Estudio de las interacciones entre terpenos y la enzima glucosiltransferasa del patógeno oral streptococcus mutans.
En el presente trabajo se evaluaron las interacciones no covalentes entre los terpenos citronelal geraniol y timol contra la enzima glucosiltransferasa(GTFS) de un patógeno oral conocido como streptococcus mutans uno de los responsables de las caries dentales. La principal función de la enzima GTFS...
- Autores:
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Jurado Herrera, Mario Andrés
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Universidad Santo Tomás
- Repositorio:
- Repositorio Institucional USTA
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.usta.edu.co:11634/43700
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/11634/43700
- Palabra clave:
- Docking
Streptococcus mutans
Molecular dynamics
Binding mode
Interaction energy
Enfermedades de los dientes
Dinámica molecular
Rotación molecular
Acoplamiento molecular
Streptococcus mutans
Dinámica molecular
Modo de unión
Energía de interacción
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia
| Summary: | En el presente trabajo se evaluaron las interacciones no covalentes entre los terpenos citronelal geraniol y timol contra la enzima glucosiltransferasa(GTFS) de un patógeno oral conocido como streptococcus mutans uno de los responsables de las caries dentales. La principal función de la enzima GTFS es sintetizar glucano a partir de la sacarosa desencadenando la desmineralización de los dientes lo que conlleva a la colonización de las caries. Por esta razón esta enzima es de gran interés para control de las caries dentales. Para evaluar las interacciones se utilizó técnicas computaciones como el acoplamiento molecular y dinámica molecular. Con el fin de seleccionar el mejor programa de acoplamiento se evaluaron tres programas conocidos como Autodock, Vina y Smina, donde se encontró que el programa Autodock logró reproducir las interacciones del ligando original. Además, este mismo programa logró reproducir las interacciones de otro ligando que fue empleado en un estudio teórico práctico. Después de seleccionar el programa se realizó la optimización de los terpenos y se ejecutó el acoplamiento con cada estructura. Se seleccionaron las tres primeras poses del resultado de cada acoplamiento y se encontró que esas poses presentaban en su mayoría las interacciones reportadas en la literatura. Con las tres primeras poses de cada ligando se realizó la dinámica molecular durante diez nanosegundos donde se encontró que, al incorporar los terpenos dentro de la proteína, esta adquiría estabilidad. |
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