El núcleo genómico común de cepas de Ralstonia solanacearum y su relación con la patogénesis en plantas

RESUMEN: La bacteria R. solanacearum comprende un complejo de especies con una gama muy amplia de cepas que varían en sus orígenes geográficos, rangos de hospedadores y determinantes de patogenicidad y es considerada como uno de los fitopatógenos con un efecto más devastador en la producción agrícola a nivel mundial. Durante la interacción Ralstonia solanacearum-hospedero vegetal, se ha demostrado que varios rasgos genéticos y fenotípicos contribuyen a la patogenicidad y virulencia de las cepas de R. solanacearum. Mediante el uso de datos de transcriptoma de diferentes cepas obtenidos durante el proceso de infección de sus respectivos hospedadores vegetales, se identificaron las funciones del núcleo común de genes diferencialmente expresados entre las cepas de R. solanacearum UW163, IBSBF1503 y UY031. A través del uso de herramientas bioinformáticas que permiten predecir el potencial codificante y sus posibles funciones, se analizaron los genes pertenecientes al núcleo común identificado en el proceso de patogénesis, y se encontraron diferencialmente expresadas funciones relacionadas con procesos de transporte y metabolismo de azúcares, detoxificación de compuestos celulares nocivos como algunos compuestos nítricos, entre otros. Se discuten las probables funciones del núcleo común de genes entre las cepas de R. solanacearum UW163, IBSBF1503 y UY031 en el contexto de un posible mecanismo común de infección entre estas diferentes cepas que pueda ser empleado para futuros estudios de control biológico de este patógeno.

• Autores: Saldarriaga Buriticá, Stiven
• Tipo de recurso: Trabajo de grado de pregrado
• Fecha de publicación: 2020
• Institución: Universidad de Antioquia
• Repositorio: Repositorio UdeA
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/18086
• Acceso en línea: http://hdl.handle.net/10495/18086
• Palabra clave: Bioinformática; Bioinformatics; ARN; RNA; Ácidos nucléicos; Nucleic acids; Interacción; Patogénesis; http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6618; http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5253
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