Diferenciación de especies de Rhodococcus mediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal
Dada la dificultad en diferenciar las especies de Rhodococcus por pruebas bioquímicas, se desarrolló una prueba de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR), seguida de un ensayo de Polimorfismo de Longitud de Fragmentos de Restricción (PCR-RFLP) para la diferenciación de las mismas. R. equi, R. rho...
- Autores:
-
Paula Pavía
Camila Calderon
Concepción Puerta
- Tipo de recurso:
- Article of investigation
- Fecha de publicación:
- 2014
- Institución:
- Colegio Mayor de Cundinamarca
- Repositorio:
- Repositorio Colegio Mayor de Cundinamarca
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.universidadmayor.edu.co:unicolmayor/4171
- Acceso en línea:
- https://doi.org/10.22490/24629448.332
https://repositorio.universidadmayor.edu.co/handle/unicolmayor/4171
- Palabra clave:
- Rights
- openAccess
- License
- https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
| id |
UCOLMAYOR2_b39c441a428e7b042152defdd760f6f8 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.universidadmayor.edu.co:unicolmayor/4171 |
| network_acronym_str |
UCOLMAYOR2 |
| network_name_str |
Repositorio Colegio Mayor de Cundinamarca |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Paula Pavíafd9244322ed312a3950c42595b70c9b5300Camila Calderon2a37b3bd13642a945b47816c174fec22300Concepción Puerta237d99d878fa0f5198962e738e7809ee3002021-12-09T14:39:10Z2021-12-09T14:39:10Z2014-03-281794-2470https://doi.org/10.22490/24629448.332https://repositorio.universidadmayor.edu.co/handle/unicolmayor/417110.22490/24629448.332Dada la dificultad en diferenciar las especies de Rhodococcus por pruebas bioquímicas, se desarrolló una prueba de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR), seguida de un ensayo de Polimorfismo de Longitud de Fragmentos de Restricción (PCR-RFLP) para la diferenciación de las mismas. R. equi, R. rhodnii y otras bacterias fueron cultivadas en agar sangre y BHI a 37 y 26 °C. El ADN bacteriano fue extraído y amplificado con los iniciadores descritos por Hypsa y Dale. Los productos de amplificación fueron sometidos a digestión con diversas enzimas de restricción y los patrones de restricción obtenidos fueron confirmados mediante análisis in silico. Se obtuvo el fragmento de amplificación esperado de 1300 pb en todas las bacterias analizadas. Se pudo diferenciar R. equi de R. rhodnii con las endonucleasas PstI y HindIII y con respecto a otras bacterias con PstI, HindIII, SstI, BamHI y EcoRI. Los patrones de restricción obtenidos fueron confirmados mediante análisis in silico. La prueba PCR-RFLP constituye una alternativa para la diferenciación entre especies de Rhodococcus tales como R. equi y R. rhodnii.application/pdftext/htmlspaUniversidad Colegio Mayor de Cundinamarcahttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://revistas.unicolmayor.edu.co/index.php/nova/article/view/41Diferenciación de especies de Rhodococcus mediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomalArtículo de revistaJournal Articlehttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Textinfo:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttps://revistas.unicolmayor.edu.co/index.php/nova/article/download/41/80https://revistas.unicolmayor.edu.co/index.php/nova/article/download/41/81Núm. 4 , Año 200543NOVAOREORE.xmltext/xml2675https://repositorio.universidadmayor.edu.co/bitstream/unicolmayor/4171/1/ORE.xmlae0453fdda4fe475185f1efcaefced2fMD51open accessunicolmayor/4171oai:repositorio.universidadmayor.edu.co:unicolmayor/41712022-04-27 15:22:56.063An error occurred on the license name.|||https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/metadata only accessBiblioteca Digital Unicolmayorrepositorio@unicolmayor.edu.co |
| dc.title.spa.fl_str_mv |
Diferenciación de especies de Rhodococcus mediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal |
| title |
Diferenciación de especies de Rhodococcus mediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal |
| spellingShingle |
Diferenciación de especies de Rhodococcus mediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal |
| title_short |
Diferenciación de especies de Rhodococcus mediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal |
| title_full |
Diferenciación de especies de Rhodococcus mediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal |
| title_fullStr |
Diferenciación de especies de Rhodococcus mediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal |
| title_full_unstemmed |
Diferenciación de especies de Rhodococcus mediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal |
| title_sort |
Diferenciación de especies de Rhodococcus mediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal |
| dc.creator.fl_str_mv |
Paula Pavía Camila Calderon Concepción Puerta |
| dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Paula Pavía Camila Calderon Concepción Puerta |
| description |
Dada la dificultad en diferenciar las especies de Rhodococcus por pruebas bioquímicas, se desarrolló una prueba de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR), seguida de un ensayo de Polimorfismo de Longitud de Fragmentos de Restricción (PCR-RFLP) para la diferenciación de las mismas. R. equi, R. rhodnii y otras bacterias fueron cultivadas en agar sangre y BHI a 37 y 26 °C. El ADN bacteriano fue extraído y amplificado con los iniciadores descritos por Hypsa y Dale. Los productos de amplificación fueron sometidos a digestión con diversas enzimas de restricción y los patrones de restricción obtenidos fueron confirmados mediante análisis in silico. Se obtuvo el fragmento de amplificación esperado de 1300 pb en todas las bacterias analizadas. Se pudo diferenciar R. equi de R. rhodnii con las endonucleasas PstI y HindIII y con respecto a otras bacterias con PstI, HindIII, SstI, BamHI y EcoRI. Los patrones de restricción obtenidos fueron confirmados mediante análisis in silico. La prueba PCR-RFLP constituye una alternativa para la diferenciación entre especies de Rhodococcus tales como R. equi y R. rhodnii. |
| publishDate |
2014 |
| dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2014-03-28 |
| dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2021-12-09T14:39:10Z |
| dc.date.available.none.fl_str_mv |
2021-12-09T14:39:10Z |
| dc.type.spa.fl_str_mv |
Artículo de revista |
| dc.type.eng.fl_str_mv |
Journal Article |
| dc.type.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1 |
| dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
| dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
| dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
| dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/ART |
| dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1 |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.issn.none.fl_str_mv |
1794-2470 |
| dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://doi.org/10.22490/24629448.332 https://repositorio.universidadmayor.edu.co/handle/unicolmayor/4171 |
| dc.identifier.doi.none.fl_str_mv |
10.22490/24629448.332 |
| identifier_str_mv |
1794-2470 10.22490/24629448.332 |
| url |
https://doi.org/10.22490/24629448.332 https://repositorio.universidadmayor.edu.co/handle/unicolmayor/4171 |
| dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.relation.bitstream.none.fl_str_mv |
https://revistas.unicolmayor.edu.co/index.php/nova/article/download/41/80 https://revistas.unicolmayor.edu.co/index.php/nova/article/download/41/81 |
| dc.relation.citationedition.none.fl_str_mv |
Núm. 4 , Año 2005 |
| dc.relation.citationissue.none.fl_str_mv |
4 |
| dc.relation.citationvolume.none.fl_str_mv |
3 |
| dc.relation.ispartofjournal.none.fl_str_mv |
NOVA |
| dc.rights.uri.spa.fl_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ |
| dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| dc.rights.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| rights_invalid_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf text/html |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca |
| dc.source.spa.fl_str_mv |
https://revistas.unicolmayor.edu.co/index.php/nova/article/view/41 |
| institution |
Colegio Mayor de Cundinamarca |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.universidadmayor.edu.co/bitstream/unicolmayor/4171/1/ORE.xml |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
ae0453fdda4fe475185f1efcaefced2f |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital Unicolmayor |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio@unicolmayor.edu.co |
| _version_ |
1851059760859709440 |
