Genotipificación del promotor de CHRDL2 para la búsqueda de variantes potencialmente relacionadas con la etiología del cáncer colorrectal
El cáncer colorrectal (CCR) es el resultado de la acumulación de alteraciones genéticas y epigenéticas en el genoma de las células de la mucosa del colon que conduce a la transformación de una célula normal a una célula neoplásica. Variantes en la secuencia de ADN de la región promotora podrían dese...
- Autores:
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Roa Torres, Nasly Yurany
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Colegio Mayor de Cundinamarca
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Cáncer Colorrectal CHRDL2 Región Promotora Oncogen Secuenciación Polimorfismos |
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El cáncer colorrectal (CCR) es el resultado de la acumulación de alteraciones genéticas y epigenéticas en el genoma de las células de la mucosa del colon que conduce a la transformación de una célula normal a una célula neoplásica. Variantes en la secuencia de ADN de la región promotora podrían desempeñar un papel importante en la regulación de genes favoreciendo con esto la susceptibilidad a la enfermedad. En el presente estudio se empleó la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con primers específicos y posterior secuenciación de Sanger para la identificación de variantes de baja frecuencia en una región de 595pb del promotor del oncogén CHRDL2 en 45 muestras de biopsias de tejido tumoral procedentes de pacientes diagnosticados con cáncer de colon o recto. La secuenciación de esta región promotora permitió identificar tres polimorfismos de nucleótido único (SNPs): c.-150C<T en 7 muestras, c.-357C<T en 35 muestras y c.-417C<T en 33 muestras. La frecuencia alélica mínima (MAF) reportada en Ensembl determino que estos polimorfismos son frecuentes en la población y por lo tanto no son causa de la patología, lo cual indica que variantes en este fragmento de la región promotora no se relacionan con la etiología del CCR. |
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Posada Buitrago, Martha Lucía4d5afb0eea3b70008d7c115f3a7ee2c1Roa Torres, Nasly Yuranyc591781b651690fc976667d9a8a2a50b2021-10-27T21:39:52Z2021-10-27T21:39:52Z2019-01https://repositorio.unicolmayor.edu.co/handle/unicolmayor/357258685El cáncer colorrectal (CCR) es el resultado de la acumulación de alteraciones genéticas y epigenéticas en el genoma de las células de la mucosa del colon que conduce a la transformación de una célula normal a una célula neoplásica. Variantes en la secuencia de ADN de la región promotora podrían desempeñar un papel importante en la regulación de genes favoreciendo con esto la susceptibilidad a la enfermedad. En el presente estudio se empleó la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con primers específicos y posterior secuenciación de Sanger para la identificación de variantes de baja frecuencia en una región de 595pb del promotor del oncogén CHRDL2 en 45 muestras de biopsias de tejido tumoral procedentes de pacientes diagnosticados con cáncer de colon o recto. La secuenciación de esta región promotora permitió identificar tres polimorfismos de nucleótido único (SNPs): c.-150C<T en 7 muestras, c.-357C<T en 35 muestras y c.-417C<T en 33 muestras. La frecuencia alélica mínima (MAF) reportada en Ensembl determino que estos polimorfismos son frecuentes en la población y por lo tanto no son causa de la patología, lo cual indica que variantes en este fragmento de la región promotora no se relacionan con la etiología del CCR.RESUMEN OBJETIVOS 1. INTRODUCCIÓN14 2. ANTECEDENTES15 2.1 MLH115 2.2 APC16 2.3 PMS217 3. MARCO TEÓRICO18 3.1 Epidemiología18 3.2 Factores de riesgo19 3.3 Signos y síntomas20 3.4 Etiología21 3.5 Proteínas morfogénicas óseas24 3.6 Oncogen CHRDL224 3.2 Regiones promotoras y su relación con el cáncer25 4. DISEÑO METODOLÓGICO 4.1.1 Universo26 4.1.2 Población26 4.1.3 Muestra27 4.1.4 Variables27 4.2 TÉCNICAS Y PROCEDIMIENTOS 4.2.1 Extracción de ADN de tejido por método de salting out27 4.2.2 Cuantificación del ADN extraído28 4.2.3 Amplificación de la región promotora del gen CHRDL2 en muestras de tejido tumoral28 4.2.2.1 Diseño de primers29 4.2.3 Visualización de productos de PCR30 4.2.4.1 Purificación de muestras para la reacción de secuenciación30 4.2.4 Secuenciación productos de PCR del fragmento de 595pb del promotor de CHRDL231 4.2.5 Análisis de las secuencias31 5. RESULTADOS 5.1 Datos demográficos32 5.2 Cuantificación y determinación de pureza del ADN extraído34 5.3 Amplificación por PCR de un fragmento de 595pb de CHRDL236 5.3 Análisis de las secuencias37 6. DISCUSIÓN44 7. CONCLUSIONES47 8. PERSPECTIVAS48PregradoBacteriólogo(a) y Laboratorista Clínico67p.application/pdfspaUniversidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio ClínicoUniversidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2019https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/closedAccessAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_14cbGenotipificación del promotor de CHRDL2 para la búsqueda de variantes potencialmente relacionadas con la etiología del cáncer colorrectalTrabajo de grado - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Textinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/redcol/resource_type/TPinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionCoppedè, F. (2014). Genetic and epigenetic biomarkers for diagnosis, prognosis and treatment of colorectal cancer. 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Thumbnailimage/jpeg5860https://repositorio.unicolmayor.edu.co/bitstream/unicolmayor/3572/10/Genotipificacion%20del%20promotor%20de%20CHRDL2.pdf.jpgc44d2a0143700ae300f01a664a0c7975MD510open accessunicolmayor/3572oai:repositorio.unicolmayor.edu.co:unicolmayor/35722021-10-28 03:00:32.707An error occurred on the license name.|||https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/metadata only accessBiblioteca Digital 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