Caracterización molecular de bacterias gram positivas del banco de cepas de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca
Actualmente en el cepario la caracterización de las bacterias Gram positivas, se ha llevado a cabo solo por pruebas bioquímicas y microbiológicas, por lo cual el objetivo de este proyecto fue caracterizar a nivel molecular las bacterias Gram positivas del banco de cepas de la Universidad Colegio May...
- Autores:
-
Mendez Dimate, Yury Hasbleidy
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Colegio Mayor de Cundinamarca
- Repositorio:
- Repositorio Colegio Mayor de Cundinamarca
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unicolmayor.edu.co:unicolmayor/3641
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unicolmayor.edu.co/handle/unicolmayor/3641
- Palabra clave:
- Bacterias
Pruebas Bioquímicas
Banco de cepas
DNA
Cepario
Bacterias Gram positivas
Fenotipificación
Secuenciación
ADN
PCR
Electroforesis
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- closedAccess
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- Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2018
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Actualmente en el cepario la caracterización de las bacterias Gram positivas, se ha llevado a cabo solo por pruebas bioquímicas y microbiológicas, por lo cual el objetivo de este proyecto fue caracterizar a nivel molecular las bacterias Gram positivas del banco de cepas de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, utilizando técnicas moleculares. La metodología incluyó la evaluación de las características fenotípicas de las cepas Gram positivas, e identificación bioquímica. Se obtuvo ADN total con el kit “QUICKDNATM Universal Kit – DE ZYMO RESEARCH” Fluidos biológicos y protocolo celular. La amplificación con PCR del producto se evaluó por electroforesis en gel de agarosa 2% con buffer TAE 1X. Los productos obtenidos fueron secuenciados con los primers 16S-8F y 16S-1492R. Los resultados se editaron en el programa Chromas 2.6.5, y se compararon con las que se encuentran en las bases de datos del GenBank del NCBI (USA) con un porcentaje de identidad igual o mayor al 97%. A partir de los resultados se identificaron 7 bacterias Gram positivas, que concuerdan con los datos fenotípicos del cepario y 3 bacterias que presentaron resultados erráticos (<60pb). Con base a los resultados obtenidos, el presente proyecto fortalece el Banco de cepas de la UCMC, posibilitando la participación en diferentes investigaciones u otros escenarios, incidiendo en el reconocimiento de otras universidades e instituciones, con el fin de generar espacios para consolidarla económicamente. Con estos resultados se pretende, registrar las cepas caracterizadas ante el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos “Alexander von Humboldt”. |
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Consuelo Sánchez, Ligia Consueloaeac5716f3effdc192b4cb0b846b7417600Mendez Dimate, Yury Hasbleidyd5446e57498b809e7db2b0844c808344600Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca2021-11-10T21:16:47Z2021-11-10T21:16:47Z2018-11https://repositorio.unicolmayor.edu.co/handle/unicolmayor/3641Actualmente en el cepario la caracterización de las bacterias Gram positivas, se ha llevado a cabo solo por pruebas bioquímicas y microbiológicas, por lo cual el objetivo de este proyecto fue caracterizar a nivel molecular las bacterias Gram positivas del banco de cepas de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, utilizando técnicas moleculares. La metodología incluyó la evaluación de las características fenotípicas de las cepas Gram positivas, e identificación bioquímica. Se obtuvo ADN total con el kit “QUICKDNATM Universal Kit – DE ZYMO RESEARCH” Fluidos biológicos y protocolo celular. La amplificación con PCR del producto se evaluó por electroforesis en gel de agarosa 2% con buffer TAE 1X. Los productos obtenidos fueron secuenciados con los primers 16S-8F y 16S-1492R. Los resultados se editaron en el programa Chromas 2.6.5, y se compararon con las que se encuentran en las bases de datos del GenBank del NCBI (USA) con un porcentaje de identidad igual o mayor al 97%. A partir de los resultados se identificaron 7 bacterias Gram positivas, que concuerdan con los datos fenotípicos del cepario y 3 bacterias que presentaron resultados erráticos (<60pb). Con base a los resultados obtenidos, el presente proyecto fortalece el Banco de cepas de la UCMC, posibilitando la participación en diferentes investigaciones u otros escenarios, incidiendo en el reconocimiento de otras universidades e instituciones, con el fin de generar espacios para consolidarla económicamente. Con estos resultados se pretende, registrar las cepas caracterizadas ante el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos “Alexander von Humboldt”.INTRODUCCIÓN - 3 - OBJETIVOS - 5 - Objetivo general - 5 - Objetivos específicos - 5 - 1. ANTECEDENTES - 6 - 2. MARCO REFERENCIAL - 11 - 2.1. Colecciones biológicas - 11 - 2.2. Generalidades de las bacterias Gram positivas en estudio - 11 - 2.2.1. Cocos Gram positivos - 13 - Staphylococcus spp - 13 - Streptococcus spp. - 14 - Enterococcus spp - 16 - Identificación bioquímica de Straphylococcus spp - 18 - Identificación bioquímica de Streptococcus spp. - 19 - 2.2.2. Bacilos Gram positivos - 20 - Lysteria spp - 21 - Corynebacterium spp - 22 - Bacillus spp - 22 - Características bacilos Gram positivos(Corynebacterium, Listeria, Bac- illus)- 23 - Identificación bioquímica de Lysteria, Corynebacterium y Bacillus - 23 - 2.3. Sistema BBL CRYSTAL para Gram Positivos - 24 - 2.4. Identificación molecular de bacterias Gram positivas - 24 - 2.4.1. Estructura molecular de las bacterias - 24 - 2.4.2. ARN 16S - 25 - 2.4.3. Etapas de identificación bacteriana - 25 - 2.4.4. Secuenciación del DNA mediante el método de Sanger - 26 - 3. DISEÑO METODOLÓGICO - 27 - 3.1. Tipo de investigación - 27 - 3.2. Universo, población, muestra - 27 - 3.3. Hipótesis, variables, indicadores Hipótesis - 27 - 3.4. Técnicas y procedimientos - 28 - 4. RESULTADOS - 36 - 5. DISCUSIÓN 55 6. CONCLUSIONES 61 BIBLIOGRAFIA 62 ANEXOS 69PregradoBacteriólogo(a) y Laboratorista Clínico83p.application/pdfspaUniversidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio ClínicoUniversidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2018https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/closedAccessAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_14cbCaracterización molecular de bacterias gram positivas del banco de cepas de la Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaTrabajo de grado - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Textinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/redcol/resource_type/TPinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionRodicio M, Mendoza M. Identificación bacteriana mediante secuenciación del ARNr 16S: fundamento, metodología y aplicaciones en microbiología clínica. 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Disponible en: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1405888X13720771BacteriasPruebas BioquímicasBanco de cepasDNACeparioBacterias Gram positivasFenotipificaciónSecuenciaciónADNPCRElectroforesisLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-814828https://repositorio.unicolmayor.edu.co/bitstream/unicolmayor/3641/4/license.txt2f9959eaf5b71fae44bbf9ec84150c7aMD54open accessORIGINALCARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE BACTERIAS GRAM POSITIVAS DEL BANCO DE CEPAS DE LA UNIVERSIDAD COLEG2.pdfCARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE BACTERIAS GRAM POSITIVAS DEL BANCO DE CEPAS DE LA UNIVERSIDAD COLEG2.pdfapplication/pdf2196288https://repositorio.unicolmayor.edu.co/bitstream/unicolmayor/3641/1/CARACTERIZACI%c3%93N%20MOLECULAR%20DE%20BACTERIAS%20GRAM%20POSITIVAS%20DEL%20BANCO%20DE%20CEPAS%20DE%20LA%20UNIVERSIDAD%20COLEG2.pdf620b56d2a7adfe2a75bd78f1ff0aeb08MD51metadata only accessCARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE BACTERIAS GRAM POSITIVAS DEL BANCO DE CEPAS DE LA UNIVERSIDAD COLEGI.....pdfCARACTERIZACIÓN 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POSITIVAS DEL BANCO DE CEPAS DE LA UNIVERSIDAD COLEGI.....pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg5350https://repositorio.unicolmayor.edu.co/bitstream/unicolmayor/3641/8/CARACTERIZACI%c3%93N%20MOLECULAR%20DE%20BACTERIAS%20GRAM%20POSITIVAS%20DEL%20BANCO%20DE%20CEPAS%20DE%20LA%20UNIVERSIDAD%20COLEGI.....pdf.jpg0e615c1d305d292aa0c5298f0eedf036MD58open accessCARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE BACTERIAS GRAM POSITIVAS DEL BANCO DE CEPAS DE LA UNIVERSIDAD COLEGI.pdf.jpgCARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE BACTERIAS GRAM POSITIVAS DEL BANCO DE CEPAS DE LA UNIVERSIDAD COLEGI.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg6418https://repositorio.unicolmayor.edu.co/bitstream/unicolmayor/3641/10/CARACTERIZACI%c3%93N%20MOLECULAR%20DE%20BACTERIAS%20GRAM%20POSITIVAS%20DEL%20BANCO%20DE%20CEPAS%20DE%20LA%20UNIVERSIDAD%20COLEGI.pdf.jpg8697f9b33e9934fdd674d736361edd34MD510open accessunicolmayor/3641oai:repositorio.unicolmayor.edu.co:unicolmayor/36412021-11-11 03:00:56.65An error occurred on the license 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