Uso de Cox-1 para la identificación de trematodos adultos y de huevos en muestras de materia fecal de rumiantes
Los trematodos son parásitos que constituyen uno de los grupos más grandes del reino animalia, cuentan con gran distribución a nivel mundial afectando animales vertebrados e invertebrados. Desde sus inicios la trematodosis se ha posicionado como una enfermedad de gran importancia debido las grandes...
- Autores:
-
Dávila Vera, Joan Sebastián
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Colegio Mayor de Cundinamarca
- Repositorio:
- Repositorio Colegio Mayor de Cundinamarca
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- Acceso en línea:
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- Palabra clave:
- Reino animal
Métodos moleculares
COX 1
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- Derechos Reservados - Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2018
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Los trematodos son parásitos que constituyen uno de los grupos más grandes del reino animalia, cuentan con gran distribución a nivel mundial afectando animales vertebrados e invertebrados. Desde sus inicios la trematodosis se ha posicionado como una enfermedad de gran importancia debido las grandes pérdidas económicas que genera a nivel agro-industrial. Diversos métodos moleculares se han utilizado para la identificación específica de especies de Fasciola y su diferenciación, como las técnicas que utilizan marcadores genéticos ribosomales y ADN mitocondrial. COX es considerado el marcador universal para el código genético, ya que presenta una elevada tasa evolutiva, es específico de cada especie, y presenta alta variabilidad interespecífica, esto se debe a que el genoma mitocondrial es una de las regiones más conservadas |
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Sánchez Leal, Ligia Consuelo3285fc07f487979b774cdc46534973daVargas Duarte, Jimmy Jolmanf69988842efc4f35c25967bd63947f30Dávila Vera, Joan Sebastián20db2693d728b68d2442aaf9a8b92a102022-03-09T21:35:16Z2022-03-09T21:35:16Z2018https://repositorio.unicolmayor.edu.co/handle/unicolmayor/479858431Los trematodos son parásitos que constituyen uno de los grupos más grandes del reino animalia, cuentan con gran distribución a nivel mundial afectando animales vertebrados e invertebrados. Desde sus inicios la trematodosis se ha posicionado como una enfermedad de gran importancia debido las grandes pérdidas económicas que genera a nivel agro-industrial. Diversos métodos moleculares se han utilizado para la identificación específica de especies de Fasciola y su diferenciación, como las técnicas que utilizan marcadores genéticos ribosomales y ADN mitocondrial. COX es considerado el marcador universal para el código genético, ya que presenta una elevada tasa evolutiva, es específico de cada especie, y presenta alta variabilidad interespecífica, esto se debe a que el genoma mitocondrial es una de las regiones más conservadasThe trematodes are parasites that constitute one of the largest groups of the Animalia Kingdom, have great distribution worldwide affecting vertebrate and invertebrate animals. Since its inception the Trematodosis has positioned itself as a disease of great importance due to the great economic losses generated at agroindustrial level. Various molecular methods have been used for the specific identification of Fasciola species and their differentiation, such as techniques using ribosomal genetic markers and mitochondrial DNA. COX is considered the universal marker for the genetic code, since it has a high evolutionary rate, is specific to each species, and has high interspecific variability, this is because the mitochondrial genome is one of the most preserved regions.1. INTRODUCCION 1 2. JUSTIFICACIÓN 2 3. OBJTETIVOS 3 3.1. Objetivo General 3 3.2. Objetivos Específicos 3 4. ANTECEDENTES 4 5. MARCO TEÓRICO 6 5.1. Generalidades de los trematodos 6 5.1.1. Clasificación de trematodos 6 5.1.2. Características morfológicas 7 5.2. Hospederos 8 5.2.1. Hospedero definitivo 8 5.2.2. Hospedero intermediario 9 5.3. Ciclo de vida 9 5.3.1. Fasciola hepatica 9 5.3.2. Paramfistómidos 12 5.4. Cuadro clínico 12 5.4.1. Fasciola hepatica 12 5.4.2. Paramfistómidos 13 5.5. Importancia económica 14 5.6. Epidemiologia 16 5.7. Técnicas de identificación de trematodos 17 5.7.1. Técnicas microscópicas 18 5.7.1.1. Coprológico 18 5.7.1.2. Sedimentación de Dennis 18 5.7.1.3. Sedimentación rápida 18 5.7.1.4. Método de Faust e Ingalls 18 5.7.1.5. Método de Jahnes y Hodge 19 5.7.1.6. Método de Baroody y Most 19 5.7.1.7. Filtración/Sedimentación 19 5.7.1.8. Tinción de contraste 19 5.7.1.9. Técnicas inmunoenzimáticas 19 5.7.2. Otros métodos de diagnóstico 20 5.7.2.1. Diagnóstico clínico 20 5.7.2.2. Diagnóstico por necropsia 20 5.7.2.3. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR ) 20 6. METODOLOGÍA 23 6.1. Enfoque metodológico de la investigación 23 6.2. Tipo y diseño de estudio 23 6.3. Población 23 6.4. Criterios de inclusión y exclusión 23 6.5. Descripción de variables 24 6.5.1. Variable dependiente 24 6.5.2. Variable independiente 24 6.6. procesamiento de las muestras. 24 6.6.1. Fase 1. Obtención de parásitos adultos de trematodos, nematodos y cestodos, cultivo de larvas y recolección de muestras de materia fecal presuntamente contaminada con trematodos. 24 6.6.1.1. Recolección de parásitos adultos pertenecientes a la clase trematoda 24 6.6.1.2. Recolección de parásitos adultos pertenecientes a nematodos y cestodos 24 6.6.1.3. Cultivo de larvas 25 6.6.1.4. Recolección de materia fecal de animales con riesgo a presentar trematodosis. 25 6.6.2. Fase 2. Extracción de ADN de parásitos adultos de trematodos, nematodos, cestodos, y pool de larvas para pruebas con el marcador mitocondrial COX-1 25 6.6.2.1. Extracción de ADN de parásitos adultos de trematodos, nematodos, cestodos y pool de larvas. 25 6.6.2.2. Amplificación por PCR 25 6.6.2.3. Visualización de los productos de amplificados mediante electroforesis en gel de agarosa 26 6.6.2.4. Purificación de los amplificados en gel usando el kit comercial Zymoclean Gel DNA Recovery Kit 26 6.6.2.5. Secuenciación 27 6.6.3. Fase 3. Prueba de los primers ParamCOX1 forward y reverse en muestras de materia fecal obtenidas en Concepción Santander 27 6.6.3.1. Identificación de huevos de trematodos por técnica de sedimentación rápida modificada en muestras de materia fecal 27 6.6.3.2. Verificación de nematodos y cestodos usando técnica de Mc Master 27 6.6.3.3. Extracción de ADN en muestras de materia fecal analizadas por las técnicas de sedimentación rápida modificada y técnica de Mc Master. 27 6.6.3.5. Visualización de los amplificados de las muestras de materia fecal usando gel de agarosa. 28 7. RESULTADOS 29 8. DISCUSIÓN 45 9. CONCLUSIONES 49 10. RECOMENDACIONES 50 REFERENCIAS 61PregradoBacteriólogo(a) y Laboratorista Clínico81p.application/pdfspaUniversidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio ClínicoDerechos Reservados - Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2018https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/closedAccessAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_14cbUso de Cox-1 para la identificación de trematodos adultos y de huevos en muestras de materia fecal de rumiantesTrabajo de grado - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Textinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/redcol/resource_type/TPinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionUribarren T. Universidad Nacional Autónoma de Mexico. [Online].; 2016 [cited 2017 Abril 15. 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FEC2.pdfapplication/pdf2958636https://repositorio.unicolmayor.edu.co/bitstream/unicolmayor/4798/2/USO%20DE%20COX-1%20PARA%20LA%20IDENTIFICACI%c3%93N%20DE%20TREMATODOS%20ADULTOS%20Y%20DE%20HUEVOS%20EN%20MUESTRAS%20DE%20MATERIA%20FEC2.pdf862aeb5b9514b82f7604573484192a0aMD52open accessUSO DE COX-1 PARA LA IDENTIFICACIÓN DE TREMATODOS ADULTOS Y DE HUEVOS EN MUESTRAS DE MATERIA FEC2 FORMATO DERECHOS DE AUTOR.pdfUSO DE COX-1 PARA LA IDENTIFICACIÓN DE TREMATODOS ADULTOS Y DE HUEVOS EN MUESTRAS DE MATERIA FEC2 FORMATO DERECHOS DE AUTOR.pdfapplication/pdf344776https://repositorio.unicolmayor.edu.co/bitstream/unicolmayor/4798/3/USO%20DE%20COX-1%20PARA%20LA%20IDENTIFICACI%c3%93N%20DE%20TREMATODOS%20ADULTOS%20Y%20DE%20HUEVOS%20EN%20MUESTRAS%20DE%20MATERIA%20FEC2%20FORMATO%20DERECHOS%20DE%20AUTOR.pdf6323afdeb27940e80ff7588916e0baa9MD53metadata only accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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