Acoplamiento molecular: una herramienta computacional para el estudio de complejos quimioterapéuticos anticancerosos basados en paladio (II)
El acoplamiento molecular ha tomado gran relevancia en investigaciones farmacológicas de complejos metálicos con capacidad anticancerosa. Tal es el caso para los compuestos metálicos de paladio (II) que han demostrado tener características similares a las del cisplatino y, por ende, resultados prome...
- Autores:
-
Arrieta Galindo, José David
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2020
- Institución:
- Universidad de Córdoba
- Repositorio:
- Repositorio Institucional Unicórdoba
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unicordoba.edu.co:ucordoba/6146
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/6146
- Palabra clave:
- Acoplamiento molecular
Funciones de puntuación
Algoritmos de búsqueda
Complejos de paladio (II).
Molecular docking
Scoring functions
Search algorithms
Palladium (II) complexes
- Rights
- openAccess
- License
- Copyright Universidad de Córdoba, 2022
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El acoplamiento molecular ha tomado gran relevancia en investigaciones farmacológicas de complejos metálicos con capacidad anticancerosa. Tal es el caso para los compuestos metálicos de paladio (II) que han demostrado tener características similares a las del cisplatino y, por ende, resultados prometedores en investigaciones contra el cáncer. De acuerdo con esto, en esta revisión se estudió la funcionalidad del acoplamiento molecular en el diseño de complejos de paladio (II) con actividades citotóxicas prometedoras. Pudiendo establecer ventajas al compararlos con resto de los complejos estudiados. También, se dieron a conocer las bases teóricas del acoplamiento molecular in silico. En el que analizamos algoritmos de búsqueda, funciones de puntuación, paquetes computacionales de cálculo, etc. Lo anterior implicó una búsqueda exhaustiva en la literatura científica de toda la información referente a esta herramienta computacional, encontrando estudios teóricos-experimentales de una amplia variedad de compuestos de paladio, donde un complejo dinuclear, mostro un comportamiento farmacológico sobresaliente, con mejores afinidades de unión frente a los demás, con datos de acoplamiento y experimentales que lo respaldan. Al final, se pudo concluir que la elección del ligando es de gran importancia, ya que, sus características intrínsecas, les confieren estabilidad a los complejos sintetizados, como en el caso del complejo trinuclear sintetizado por Karami y colaboradores. |
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López Ochoa, Jesús Manuelf5fea2f7-922e-4b47-a8c3-350e059aaee2-1Arrieta Galindo, José Davidd3e2da6d-cc12-4e6d-9c8f-493ecd40986c-12022-07-19T16:19:21Z2022-07-19T16:19:21Z2020-07-18https://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/6146El acoplamiento molecular ha tomado gran relevancia en investigaciones farmacológicas de complejos metálicos con capacidad anticancerosa. Tal es el caso para los compuestos metálicos de paladio (II) que han demostrado tener características similares a las del cisplatino y, por ende, resultados prometedores en investigaciones contra el cáncer. De acuerdo con esto, en esta revisión se estudió la funcionalidad del acoplamiento molecular en el diseño de complejos de paladio (II) con actividades citotóxicas prometedoras. Pudiendo establecer ventajas al compararlos con resto de los complejos estudiados. También, se dieron a conocer las bases teóricas del acoplamiento molecular in silico. En el que analizamos algoritmos de búsqueda, funciones de puntuación, paquetes computacionales de cálculo, etc. Lo anterior implicó una búsqueda exhaustiva en la literatura científica de toda la información referente a esta herramienta computacional, encontrando estudios teóricos-experimentales de una amplia variedad de compuestos de paladio, donde un complejo dinuclear, mostro un comportamiento farmacológico sobresaliente, con mejores afinidades de unión frente a los demás, con datos de acoplamiento y experimentales que lo respaldan. Al final, se pudo concluir que la elección del ligando es de gran importancia, ya que, sus características intrínsecas, les confieren estabilidad a los complejos sintetizados, como en el caso del complejo trinuclear sintetizado por Karami y colaboradores.LISTA DE FIGURAS .......................................................................................................... 1LISTA DE TABLAS ............................................................................................................ 2RESUMEN ...................................................................................................................... 3ABSTRACT ...................................................................................................................... 4INTRODUCCIÓN ............................................................................................................. 5OBJETIVOS ..................................................................................................................... 7CAPITULO I: ACOPLAMIENTO MOLECULAR ................................................................. 81.1 Generalidades.................................................................................................................................. 81.2 Definición ........................................................................................................................................ 81.3 Tipos de Acoplamiento Molecular .................................................................................................... 91.3.1 Acoplamiento rígido .................................................................................................................. 101.3.2 Acoplamiento flexible ............................................................................................................... 111.4 Algoritmos de Búsqueda. ............................................................................................................... 121.4.1 Emparejamiento rápido de forma (SM) ..................................................................................... 131.4.2 Construcción Incremental (IC) ................................................................................................... 131.4.3 Simulación de Monte Carlo (MC)............................................................................................... 141.4.4 algoritmo genético (GA) ............................................................................................................ 151.5 Funciones de Puntuación ............................................................................................................... 151.5.1 Funciones de puntuación basadas en la física ........................................................................... 171.5.2 Funciones de puntuación empíricas .......................................................................................... 181.5.3 Funciones de puntuación basadas en conocimientos. ............................................................... 181.6 Software para Acoplamiento Molecular ......................................................................................... 191.7 Limitaciones .................................................................................................................................. 21CAPITULO II: COMPLEJOS METÁLICOS CON ACTIVIDAD ANTICANCEROSA ............... 232.1 Generalidades................................................................................................................................ 232.2 Complejos de Platino. .................................................................................................................... 232.3 Complejos de Rutenio (II). .............................................................................................................. 282.4 Complejo de Oro (III). ..................................................................................................................... 312.4.1 Complejos N-C. ......................................................................................................................... 312.5 Complejos de Cobre. ...................................................................................................................... 352.5.1 Generalidades. .......................................................................................................................... 352.5.2 Sistemas -N, S de Tiosemicarbazonas (TSCs). ........................................................................ 362.5.3 Sistemas -N, O, S. ................................................................................................................. 372.5.5 Complejos de cobre como inhibidores del proteosoma ............................................................. 39CAPITULO III: ACOPLAMIENTO MOLECULAR DE COMPLEJOS DE PALADIO ............... 413.1 Generalidades................................................................................................................................ 413.2 Complejos de paladio con ligandos de nitrógeno (N) ...................................................................... 423.3 Complejos de paladio con ligando de oxígeno (O) .......................................................................... 453.4 Complejos de paladio di y trinucleares ........................................................................................... 47CONCLUSIONES ............................................................................................................ 53REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS .................................................................................... 55PregradoQuímico(a)Monografíasapplication/pdfspaUniversidad de CórdobaFacultad de Ciencias BásicasMontería, Córdoba, ColombiaQuímicaCopyright Universidad de Córdoba, 2022https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Acoplamiento molecular: una herramienta computacional para el estudio de complejos quimioterapéuticos anticancerosos basados en paladio (II)Trabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttps://purl.org/redcol/resource_type/TPhttp://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32Acoplamiento molecularFunciones de puntuaciónAlgoritmos de búsquedaComplejos de paladio (II).Molecular dockingScoring functionsSearch algorithmsPalladium (II) complexesChaudhary KK, Mishra N. 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