Estudio DFT y QTAIM de moléculas orgánicas (PAZ, CHR, TCNQ, PTZ, PMA y BINA) con posible aplicación en electrónica molecular
Se hicieron cálculos UB3LYP con las bases DGDZVP y 6-311G(d) para estudiar seis moléculas orgánicas (PAZ, CHR, TCNQ, PTZ, PMA y BINA). Se usó la teoría cuántica de átomos en moléculas (QTAIM) para describir los tipos de enlace químico presentes en estas moléculas. Las energías de interacción se corr...
- Autores:
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Uribe, Emilbus A.
Acevedo-Amaya, Gabriel Fernando
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2020
- Institución:
- Universidad Católica de Colombia
- Repositorio:
- RIUCaC - Repositorio U. Católica
- Idioma:
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- OAI Identifier:
- oai:repository.ucatolica.edu.co:10983/25994
- Acceso en línea:
- https://hdl.handle.net/10983/25994
- Palabra clave:
- ELECTRÓNICA MOLECULAR
TEORÍA DE LOS FUNCIONALES DE LA DENSIDAD
TEORÍA CUÁNTICA DE ÁTOMOS EN MOLÉCULAS
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Se hicieron cálculos UB3LYP con las bases DGDZVP y 6-311G(d) para estudiar seis moléculas orgánicas (PAZ, CHR, TCNQ, PTZ, PMA y BINA). Se usó la teoría cuántica de átomos en moléculas (QTAIM) para describir los tipos de enlace químico presentes en estas moléculas. Las energías de interacción se correlacionaron con los valores de la densidad electrónica, la densidad de energía potencial y el laplaciano de la densidad en los puntos críticos de enlace (BCP). Las interacciones C-S, C-N, C-C, C-O y C-H se clasificaron como capa compartida y los enlaces S-S, como capa cerrada usando el laplaciano de ρ(r). Cuando se consideró la relación |V(r)|/G(r), se clasificaron las interacciones S-S como capa cerrada intermedia. |
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Uribe, E. A., & Acevedo-Amaya, G. F. (2020). Estudio DFT y QTAIM de moléculas orgánicas (PAZ, CHR, TCNQ, PTZ, PMA y BINA) con posible aplicación en electrónica molecular. Encuentro de Ciencias Básicas (4) : Las ciencias básicas y los nuevos retos. Experiencias significativas en el aula y I Congreso internacional de Red de Departamentos de Ciencias Básicas: ciencia y tecnología, 4(1), 136-148. |
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Bader, R. (1994). Atoms in molecules: A Quantum Theory. Oxford: Clarendon Press. Biegler-König, F. y Schönbohm, J. (2002). Update of the AIM2000-Program for Atoms in Molecules. Journal of Computational Chemistry, 23(15), 1489-1494. Chen, X., Bai, F., Wang, H., Zhang, H. y Tang, Y. (2015). The Impact of Molecular Stacking Interactions on the Electronic Structure and Charge Transport Properties in Distyrylbenzene (DSB-) Based D–A Complexes: a Theoretical Study. Royal Society of Chemistry Advances, 5(59), 47681-47691. Espinosa, E., Alkorta, I., Elguero, J. y Molins, E. (2002). From Weak to Strong Interactions: A Comprehensive Analysis of the Topological and Energetic Properties of the Electron Density Distribution Involving X-H⋯F-Y Systems. The Journal of Chemical Physics, 117(12), 5529-5542. Gautier, C., Taras, R., Gladiali, S. y Bürgi, T. (marzo, 2008). Chiral 1,1'-Binaphthyl-2,2'- Dithiol-Stabilized Gold Clusters: Size Separation and Optical Activity in the UVVis. Chirality, 20(3-4), 486-493. Geng, H., Zheng, X., Shuai, Z., Zhu L. y Yi, Y. (diciembre, 2015). Understanding the Charge Transport and Polarities in Organic Donor–Acceptor Mixed‐Stack Crystals: Molecular Insights from the Super‐Exchange Couplings. Advanced Materials, 27(8), 1443-1449. Heath, J. y Ratner, M. (Mayo, 2003). Molecular Electronics. Physics Today, 56(5), 43. Karthäuser, S. (enero, 2011). Control of Molecule-Based Transport for Future Molecular Devices. Journal of Physics: Condensed Matter, 23(1). Krüger, D., Fuchs, H., Rousseau, R., Marx, D. y Parrinello, M. (septiembre, 2001). Interaction of Short-Chain Alkane Thiols and Thiolates with Small Gold Clusters: Adsorption Structures and Energetics. Journal of Chemical Physics, 115(10), 4776-4786. Park, S., Varghese, S., Kim, J., Yoon, S., Kwon, O., An, B. y Gierschner, J. (marzo, 2013). Tailor-Made Highly Luminescent and Ambipolar Transporting Organic Mixed Stacked Charge-Transfer Crystals: An Isometric Donor-Acceptor Approach. Journal of the American Chemical Society, 135(12), 4757-4764. Pérez, M. (2016). Diseño y síntesis de semiconductores orgánicos, con capacidad de organización, alta movilidad de portadores de carga y bajo band GAP. (Tesis de pregrado). Recuperada de Archivo Digital Universidad Politécnica de Madrid. Rodríguez, J., Matta, C., Uribe, E., Götz, A., Castillo-Alvarado, F. y Molina, B. (enero, 2016). A QTAIM Topological Analysis of the P3HT-PCBM Dimer. Chemical Physics Letters, 644(16), 157-162. Rodríguez, J., Uribe, E., Baltazar-Méndez, M., Autschbach, J., Castillo-Alvarado, F. y Gutiérrez-González, I. (2016). Size Evolution Relativistic DFT-QTAIM Study on the Gold Cluster Complexes Au4-S-Cn-C2n-S'-Au4' (n=2-5). Chemical Physics Letters, 660, 287-294. Shirakawa, H. Louis, E., MacDiarmid, A., Chiang, C. y Heeger, A. (1977). Synthesis of Electrically Conducting Organic Polymers: Halogen Derivatives of Polyacetylene, (CH)x. Journal of the Chemical Society, Chemical Communications (16), 578-580. Uribe, E., Daza, M., Villaveces, J. y Delgado, S. (junio, 2009). On the Nature of Copper- Hydrogen Bonding: AIM and NBO Analysis of CuHn(1<n<6) Complexes. International Journal of Quantum Chemistry, 110(3), 524-531. Uribe, E., Daza, M.y Villaveces, J. (2010). CoHn (n=1-3): Classical and Non-Classical Cobalt Polyhydride. Chemical Physics Letters, 490(4-6), 143-147. Zhang, J., Xu, W., Sheng, P., Zhao, G. y Zhu, D. (junio, 2017). Organic Donor-Acceptor Complexes as Novel Organic Semiconductors. Accounts of Chemical Research, 50(7). Recuperado de https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.accounts.7b00124 |
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Cuando se consideró la relación |V(r)|/G(r), se clasificaron las interacciones S-S como capa cerrada intermedia.Abstract: UB3LYP calculations with the DGDZVP and 6-311G(d) basis sets have been used to study 6 organic molecules (PAZ, CHR, TCNQ, PTZ, PMA and BINA). Bader’s Quantum Theory of Atoms in Molecules (QTAIM) has been used for describing different types of chemical bonding present in these molecules. Interactions energies were correlated with the values of the electron density, the potential energy density, and the Laplacian of the density at the bond critical points (BCPs). The C-S, C-N, C-C, C-O y C-H interactions were classified as shared shell and the S-S bonds as closed shell using the Laplacian of ρ(r). When it was considered the ratio |V(r)|/G(r), we could classify the S-S interactions as transit closed shell.13 páginasapplication/pdfUribe, E. A., & Acevedo-Amaya, G. F. (2020). Estudio DFT y QTAIM de moléculas orgánicas (PAZ, CHR, TCNQ, PTZ, PMA y BINA) con posible aplicación en electrónica molecular. Encuentro de Ciencias Básicas (4) : Las ciencias básicas y los nuevos retos. Experiencias significativas en el aula y I Congreso internacional de Red de Departamentos de Ciencias Básicas: ciencia y tecnología, 4(1), 136-148.2590-7026 (impreso)2590-7018 (digital)https://hdl.handle.net/10983/25994spaUniversidad Católica de Colombia. Departamento de Ciencias BásicasBogotá14811364Encuentro de Ciencias Básicas (4) : Las ciencias básicas y los nuevos retos. Experiencias significativas en el aula y I Congreso internacional de Red de Departamentos de Ciencias Básicas: ciencia y tecnologíaBader, R. (1994). Atoms in molecules: A Quantum Theory. Oxford: Clarendon Press.Biegler-König, F. y Schönbohm, J. (2002). Update of the AIM2000-Program for Atoms in Molecules. Journal of Computational Chemistry, 23(15), 1489-1494.Chen, X., Bai, F., Wang, H., Zhang, H. y Tang, Y. (2015). The Impact of Molecular Stacking Interactions on the Electronic Structure and Charge Transport Properties in Distyrylbenzene (DSB-) Based D–A Complexes: a Theoretical Study. Royal Society of Chemistry Advances, 5(59), 47681-47691.Espinosa, E., Alkorta, I., Elguero, J. y Molins, E. (2002). From Weak to Strong Interactions: A Comprehensive Analysis of the Topological and Energetic Properties of the Electron Density Distribution Involving X-H⋯F-Y Systems. The Journal of Chemical Physics, 117(12), 5529-5542.Gautier, C., Taras, R., Gladiali, S. y Bürgi, T. (marzo, 2008). Chiral 1,1'-Binaphthyl-2,2'- Dithiol-Stabilized Gold Clusters: Size Separation and Optical Activity in the UVVis. Chirality, 20(3-4), 486-493.Geng, H., Zheng, X., Shuai, Z., Zhu L. y Yi, Y. (diciembre, 2015). Understanding the Charge Transport and Polarities in Organic Donor–Acceptor Mixed‐Stack Crystals: Molecular Insights from the Super‐Exchange Couplings. Advanced Materials, 27(8), 1443-1449.Heath, J. y Ratner, M. (Mayo, 2003). Molecular Electronics. Physics Today, 56(5), 43.Karthäuser, S. (enero, 2011). Control of Molecule-Based Transport for Future Molecular Devices. Journal of Physics: Condensed Matter, 23(1).Krüger, D., Fuchs, H., Rousseau, R., Marx, D. y Parrinello, M. (septiembre, 2001). Interaction of Short-Chain Alkane Thiols and Thiolates with Small Gold Clusters: Adsorption Structures and Energetics. Journal of Chemical Physics, 115(10), 4776-4786.Park, S., Varghese, S., Kim, J., Yoon, S., Kwon, O., An, B. y Gierschner, J. (marzo, 2013). Tailor-Made Highly Luminescent and Ambipolar Transporting Organic Mixed Stacked Charge-Transfer Crystals: An Isometric Donor-Acceptor Approach. Journal of the American Chemical Society, 135(12), 4757-4764.Pérez, M. (2016). Diseño y síntesis de semiconductores orgánicos, con capacidad de organización, alta movilidad de portadores de carga y bajo band GAP. (Tesis de pregrado). Recuperada de Archivo Digital Universidad Politécnica de Madrid.Rodríguez, J., Matta, C., Uribe, E., Götz, A., Castillo-Alvarado, F. y Molina, B. (enero, 2016). A QTAIM Topological Analysis of the P3HT-PCBM Dimer. Chemical Physics Letters, 644(16), 157-162.Rodríguez, J., Uribe, E., Baltazar-Méndez, M., Autschbach, J., Castillo-Alvarado, F. y Gutiérrez-González, I. (2016). Size Evolution Relativistic DFT-QTAIM Study on the Gold Cluster Complexes Au4-S-Cn-C2n-S'-Au4' (n=2-5). Chemical Physics Letters, 660, 287-294.Shirakawa, H. Louis, E., MacDiarmid, A., Chiang, C. y Heeger, A. (1977). Synthesis of Electrically Conducting Organic Polymers: Halogen Derivatives of Polyacetylene, (CH)x. Journal of the Chemical Society, Chemical Communications (16), 578-580.Uribe, E., Daza, M., Villaveces, J. y Delgado, S. (junio, 2009). On the Nature of Copper- Hydrogen Bonding: AIM and NBO Analysis of CuHn(1<n<6) Complexes. International Journal of Quantum Chemistry, 110(3), 524-531.Uribe, E., Daza, M.y Villaveces, J. (2010). CoHn (n=1-3): Classical and Non-Classical Cobalt Polyhydride. Chemical Physics Letters, 490(4-6), 143-147.Zhang, J., Xu, W., Sheng, P., Zhao, G. y Zhu, D. (junio, 2017). Organic Donor-Acceptor Complexes as Novel Organic Semiconductors. Accounts of Chemical Research, 50(7). Recuperado de https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.accounts.7b00124Copyright, Universidad Católica de Colombia, 2020info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-SA 4.0)https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2ELECTRÓNICA MOLECULARTEORÍA DE LOS FUNCIONALES DE LA DENSIDADTEORÍA CUÁNTICA DE ÁTOMOS EN MOLÉCULASEstudio DFT y QTAIM de moléculas orgánicas (PAZ, CHR, TCNQ, PTZ, PMA y BINA) con posible aplicación en electrónica molecularA DFT and QTAIM Study of Organic Molecules (PAZ, CHR, TCNQ, PTZ, PMA and BINA) with Possible Application in Molecular ElectronicArtículo de revistahttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1Textinfo:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTREFinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85PublicationORIGINALIV ENCUENTRO CIENCIAS BÁSICAS web f-137-149.pdfIV ENCUENTRO CIENCIAS BÁSICAS web f-137-149.pdfapplication/pdf748754https://repository.ucatolica.edu.co/bitstreams/7f386581-9283-44b0-ac4b-2204ef52e61b/download5ccd7f8f0518d9b5804e62468282bcb5MD51TEXTIV ENCUENTRO CIENCIAS BÁSICAS web f-137-149.pdf.txtIV ENCUENTRO CIENCIAS BÁSICAS web f-137-149.pdf.txtExtracted texttext/plain21823https://repository.ucatolica.edu.co/bitstreams/bb49cc1f-26de-4d10-a6a4-4692b6de2e7d/downloadfa4a5395a578a39c3bdb6f866e334cd3MD52THUMBNAILIV ENCUENTRO CIENCIAS BÁSICAS web f-137-149.pdf.jpgIV ENCUENTRO CIENCIAS BÁSICAS web f-137-149.pdf.jpgRIUCACimage/jpeg18952https://repository.ucatolica.edu.co/bitstreams/66592b63-7e0c-4d4c-8a1e-9c44b3fd63cd/downloada58e79c71f07f0b00d018bcdfb0d739bMD5310983/25994oai:repository.ucatolica.edu.co:10983/259942023-03-24 17:59:43.303https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/Copyright, Universidad Católica de Colombia, 2020https://repository.ucatolica.edu.coRepositorio Institucional Universidad Católica de Colombia - RIUCaCbdigital@metabiblioteca.com |