Concordancia entre un método convencional y un método directo para la identificación bacteriana en muestras de hemocultivos positivos por Espectrofotometría de masas (Maldi – Tof Ms).

Introducción: Las enfermedades infecciosas con mayor índice de morbilidad y mortalidad en el mundo han sido causadas por infecciones dependientes de bacterias Gram positivas y Gram negativas, identificables en medios de cultivos solidos a partir de hemocultivos. Objetivo: Determinar la concordancia...

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Autores:: Martínez Casas, Nestor Otoniel

Tipo de recurso:: Trabajo de grado de pregrado

Fecha de publicación:: 2018

Institución:: Colegio Mayor de Cundinamarca

Repositorio:: Repositorio Colegio Mayor de Cundinamarca

Idioma:: spa

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Objetivo: Determinar la concordancia entre una metodología convencional y un método directo de diagnóstico in-vitro para identificación bacteriana, en muestras de hemocultivos positivos, provenientes de pacientes hospitalizados de la red Clínica Colsanitas de la ciudad de Bogotá mediante plataforma automatizada por espectrofotometría de masas (MALDITOF-MS), Resultados: El indice kappa arrojó un resultado de concordancia del 68 % (0,6807) con un valor p=0.000, categorizado como K bueno. Se estudiaron las características demográficas de la población observándose variaciones en las variables edad, sexo y procedencia, en el estudio se evidenció una media de edad de 67 años, en su mayoría sexo masculino, la mayoría de las muestras provienen de CUC con 71% y el promedio de tiempo de positividad fue 14 horas, la botella con más positividad es la # 1 con 43%, en las características de los microorganismos se encontró que las bacterias Gram negativas son las de mayor frecuencia con 71% el germen de mayor frecuencia hallado por las dos metodologías corresponde a E. coli con 33%. Conclusiones: La metodología MALDI TOF MS es la más opcionada en la identificación bacteriana por método directo, sin embargo, en nuestro estudio es necesario mejorar el proceso pre analítico de las muestras antes de su identificación para lograr una mayor concordancia1 INTRODUCCIÓN 17 2 ANTECEDENTES 19 3 MARCO DE REFERENCIA. 22 3.1 Espectrofotometría de masas 22 3.2 Analizadores (Dispositivos Biomédicos) 23 3.3 Maldi MS 24 3.4 Ionización por maldi 24 3.5 Analizador en tiempo de vuelo (en inglés, Time Of Flight). 24 3.6 Hemocultivo 25 3.6.1 Clasificación. 26 3.7 Identificación bacteriana 27 4 DISEÑO METODOLÓGICO 28 4.1 Universo, población y muestra. 28 4.1.1 Universo. 28 4.1.2 Población. 28 4.1.3 Muestra. 28 4.2 Hipótesis y variables. 30 4.2.1 Hipótesis. 30 4.2.2 Variables. 30 4.3 Análisis estadístico. 34 4.4 Técnicas y procedimientos. 35 4.4.1 Toma y remisión de muestras de hemocultivos. 35 4.4.2 Procesamiento de hemocultivos por metodología estandarizada convencional a partir de colonias en fase sólida por MALDI TOF. 35 4.4.3 Procesamiento de hemocultivos por metodología directa a partir de muestra liquida por MALDI TOF. 37 4.4.4 Proceso de recolección y sistematización de la información 38 4.5 Consideraciones éticas 38 5 RESULTADOS 41 5.1 Características demográficas de la población 41 5.1.1 Distribución de la variable edad. 41 5.1.2 Distribución de la variable sexo. 44 5.1.3 Distribución de la variable procedencia. 46 5.1.4 Distribución de variable tiempos de incubación de las muestras de hemocultivos 47 5.1.5 Distribución de variable número de botella de hemocultivo positivo. 49 5.2 Caracterización de los microrganismos hallados en los hemocultivos positivos de acuerdo a su coloración de Gram por su afinidad y morfología 50 5.2.1 Clasificación Bacteriana por Coloración de Gram. 50 5.2.2 Distribución de variable morfología bacteriana 52 5.2.3 Distribución de variable Germen identificado mediante metodo convencional Vitek MS® 54 5.2.4 Distribución de variable gérmen identificado por metodo directo 55 5.2.5 Tiempos entre la alarma de positividad y el procesamiento directo de hemocultimos positivos 57 5.3 Concordancia entre los dos métodos de análisis para la identificación bacteriana en hemocultivos positivos por MALDI-TOF. 58 6 DISCUSIÓN 59 7 CONCLUSIONES 63 8 REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS 64 9 ANEXOS 70PregradoBacteriólogo(a) y Laboratorista Clínico85p.application/pdfspaUniversidad Colegio Mayor de CundinamarcaUniversidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBogotá D.CBacteriología y Laboratorio ClínicoDerechos Reservados - Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2018https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/closedAccessAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_14cbConcordancia entre un método convencional y un método directo para la identificación bacteriana en muestras de hemocultivos positivos por Espectrofotometría de masas (Maldi – Tof Ms).Trabajo de grado - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Textinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/redcol/resource_type/TPinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionGarcía P, Allende F, Legarraga P, Huilcaman M, Solari S. Identificación bacteriana basada en el espectro de masas de proteínas: Una nueva mirada a la microbiología del siglo XXI. Rev Chil Infectología. 2012;29(3):263–72.La Scola B, Raoult D, Guo Z, Song Y, Wang J. Direct Identification of Bacteria in Positive Blood Culture Bottles by Matrix-Assisted Laser Desorption Ionisation Time-of-Flight Mass Spectrometry. Bereswill S, editor. PLoS One [Internet]. 2009 Nov 25 [cited 2017 Apr 17];4(11):e8041. Available from: http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0008041Kikuchi K, Matsuda M, Iguchi S, Mizutani T, Tega-ishii M, Sansaka K, et al. Potential Impact of Rapid Blood Culture Testing for Gram-Positive Bacteremia in Japan with the Verigene Gram-Positive Blood Culture Test. 2017;2017.Buchan BW, Riebe KM, Ledeboer NA. Comparison of the MALDI biotyper system using sepsityper specimen processing to routine microbiological methods for identification of bacteria from positive blood culture bottles. 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Concordancia entre un método convencional y un método directo para la identificación bacteriana en muestras de hemocultivos positivos por Espectrofotometría de masas (Maldi – Tof Ms).

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