Al menos dos genotipos (1 y 3) de BLV están circulando en Antioquia; sin embargo, se deben evaluar más bovinos y hatos para elucidar la diversidad y la distribución de BLV en Colombia
publishDate 2018
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2018
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2022-04-27T14:13:22Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2022-04-27T14:13:22Z
dc.type.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.hasversion.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv https://purl.org/redcol/resource_type/ART
dc.type.local.spa.fl_str_mv Artículo de investigación
format http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.spa.fl_str_mv Úsuga Monroy C, Díaz F, Echeverri Zuluaga JJ., González Herrera LG., López Herrera A. (2018). Presencia de los genotipos 1 y 3 del virus de la leucosis bovina en Antioquia, Colombia. Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica, 21(1), 119–126. https://doi.org/10.31910/rudca.v21.n1.2018.670
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 0123-4226
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10495/27904
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv 10.31910/rudca.v21.n1.2018.670
dc.identifier.eissn.none.fl_str_mv 2619-2551
dc.identifier.url.spa.fl_str_mv https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/view/670
identifier_str_mv Úsuga Monroy C, Díaz F, Echeverri Zuluaga JJ., González Herrera LG., López Herrera A. (2018). Presencia de los genotipos 1 y 3 del virus de la leucosis bovina en Antioquia, Colombia. Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica, 21(1), 119–126. https://doi.org/10.31910/rudca.v21.n1.2018.670
0123-4226
10.31910/rudca.v21.n1.2018.670
2619-2551
url http://hdl.handle.net/10495/27904
https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/view/670
dc.language.iso.spa.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.ispartofjournalabbrev.spa.fl_str_mv Rev. UDCA Actual. Divulg. Cient.
dc.rights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/co/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons.spa.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/co/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.format.extent.spa.fl_str_mv 8
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales UDCA
dc.publisher.group.spa.fl_str_mv Inmunovirología
dc.publisher.place.spa.fl_str_mv Bogotá, Colombia
institution Universidad de Antioquia
bitstream.url.fl_str_mv http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/27904/1/DiazFrancisco_2018_GenotypePhylogeneticAnalysis.pdf
http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/27904/2/license_rdf
http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/27904/3/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv b246faff22f877f044f72a19a7ec3453
c0c92b0ffc8b7d22d9cf56754a416a76
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad de Antioquia
repository.mail.fl_str_mv andres.perez@udea.edu.co
_version_ 1812173229541818368
spelling Díaz Castrillón, Francisco JavierÚsuga Monroy, CristinaEcheverri Zuluaga, José JuliánGonzález Herrera, Luis GabrielLópez Herrera, Albeiro2022-04-27T14:13:22Z2022-04-27T14:13:22Z2018Úsuga Monroy C, Díaz F, Echeverri Zuluaga JJ., González Herrera LG., López Herrera A. (2018). Presencia de los genotipos 1 y 3 del virus de la leucosis bovina en Antioquia, Colombia. Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica, 21(1), 119–126. https://doi.org/10.31910/rudca.v21.n1.2018.6700123-4226http://hdl.handle.net/10495/2790410.31910/rudca.v21.n1.2018.6702619-2551https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/view/670RESUMEN: El virus de la leucosis bovina (BLV) es un retrovirus inmuno- supresor que afecta, principalmente, al ganado lechero; sus células diana son los linfocitos B, en los cuales, integra su genoma, infectando al ganado de por vida. Es importante identificar la distribución del BLV en la región y reconstruir su historia evolutiva, a través de árboles filogenéticos; para el departamento de Antioquia, este es el primer reporte de los genotipos del BLV . El objetivo de este estudio fue identificar el genotipo de BLV que circula en ganado lechero de diferentes regiones del departamento de Antioquia, Colombia . Se extrajo ADN de 8 vacas Holstein . Se realizó una PCR anidada, para amplificar un fragmento del gen env de 444 pb . El gen env viral codifica la proteína de superficie gp51, altamente conservado y es usado en análisis filogenéticos . Los amplicones obtenidos se secuenciaron, se alinearon manualmente en el programa MEGA V7 y se compararon con 53 secuencias del gen env viral, registradas en GenBank . El análisis filogenético, se realizó por métodos de Máxima Verosimilitud y Bayesianos . Se encontraron dos genotipos circulantes: el genotipo más común fue 1, hallado en siete muestras, agrupadas con secuencias de EE . UU, Argentina y Japón; solo una muestra se clasificó como genotipo 3 y se agrupó con muestras de EE . UU y Japón . Al menos dos genotipos (1 y 3) de BLV están circulando en Antioquia; sin embargo, se deben evaluar más bovinos y hatos para elucidar la diversidad y la distribución de BLV en ColombiaABSTRACT: Bovine leukemia virus (BLV) is an immunosuppressant retrovirus that primarily affects dairy livestock, its target cells are B lymphocytes in which it integrates its genome infecting cattle for life . It is important to identify the distribution of the BLV in the region and to reconstruct its evolutionary history through phylogenetic trees, for the province of Antioquia this is the first report of the BLV genotypes . The aim of this study was to identify the genotype of BLV circulating in dairy cattle of different regions of the province of Antioquia, Colombia . DNA was extracted from 8 Holstein cows . Nested PCR was performed to amplify a fragment of 444 pb of the env gene . The env viral gene codes for surface protein gp51, gene is highly conserved and it is used for phylogenetic analysis . Obtained amplicons were sequenced, manually aligned in MEGA V7 program, and compared to 53 viral env gene sequences registered in GenBank . Phylogenetic analysis was performed by Maximum Likelihood and Bayesian methods . Two circulating genotypes were found: the most common genotype was 1, found in seven samples; they grouped with sequences from EE . UU, Argentina and Japan; only one sample was classified as genotype 3 and was grouped with samples from EE . UU and Japan . At least two genotypes (1 and 3) of BLV are circulating in Antioquia; however, more cattle and herds should be evaluated to elucidate the diversity and distribution of BLV in Colombia00124448application/pdfengUniversidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales UDCAInmunovirologíaBogotá, Colombiainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1https://purl.org/redcol/resource_type/ARTArtículo de investigaciónhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Presence of Bovine Leukemia Virus Genotypes 1 and 3 in Antioquia, ColombiaPresencia de los genotipos 1 y 3 del virus de la leucosis bovina en Antioquia, ColombiaLeukemia Virus, BovineVirus de la Leucemia BovinaGenes, envGenes envGenotypeGenotipoPhylogenyFilogeniaRev. UDCA Actual. Divulg. Cient.Revista U.D.C.A. Actualidad & Divulgación Científica119126211ORIGINALDiazFrancisco_2018_GenotypePhylogeneticAnalysis.pdfDiazFrancisco_2018_GenotypePhylogeneticAnalysis.pdfArtículo de investigaciónapplication/pdf2471444http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/27904/1/DiazFrancisco_2018_GenotypePhylogeneticAnalysis.pdfb246faff22f877f044f72a19a7ec3453MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8933http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/27904/2/license_rdfc0c92b0ffc8b7d22d9cf56754a416a76MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/27904/3/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD5310495/27904oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/279042022-04-27 09:13:22.579Repositorio Institucional Universidad de Antioquiaandres.perez@udea.edu.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