Un modelo de regresión Poisson no lineal para extinción de especies en hábitats fragmentados.
La Bioestadística es el conjunto de métodos estadísticos utilizados principalmente en biología, incluido el diseño de experimentos biológicos, la recopilación de datos experimentales y el análisis estadístico de estos tipos datos. Un gran número de biólogos recopilan diferentes tipos de datos, de di...
- Autores:
-
Lai, Qitian
- Tipo de recurso:
- Masters Thesis
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Universidad Santo Tomás
- Repositorio:
- Universidad Santo Tomás
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.usta.edu.co:11634/47424
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/11634/47424
- Palabra clave:
- Biostatistics
Habitat Fragmentation
Nonlinear Poisson Regression Model
Species Extinction
Extinción (Biología)
Estadística
Medio ambiente -- Degradación
Bioestadística
Extinción de Especies
Fragmentación de Hábitats
Modelo de Regresión Normal no Lineal
Modelo de Regresión Poisson no Lineal
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La Bioestadística es el conjunto de métodos estadísticos utilizados principalmente en biología, incluido el diseño de experimentos biológicos, la recopilación de datos experimentales y el análisis estadístico de estos tipos datos. Un gran número de biólogos recopilan diferentes tipos de datos, de diferentes rincones del mundo. Generalmente, estos datos contienen diferentes tipos de variables dependientes e independientes que pueden analizarse utilizando modelos de regresión lineales o no lineales. En la actualidad, las actividades humanas (construcción de presas, deforestación, etc.) y el cambio climático representan una amenaza para un gran número de especies animales y plantas, y la extinción de las especies representa una gran parte de la investigación biológica y bioestadística. En cuanto a la modelización estadística de la extinción de especies y sus posibles causas, es común encontrar en propuesta de Regresión Normal No Lineal, Lo cual reducir error, dado que la variable respuesta corresponde al número de especies en ciertas áreas de interés a lo largo del tiempo, por lo que la Regresión de Poisson no Lineal será una suposición más apropiada. En este proyecto, se propone la Regresión de Poisson No Lineal con el objetivo de ajustar los datos sobre el número de especies en hábitats fragmentados. En particular, tiene como objetivo realizar el Modelo de Gibson et al. (2013), que es un modelo No Lineal para la variable número de especies, en función del área de los fragmentos y la fragmentación del hábitat. Este proyecto demuestra que la Regresión de Poisson No Lineal es más eficiente que otros tipos de Regresiones, al ajustar tipos de datos comunes en bioestadísticas como el número de especies en función del tiempo y el área de los fragmentos. Los resultados mostraron que existe una correlación negativa entre el número de especies restantes y el tiempo. A medida que pasa el tiempo, el número de especies restantes disminuye, existe una correlación positiva entre el número de especies restantes y el área de la isla. Las islas más grandes tienen más especies restantes, pero con el paso del tiempo, la tasa de extinción de las islas más grandes es más alta que la de las islas pequeñas. Sin embargo, las especies restantes en la isla eventualmente se extinguirán hasta la situación en la que solo quedaran una o dos especies que básicamente tienden a extinguirse hasta 15 años. Para usar Regresión Normal no Lineal y Regresión de Poisson no Lineal respectivamente, comparando la Regresión Original de luke et al. (2013), el valor R2 también es más alto que las otras dos regresiones, por otro lado, la Regresión de Poisson no Lineal tiene un intervalo de confianza más pequeño y menor la desviación residual y AIC. Se puede concluir que la Regresión Poisson no lineal es más eficiente que la Regresión Normal no Lineal. |
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En la actualidad, las actividades humanas (construcción de presas, deforestación, etc.) y el cambio climático representan una amenaza para un gran número de especies animales y plantas, y la extinción de las especies representa una gran parte de la investigación biológica y bioestadística. En cuanto a la modelización estadística de la extinción de especies y sus posibles causas, es común encontrar en propuesta de Regresión Normal No Lineal, Lo cual reducir error, dado que la variable respuesta corresponde al número de especies en ciertas áreas de interés a lo largo del tiempo, por lo que la Regresión de Poisson no Lineal será una suposición más apropiada. En este proyecto, se propone la Regresión de Poisson No Lineal con el objetivo de ajustar los datos sobre el número de especies en hábitats fragmentados. En particular, tiene como objetivo realizar el Modelo de Gibson et al. (2013), que es un modelo No Lineal para la variable número de especies, en función del área de los fragmentos y la fragmentación del hábitat. Este proyecto demuestra que la Regresión de Poisson No Lineal es más eficiente que otros tipos de Regresiones, al ajustar tipos de datos comunes en bioestadísticas como el número de especies en función del tiempo y el área de los fragmentos. Los resultados mostraron que existe una correlación negativa entre el número de especies restantes y el tiempo. A medida que pasa el tiempo, el número de especies restantes disminuye, existe una correlación positiva entre el número de especies restantes y el área de la isla. Las islas más grandes tienen más especies restantes, pero con el paso del tiempo, la tasa de extinción de las islas más grandes es más alta que la de las islas pequeñas. Sin embargo, las especies restantes en la isla eventualmente se extinguirán hasta la situación en la que solo quedaran una o dos especies que básicamente tienden a extinguirse hasta 15 años. Para usar Regresión Normal no Lineal y Regresión de Poisson no Lineal respectivamente, comparando la Regresión Original de luke et al. (2013), el valor R2 también es más alto que las otras dos regresiones, por otro lado, la Regresión de Poisson no Lineal tiene un intervalo de confianza más pequeño y menor la desviación residual y AIC. Se puede concluir que la Regresión Poisson no lineal es más eficiente que la Regresión Normal no Lineal.Biostatistics is the set of statistical methods used mainly in biology, including the design of biological experiments, the collection of experimental data, and the statistical analysis of these data. Numerous biologists collect di erent data, from di erent corners of the world. These data contain di erent dependent and independent variables which can be analyzed using linear, or nonlinear regression models. At present, the human activities (dam building, deforestation, etc.) and climate change represent a threat to numerous animal and plant species, and the extinction of the species represents a large part of biological and biostatistical research. Regarding the statistical modeling of the extinction of species and its causes, it is common to nd out most of the research are using the Nonlinear Normal Regression, this kind of Regression is mistakenly assumed, the response variable corresponds to the number of species in certain areas of interest with time passing, thus Nonlinear Poisson regression would be a more appropriate assumption. In this project, the Nonlinear Poisson regression is proposed, aiming to t data concerning the number of species in fragmented habitats. In particular, it aims to re ne the Island Biogeographic Model in Gibson et al. (2013), which is a Nonlinear model for the variable number of species, as a function of the area of the fragments and habitat fragmentation. This project proves that Nonlinear Poisson Regression is more e ective than other types of regressions. When tting the data in biostatistics, the variable includes the number of species, time, and the area of fragments. The results showed that there have a negative correlation between the number of remaining species and time, with time passing, the number of remaining species is decreasing, there is a positive correlation between the number of remaining species and the island area, larger islands have more number of remaining species, but with the time passing, the extinction rate of larger islands is higher than small islands, however by the end, the remaining species on the island will eventually become extinct to the situation where only have one or two species remaining. For using Nonlinear Normal Regression and Nonlinear Poisson Regression respectively, comparing the regression original from Luke et al. (2013), the R2 value is also higher than the other two regressions. In other hand, the Nonlinear Poisson Regression has a smaller con dence interval and residual deviance and AIC. We can concluded that when using Nonlinear Poisson Regression, the regression analysis of data is more e ective than using the Nonlinear Normal Regression.Magister en Estadística AplicadaMaestríaapplication/pdfspaUniversidad Santo TomásMaestría Estadística AplicadaFacultad de EstadísticaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/Abierto (Texto Completo)info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Un modelo de regresión Poisson no lineal para extinción de especies en hábitats fragmentados.BiostatisticsHabitat FragmentationNonlinear Poisson Regression ModelSpecies ExtinctionExtinción (Biología)EstadísticaMedio ambiente -- DegradaciónBioestadísticaExtinción de EspeciesFragmentación de HábitatsModelo de Regresión Normal no LinealModelo de Regresión Poisson no LinealTesis de maestríainfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisCRAI-USTA BogotáPalmeirim, Ana Filipa, et al. Small mammal responses to Amazonian forest islands are modulated by their forest dependence. Oecologia 187.1 (2018): 191-204.Martensen, Alexandre Camargo, et al. Associations of forest cover, fragment area, and connectivity with neotropical understory bird species richness and abundance. Conservation Biology 26.6 (2012): 1100-1111.Brook, Barry W., Navjot S. Sodhi, and Peter KL Ng. Catastrophic extinctions follow deforestation in Singapore. Nature 424.6947 (2003): 420-423.Attuquaye o, Daniel K., Erasmus H. Owusu, and Benjamin Y. Ofori. Impact of mining and forest regeneration on small mammal biodiversity in the Western Region of Ghana. Environmental monitoring and assessment 189.5 (2017): 1-9.Michalski, Fernanda, and Carlos A. Peres. Disturbance-mediated mammal persistence and abundance-area relationships in Amazonian forest fragments. Conservation Biology 21.6 (2007): 1626-1640.Woinarski, John CZ, Andrew A. Burbidge, and Peter L. Harrison. 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Conservation Biology 28.1 (2014): 95-106.United Nations Environment Programme, What is biodiversity? , World Conservation Monitoring Centre 2010Allaire, JJ, Yihui Xie, Jonathan McPherson, Javier Luraschi, Kevin Ushey, Aron Atkins, Hadley Wickham, Joe Cheng, Winston Chang, and Richard Iannone. rmarkdown: Dynamic Documents for R (version 2.10). https://CRAN.Rproject. org/package=rmarkdown. 2021Draper, Norman R., and Harry Smith. Applied regression analysis. Vol. 326. 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