Construcción de un modelo para la predicción de la actividad antioxidante de derivados del eugenol aplicando la relación cuantitativa estructura-actividad
En esta investigación se realizó la construcción de un modelo matemático para predecir la actividad antioxidante empleando los métodos QSAR, este modelo se construyó a partir de compuestos con actividad antioxidante repostada en la literatura como derivados del eugenol, y compuestos fenolicos entre...
- Autores:
-
Capacho Silva, Gloria Amparo
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2016
- Institución:
- Universidad Santo Tomás
- Repositorio:
- Repositorio Institucional USTA
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.usta.edu.co:11634/1734
- Acceso en línea:
- https://hdl.handle.net/11634/1734
- Palabra clave:
- Esencias
Oxidantes Fotoquímicos
Actividad antioxidante
Relación cuantitativa estructura
eugenol
Modelos matemáticos
Validación cruzada
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- openAccess
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- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia
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En esta investigación se realizó la construcción de un modelo matemático para predecir la actividad antioxidante empleando los métodos QSAR, este modelo se construyó a partir de compuestos con actividad antioxidante repostada en la literatura como derivados del eugenol, y compuestos fenolicos entre otros. El estudio inició con la optimización de la geometría empleando el método de los funcionales de la densidad (DFT) con un funcional híbrido de intercambio y correlación B3LYP y una función de base 6-31G (d). Seguidamente con el cálculo de descriptores moleculares con el DRAGON6 y el análisis estadístico MLR-Forward empleando R con su interface gráfica R-Studio. Finalmente se obtuvo un modelo presentando un coeficiente de correlación R=0,65, un Fisher de F=56, desviación estándar de s=0,86 y un coeficiente de predicción de Q=0,62 corroborando una buena capacidad predictiva en el modelo. |
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Rozo Correa, Ciro EduardoCapacho Silva, Gloria Amparo2017-05-25T20:51:11Z2017-06-24T16:41:55Z2017-05-25T20:51:11Z2017-06-24T16:41:55Z2016https://hdl.handle.net/11634/1734reponame:Repositorio Institucional Universidad Santo Tomásinstname:Universidad Santo Tomásrepourl:https://repository.usta.edu.coEn esta investigación se realizó la construcción de un modelo matemático para predecir la actividad antioxidante empleando los métodos QSAR, este modelo se construyó a partir de compuestos con actividad antioxidante repostada en la literatura como derivados del eugenol, y compuestos fenolicos entre otros. El estudio inició con la optimización de la geometría empleando el método de los funcionales de la densidad (DFT) con un funcional híbrido de intercambio y correlación B3LYP y una función de base 6-31G (d). Seguidamente con el cálculo de descriptores moleculares con el DRAGON6 y el análisis estadístico MLR-Forward empleando R con su interface gráfica R-Studio. Finalmente se obtuvo un modelo presentando un coeficiente de correlación R=0,65, un Fisher de F=56, desviación estándar de s=0,86 y un coeficiente de predicción de Q=0,62 corroborando una buena capacidad predictiva en el modelo.In this research it has been made the construction of a mathematical model to predict the antioxidant activity using the quantitative structure-activity relationship (QSAR), this model was built according to compounds with antioxidant activity refueled on literatura like eugenol derivatives and phenolic compounds, etc. The compounds selected for this study with reports of antioxidant activity expressed in Trolox equivalent antioxidant capacity were taken from literature; it was cosiderate a total of 151 compounds belong to diverse antioxidant families. The QSAR study started from the optimization of the geometry of selected compounds, using the Density Functional Theory method (DFT), with a hybrid functional of exchanging and correlation, B3LYP and a base function of 6-31G(d) Implemented on program GAUSSIAN 09. Once the structures were optimized, were proceeded to calculate the molecular descriptors with program, DRAGON6 and were selected the descriptors which have higher correlation with antioxidant activity; besides it were considered mechanic-quantum descriptors, obtained from molecules geometrical optimization (total electronic energy, energy of molecular orbitals (HOMO and LUMO), dipole moment and band gap).Químico AmbientalPregradoapplication/pdfspaUniversidad Santo TomásPregrado Química AmbientalFacultad de Química AmbientalAtribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/Abierto (Texto Completo)info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Construcción de un modelo para la predicción de la actividad antioxidante de derivados del eugenol aplicando la relación cuantitativa estructura-actividadEsenciasOxidantes FotoquímicosActividad antioxidanteRelación cuantitativa estructuraeugenolModelos matemáticosValidación cruzadaTrabajo de gradoinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisCRAI-USTA BucaramangaORIGINAL2016-CapachoSilvaGloriaAmparo-trabajodegrado.pdfTrabajo de gradoapplication/pdf3726182https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/1734/1/2016-CapachoSilvaGloriaAmparo-trabajodegrado.pdf3c8ac45de28ea5a7439ebbe76dceb48eMD51open access2016-tablaestructuras.pdfAnexoapplication/pdf676044https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/1734/2/2016-tablaestructuras.pdf8068757b7206741d81688c11ba7908edMD52open access2016-anexos2.pdfAnexoapplication/pdf259359https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/1734/3/2016-anexos2.pdf30f580287662112d30a460e6c7dbc7b3MD53open accessLICENSElicense.txttext/plain1748https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/1734/4/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD54open accessTHUMBNAIL2016-CapachoSilvaGloriaAmparo-trabajodegrado.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg8360https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/1734/5/2016-CapachoSilvaGloriaAmparo-trabajodegrado.pdf.jpg91e59a30f624935064944d964251600cMD55open access2016-tablaestructuras.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg10519https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/1734/6/2016-tablaestructuras.pdf.jpg1ad6d6e16b0eaf147d2fbee48f336cdaMD56open access2016-anexos2.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg8884https://repository.usta.edu.co/bitstream/11634/1734/7/2016-anexos2.pdf.jpg79d2f1b898596fb6f48b49422a524835MD57open access11634/1734oai:repository.usta.edu.co:11634/17342022-10-10 16:15:24.771open accessRepositorio Universidad Santo Tomásrepositorio@usantotomas.edu.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 |