Diseño y evaluación del efecto de los extractos provenientes de pennisetum purpureum sobre la germinación y crecimiento de la especie forestal cedrela odorata l.
El presente estudio expone la aplicación de modelos estadísticos para el análisis del crecimiento y la germinación de la especie Cedrela Odorata L. Se propone el ajuste de un modelo lineal mixto para el crecimiento y un modelo lineal mixto de Poisson con exceso de ceros para la germinaci´on. Este mo...
- Autores:
-
Chaparro Pesca, Jorge Alberto
- Tipo de recurso:
- Masters Thesis
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad Santo Tomás
- Repositorio:
- Universidad Santo Tomás
- Idioma:
- OAI Identifier:
- oai:repository.usta.edu.co:11634/23138
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/11634/23138
- Palabra clave:
- Germination
Growth
Pennisetum Purpureum
Mixed linear models
Mixed zero-inflated Poisson regression model
Cedrela Odorata
Germinación -- Características -- Métodos estadísticos
Nutrición de las plantas -- Características -- Métodos estadísticos
Árboles maderables -- Industria -- Métodos estadísticos
Modelos lineales (Estadística)
Modelos estadísticos
Germinación
Crecimiento
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Modelo lineales Mixto
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Cedrela Odorata
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El presente estudio expone la aplicación de modelos estadísticos para el análisis del crecimiento y la germinación de la especie Cedrela Odorata L. Se propone el ajuste de un modelo lineal mixto para el crecimiento y un modelo lineal mixto de Poisson con exceso de ceros para la germinaci´on. Este modelo es adecuado cuando se analizan variables con exceso de ceros y mostró un buen ajuste a los datos. Se encontró que existe diferencia estadística significativa entre los tratamientos evaluados en favor de la utilización del tratamiento 4, extracto acuosa, el cual obtuvo mayor germinación y crecimiento con menor nivel de variabilidad y menor porcentaje de plantas estancadas de la Cedrela Odorata L. |
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Bolker, B. M., Brooks, M. E., Clark, C. J., Geange, S. W., Poulsen, J. R., Stevens, M. H. H. & White, J.S. S. (2009), ‘Generalized linear mixed models: a practical guide for ecology and evolution’, Trends in ecology & evolution 24(3), 127–135. Bolker, B. M., Brooks, M. E., Clark, C. J., Geange, S. W., Poulsen, J. R., Stevens, M. H. H. & White, J.S. S. (2009), ‘Generalized linear mixed models: a practical guide for ecology and evolution’, Trends in ecology & evolution 24(3), 127–135. Cardenas, L. (2007), ‘D., salinas, nr,(ed.) libro rojo de plantas de Colombia, volumen 4, especies maderables amenazadas, primera parte. instituto amazónico de investigaciones científicas sinchi’, Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial . Cárdenas, M. V. (2010), ‘Estimación en modelos lineales mixtos con datos continuos usando transformaciones y distribuciones no normales.’. Castillo, G., Altuna, B., Michelena, G., Sánchez-Bravo, J. & Acosta, M. (2005), Cuantificación del contenido de ácido indolacético (aia) en un caldo de fermentación microbiana, in ‘Anales de Biología’, Vol. 27, pp. 137–142. Demidenko, E. & Stukel, T. A. (2005), ‘Influence analysis for linear mixed-effects models’, Statistics in medicine 24(6), 893–909. Grenke, W., Hatheway, W., Liang, T., Tosi, J. et al. (1971), ‘Forest environments in tropical life zones: A pilot study’. Hall, D. B. & Zhang, Z. (2004), ‘Marginal models for zero inflated clustered data’, Statistical Modelling 4(3), 161–180. Márquez Ramírez, J., Xotla Valdés, U. & Gonz´alez de la Torre, J. E. (2005), ‘Estudio de germinación y crecimiento inicial de plántulas de cedrela odorata l.’, Foresta Veracruzana 7(2). Mateus, L., Hernández, O., Velásquez, M. & Velásquez, J. d. J. D. (2012), ‘Evaluación del pretratamiento con ácido sulfúrico diluido del pasto maralfalfa (pennisetum glaucum x pennisetum purpureum) para la producción de etanol’, Revista Colombiana de Biotecnología 14(1), 146–156. McGilchrist, C. (1994), ‘Estimation in generalized mixed models’, Journal of the Royal Statistical Society. Series B (Methodological) pp. 61–69. Melgarejo, L. M. (2010), Experimentos en fisiología vegetal, Technical report, Universidad Nacional de Colombia;. Montgomery C, D. (1997), Design and analysis of experiments. Morales, E. & Herrera, L. (2009), ‘Cedro (cedrela odorata l.) protocolo para su colecta, beneficio y almacenaje’, México: Comisión Nacional Forestal, Región XII Penınsula de Yucatán. Pérez, J. (2014), Evaluación del Efecto Inductor de Germinación y Crecimiento en la Especie Forestal Cedro Amargo Utilizando Extractos Proveniente de la Graminea King Morado. RStudio Team (2018), RStudio: Integrated Development Environment for R, RStudio, Inc., Boston, MA. *http://www.rstudio.com/ Salisbury, F. B., Ross, C., Alonso, J. M. et al. (2000), Fisiología de las plantas. Vázquez, M. d. L. V. & Cerrillo, S. F. J. (2010), ‘Un modelo de regresión poisson inflado con ceros para analizar datos de un experimento de fungicidas en jitomate’, Memoria del 2 Encuentro Iberoamericano de Biometría y la V Reunión de la Región Centroamericana y del Caribe de la Sociedad Internacional de Biometría p. 16. Vuong, Q. H. (1989), ‘Likelihood ratio tests for model selection and non-nested hypotheses’, Econometrica: Journal of the Econometric Society pp. 307–333. Wang, K., Yau, K. K. & Lee, A. H. (2002), ‘A zero-inflated poisson mixed model to analyze diagnosis related groups with majority of same-day hospital stays’, Computer methods and programs in biomedicine 68(3), 195–203. Wilson, P. (2015), ‘The misuse of the vuong test for non-nested models to test for zero-inflation’, Economics Letters 127, 51–53. |
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Este modelo es adecuado cuando se analizan variables con exceso de ceros y mostró un buen ajuste a los datos. Se encontró que existe diferencia estadística significativa entre los tratamientos evaluados en favor de la utilización del tratamiento 4, extracto acuosa, el cual obtuvo mayor germinación y crecimiento con menor nivel de variabilidad y menor porcentaje de plantas estancadas de la Cedrela Odorata L.This study presents the application of statistical models for the analysis of growth and germination of the species Cedrela Odorata L. It is proposed the adjustment of a linear mixed model for growth and a Poisson linear mixed model with zeros excess for germination. This model is adequate when variables with zeros excess data are being analyzed and showed a good fit for the data. It was found that there is a significant statistical difference in the treatments evaluated in favor of the use of treatment 4, aqueous extract, which obtained greater germination and growth with lower level of variability and lower percentage of stagnant plants of the Cedrela Odorata L.Magíster en estadística aplicadahttp://unidadinvestigacion.usta.edu.coMaestríaapplication/pdfCC0 1.0 Universalhttp://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/Abierto (Texto Completo)info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Diseño y evaluación del efecto de los extractos provenientes de pennisetum purpureum sobre la germinación y crecimiento de la especie forestal cedrela odorata l.GerminationGrowthPennisetum PurpureumMixed linear modelsMixed zero-inflated Poisson regression modelCedrela OdorataGerminación -- Características -- Métodos estadísticosNutrición de las plantas -- Características -- Métodos estadísticosÁrboles maderables -- Industria -- Métodos estadísticosModelos lineales (Estadística)Modelos estadísticosGerminaciónCrecimientoPennisetum PurpureumModelo lineales MixtoModelo mixto Poisson con exceso de cerosCedrela OdorataTesis de maestríainfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionFormación de Recurso Humano para la Ctel: Trabajo de grado de Maestríahttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisCRAI-USTA BogotáBolker, B. M., Brooks, M. E., Clark, C. J., Geange, S. W., Poulsen, J. R., Stevens, M. H. H. & White, J.S. S. (2009), ‘Generalized linear mixed models: a practical guide for ecology and evolution’, Trends in ecology & evolution 24(3), 127–135.Bolker, B. M., Brooks, M. E., Clark, C. J., Geange, S. W., Poulsen, J. R., Stevens, M. H. H. & White, J.S. S. (2009), ‘Generalized linear mixed models: a practical guide for ecology and evolution’, Trends in ecology & evolution 24(3), 127–135.Cardenas, L. (2007), ‘D., salinas, nr,(ed.) libro rojo de plantas de Colombia, volumen 4, especies maderables amenazadas, primera parte. instituto amazónico de investigaciones científicas sinchi’, Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial .Cárdenas, M. V. (2010), ‘Estimación en modelos lineales mixtos con datos continuos usando transformaciones y distribuciones no normales.’.Castillo, G., Altuna, B., Michelena, G., Sánchez-Bravo, J. & Acosta, M. (2005), Cuantificación del contenido de ácido indolacético (aia) en un caldo de fermentación microbiana, in ‘Anales de Biología’, Vol. 27, pp. 137–142.Demidenko, E. & Stukel, T. A. (2005), ‘Influence analysis for linear mixed-effects models’, Statistics in medicine 24(6), 893–909.Grenke, W., Hatheway, W., Liang, T., Tosi, J. et al. (1971), ‘Forest environments in tropical life zones: A pilot study’.Hall, D. B. & Zhang, Z. (2004), ‘Marginal models for zero inflated clustered data’, Statistical Modelling 4(3), 161–180.Márquez Ramírez, J., Xotla Valdés, U. & Gonz´alez de la Torre, J. E. (2005), ‘Estudio de germinación y crecimiento inicial de plántulas de cedrela odorata l.’, Foresta Veracruzana 7(2).Mateus, L., Hernández, O., Velásquez, M. & Velásquez, J. d. J. D. (2012), ‘Evaluación del pretratamiento con ácido sulfúrico diluido del pasto maralfalfa (pennisetum glaucum x pennisetum purpureum) para la producción de etanol’, Revista Colombiana de Biotecnología 14(1), 146–156.McGilchrist, C. (1994), ‘Estimation in generalized mixed models’, Journal of the Royal Statistical Society. Series B (Methodological) pp. 61–69.Melgarejo, L. M. (2010), Experimentos en fisiología vegetal, Technical report, Universidad Nacional de Colombia;.Montgomery C, D. (1997), Design and analysis of experiments.Morales, E. & Herrera, L. (2009), ‘Cedro (cedrela odorata l.) protocolo para su colecta, beneficio y almacenaje’, México: Comisión Nacional Forestal, Región XII Penınsula de Yucatán.Pérez, J. (2014), Evaluación del Efecto Inductor de Germinación y Crecimiento en la Especie Forestal Cedro Amargo Utilizando Extractos Proveniente de la Graminea King Morado.RStudio Team (2018), RStudio: Integrated Development Environment for R, RStudio, Inc., Boston, MA. *http://www.rstudio.com/Salisbury, F. B., Ross, C., Alonso, J. M. et al. (2000), Fisiología de las plantas.Vázquez, M. d. L. V. & Cerrillo, S. F. J. (2010), ‘Un modelo de regresión poisson inflado con ceros para analizar datos de un experimento de fungicidas en jitomate’, Memoria del 2 Encuentro Iberoamericano de Biometría y la V Reunión de la Región Centroamericana y del Caribe de la Sociedad Internacional de Biometría p. 16.Vuong, Q. H. (1989), ‘Likelihood ratio tests for model selection and non-nested hypotheses’, Econometrica: Journal of the Econometric Society pp. 307–333.Wang, K., Yau, K. K. & Lee, A. H. (2002), ‘A zero-inflated poisson mixed model to analyze diagnosis related groups with majority of same-day hospital stays’, Computer methods and programs in biomedicine 68(3), 195–203.Wilson, P. (2015), ‘The misuse of the vuong test for non-nested models to test for zero-inflation’, Economics Letters 127, 51–53.ORIGINAL2020jorgechaparro.pdf2020jorgechaparro.pdfapplication/pdf444996https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/23138/2/2020jorgechaparro.pdf6822cd5e6fa962a749835fad9753c8ebMD52open accesscartaderechosdeautor.pdfcartaderechosdeautor.pdfapplication/pdf636372https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/23138/1/cartaderechosdeautor.pdfa23895f157c99dbd47d9f365dcbbd8fbMD51metadata only accesscartaaprobaciónfacultad.pdfcartaaprobaciónfacultad.pdfapplication/pdf47163https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/23138/3/cartaaprobaci%c3%b3nfacultad.pdff3806d6ae77cd4aa27aca980387363a3MD53metadata only accessCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8701https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/23138/4/license_rdf42fd4ad1e89814f5e4a476b409eb708cMD54open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8807https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/23138/5/license.txtf6b8c5608fa6b2f649b2d63e10c5fa73MD55open accessTHUMBNAILcartaderechosdeautor.pdf.jpgcartaderechosdeautor.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg8191https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/23138/6/cartaderechosdeautor.pdf.jpg3f6c70388870b06f0e78262258a288ccMD56metadata only access2020jorgechaparro.pdf.jpg2020jorgechaparro.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg7804https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/23138/7/2020jorgechaparro.pdf.jpg366e1a10dc6f47dfa2e310c4eb41bc5cMD57open accesscartaaprobaciónfacultad.pdf.jpgcartaaprobaciónfacultad.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6452https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/23138/8/cartaaprobaci%c3%b3nfacultad.pdf.jpg1b8e89ce725fd5671cc97fe5849a3d09MD58metadata only access11634/23138oai:repository.usta.edu.co:11634/231382022-10-10 15:37:20.552open accessRepositorio Universidad Santo Tomásrepositorio@usantotomas.edu.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 |