Análisis in silico de los genes del operón virB de Brucella canis aisladas de caninos de criaderos en el área metropolitana del Valle de Aburrá (Antioquia, Colombia)
ABSTRACT: Canine brucellosis is a zoonotic disease caused by Brucella canis. The establishment of intracellular replicative niches of B. canis is mediated by proteins secreted by the type IV secretion system, which is encoded by the virB operon. The characterization of such genes has been conducted...
- Autores:
-
de la Cuesta Zuluaga, Juan Jacobo
Guarín Moreno, Natalia Andrea
Sánchez Jiménez, Miryan Margot
Olivera Ángel, Martha
- Tipo de recurso:
- Article of investigation
- Fecha de publicación:
- 2013
- Institución:
- Universidad de Antioquia
- Repositorio:
- Repositorio UdeA
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/11064
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10495/11064
- Palabra clave:
- Brucella canis
Brucelosis
Brucellosis
Genes bacterianos
Bacterial genes
Factores de virulencia
Virulence factors
Zoonosis
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ABSTRACT: Canine brucellosis is a zoonotic disease caused by Brucella canis. The establishment of intracellular replicative niches of B. canis is mediated by proteins secreted by the type IV secretion system, which is encoded by the virB operon. The characterization of such genes has been conducted in other species of the genus, but few in B. canis. We report the evaluation of the nucleotide sequences of the virB genes in seven isolates obtained from kennels in the metropolitan area of Aburrá Valley in Antioquia, Colombia. Sequences were obtained from a previous study and were compared with publicly available sequences from other Brucella strains using multiple alignment analysis and phylogenetic methods. All sequences of the native isolates tested were different from one another, even those belonging to the same kennel, which may indicate the presence of multiple bacterial clones circulating in the studied area or variations in the bacteria intra host. Key words: Brucella canis, canine brucellosis, virulence factors, bacterial genes, zoonosis. |
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We report the evaluation of the nucleotide sequences of the virB genes in seven isolates obtained from kennels in the metropolitan area of Aburrá Valley in Antioquia, Colombia. Sequences were obtained from a previous study and were compared with publicly available sequences from other Brucella strains using multiple alignment analysis and phylogenetic methods. All sequences of the native isolates tested were different from one another, even those belonging to the same kennel, which may indicate the presence of multiple bacterial clones circulating in the studied area or variations in the bacteria intra host. Key words: Brucella canis, canine brucellosis, virulence factors, bacterial genes, zoonosis.RESUMEN: La brucelosis canina es una enfermedad zoonótica causada por Brucella canis. El establecimiento del nicho replicativo de la bacteria es mediado por proteínas secretadas mediante el sistema de secreción tipo IV, el cual es codificado por el operón virB. La caracterización de dichos genes ha sido evaluada en otras especies del género, pero pocos estudios han sido llevados a cabo en B. canis. Se reporta la evaluación de las secuencias nucleotídicas de los genes virB en siete aislamientos obtenidos de criaderos en el área metropolitana del Valle de Aburrá, en Antioquia, Colombia. Las secuencias fueron obtenidas de un estudio previo y fueron comparadas con secuencias de otras especies de Brucella disponibles públicamente, mediante análisis de alineamientos múltiples y métodos filogenéticos. Todas las secuencias de los aislamientos nativos evaluados fueron diferentes entre sí, incluso aquellas pertenecientes a un mismo criadero, lo que puede indicar la presencia de múltiples clones bacterianos circulando en el medio de estudio o variaciones de la bacteria intra hospedero. Palabras claves: Brucella canis, brucelosis canina, factores de virulencia, genes bacterianos, zoonosis.application/pdfspaUniversidad de Antioquia, Escuela de MicrobiologíaGrupo VericelMedellín, Colombiainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1https://purl.org/redcol/resource_type/ARTArtículo de investigaciónhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Atribución 2.5 Colombia (CC BY 2.5 CO)info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/Brucella canisBrucelosisBrucellosisGenes bacterianosBacterial genesFactores de virulenciaVirulence factorsZoonosisZoonosesAnálisis in silico de los genes del operón virB de Brucella canis aisladas de caninos de criaderos en el área metropolitana del Valle de Aburrá (Antioquia, Colombia)In silico analysis of virB operon genes in Brucella canis isolated from canine kennels in the metropolitan area of the Aburrá Valley (Antioquia, Colombia)Hechos Microbiol.Hechos Microbiológicos849042ORIGINALDelaCuestaJuan_2013_AnalisisGenesCaninos.pdfDelaCuestaJuan_2013_AnalisisGenesCaninos.pdfArtículo de investigaciónapplication/pdf292865http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11064/1/DelaCuestaJuan_2013_AnalisisGenesCaninos.pdf5eba5a339fbeeeb629b2787579a5db19MD51CC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11064/2/license_url4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52license_textlicense_texttext/html; charset=utf-80http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11064/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53license_rdflicense_rdfLicenciaapplication/rdf+xml; charset=utf-80http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11064/4/license_rdfd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstream/10495/11064/5/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD5510495/11064oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/110642021-05-16 11:48:38.066Repositorio Institucional Universidad de Antioquiaandres.perez@udea.edu.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 |