Estudio in sílico de moléculas de origen natural con potencial actividad inhibitoria sobre la enzima acetilcolinesterasa

La resistencia a plaguicida ha sido uno de los principales inconvenientes en la agricultura, además de los daños ambientales y riesgos para la salud humana que estos han generado desde sus orígenes. Los principales focos para el control de plaga han utilizado la acetilcolinesterasa (AChE) como blanc...

Full description

Autores:
Sarmiento Miranda, Juan Carlos
Sequeda Wilches, Leydi Patricia
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2021
Institución:
Universidad de Cartagena
Repositorio:
Repositorio Universidad de Cartagena
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unicartagena.edu.co:11227/15579
Acceso en línea:
https://hdl.handle.net/11227/15579
http://dx.doi.org/10.57799/11227/10113
Palabra clave:
Asociación molecular
Enlaces químicos
Biología computacional
Acetilcolinesterasa
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openAccess
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Derechos Reservados - Universidad de Cartagena, 2021
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description La resistencia a plaguicida ha sido uno de los principales inconvenientes en la agricultura, además de los daños ambientales y riesgos para la salud humana que estos han generado desde sus orígenes. Los principales focos para el control de plaga han utilizado la acetilcolinesterasa (AChE) como blanco, la cual es una de las enzimas más importantes en los seres vivos, ya que es la responsable de la sinapsis colinérgica y otros procesos nerviosos; no obstante, su inhibición ha encontrado aplicaciones farmacológicas en el tratamiento de diferentes enfermedades tales como: miastenia gravis, alzheimer y tratamiento clínico de la demencia. En la búsqueda de potenciales inhibidores de AChE para reducir el impacto producido por los plaguicidas sintéticos el siguiente trabajo pretende evaluar el potencial de inhibición de moléculas de origen natural sobre la enzima acetilcolinesterasa mediante un estudio in silico. Para lograr este objetivo se utilizaron herramientas bioinformáticas y de la química computacional tales como el método semiempírico PM6 para la optimización molecular mediante el programa Gaussian 09, acoplamiento molecular con el programa autodock tools y cálculo de propiedades farmacocinéticas haciendo uso del servidor web SwissADME, que permitieron describir las interacciones y la afinidad de 20 moléculas de origen natural con la enzima AchE para luego compararlas con dos plaguicidas sintético (malatión y carbofurano) de referencia y su ligando nativo (acetilcolina). Teniendo en cuenta los datos obtenidos se encontraron que tres moléculas presentaron resultados promisorios como inhibidores de la enzima en cuestión, los compuestos son: evodiamina (MS11), Huperzina (MS13) y rutaecarpina (MS19); a estas moléculas seleccionadas se le realizó un perfil ADME, debido a que arrojaron valores de band gap 3.40 eV, 8.59 eV, y 2.90 eV y afinidad -8.7 kcal/mol, -8.9 kcal/mol y -9.5 kcal/mol respectivamente, superiores a las moléculas de referencia (malatión, carbofurano y acetilcolina). En conclusión, las moléculas de origen natural seleccionadas en este trabajo ofrecen una alternativa como potenciales inhibidores de AchE y por tanto su posible acción plaguicida.
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En la búsqueda de potenciales inhibidores de AChE para reducir el impacto producido por los plaguicidas sintéticos el siguiente trabajo pretende evaluar el potencial de inhibición de moléculas de origen natural sobre la enzima acetilcolinesterasa mediante un estudio in silico. Para lograr este objetivo se utilizaron herramientas bioinformáticas y de la química computacional tales como el método semiempírico PM6 para la optimización molecular mediante el programa Gaussian 09, acoplamiento molecular con el programa autodock tools y cálculo de propiedades farmacocinéticas haciendo uso del servidor web SwissADME, que permitieron describir las interacciones y la afinidad de 20 moléculas de origen natural con la enzima AchE para luego compararlas con dos plaguicidas sintético (malatión y carbofurano) de referencia y su ligando nativo (acetilcolina). Teniendo en cuenta los datos obtenidos se encontraron que tres moléculas presentaron resultados promisorios como inhibidores de la enzima en cuestión, los compuestos son: evodiamina (MS11), Huperzina (MS13) y rutaecarpina (MS19); a estas moléculas seleccionadas se le realizó un perfil ADME, debido a que arrojaron valores de band gap 3.40 eV, 8.59 eV, y 2.90 eV y afinidad -8.7 kcal/mol, -8.9 kcal/mol y -9.5 kcal/mol respectivamente, superiores a las moléculas de referencia (malatión, carbofurano y acetilcolina). En conclusión, las moléculas de origen natural seleccionadas en este trabajo ofrecen una alternativa como potenciales inhibidores de AchE y por tanto su posible acción plaguicida.PregradoQuímico(a) Farmacéutico(a)application/pdfspaUniversidad de CartagenaFacultad de Ciencias FarmacéuticasCartagena de IndiasQuímica FarmacéuticaDerechos Reservados - Universidad de Cartagena, 2021https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Estudio in sílico de moléculas de origen natural con potencial actividad inhibitoria sobre la enzima acetilcolinesterasaTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTextinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/redcol/resource_type/TPhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Asociación molecularEnlaces químicosBiología computacionalAcetilcolinesterasaPublicationORIGINALLEYDI SEQUEDA - JUAN SARMIENTO - Trabajo final.pdfLEYDI SEQUEDA - JUAN SARMIENTO - Trabajo final.pdfapplication/pdf380131https://dspace7-unicartagena.metabuscador.org/bitstreams/36242738-c926-45de-8dbf-aaed105e259d/download8928030f43b2b94eb04ac9ad1b8c4eb5MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81756https://dspace7-unicartagena.metabuscador.org/bitstreams/bdb70f71-c692-4226-be6a-3c170b8b9c7e/download7b38fcee9ba3bc8639fa56f350c81be3MD52TEXTLEYDI SEQUEDA - JUAN SARMIENTO - Trabajo final.pdf.txtLEYDI SEQUEDA - JUAN SARMIENTO - Trabajo final.pdf.txtExtracted texttext/plain65506https://dspace7-unicartagena.metabuscador.org/bitstreams/1d230e48-9382-4b06-8d03-6ca6d79d60c3/downloadc89d09712a3d929ef7f6e3469a5ad4f2MD53THUMBNAILLEYDI SEQUEDA - JUAN SARMIENTO - Trabajo final.pdf.jpgLEYDI SEQUEDA - JUAN SARMIENTO - Trabajo final.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg7529https://dspace7-unicartagena.metabuscador.org/bitstreams/ec0c0afb-bc09-4019-a669-8fb5cc7d4724/downloadbe13f6208777bbe98aa9ca1ae418e3feMD5411227/15579oai:dspace7-unicartagena.metabuscador.org:11227/155792024-08-28 17:36:10.974https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Derechos Reservados - Universidad de Cartagena, 2021open.accesshttps://dspace7-unicartagena.metabuscador.orgBiblioteca Digital Universidad de Cartagenabdigital@metabiblioteca.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