Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento
NGSEP representa una solución importante para los problemas de integración y usabilidad presente en las actuales herramientas de bioinformática, en este sentido, NGSEP es un plugin de software programado en el lenguaje Java con SWT biblioteca de componentes gráficos. Con esta esta herramienta un usu...
- Autores:
-
Quintero Lopez, Juan Camilo
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2013
- Institución:
- Universidad de San Buenaventura
- Repositorio:
- Repositorio USB
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:bibliotecadigital.usb.edu.co:10819/2155
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10819/2155
- Palabra clave:
- Plugín
Sofware
Bioinformática
Ingeniería
Secuenciación de alto rendimiento
CIAT biología
Diseño de software
Desarrollo de software
Análisis de datos
- Rights
- License
- http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
| id |
SANBUENAV2_b91892e99a6a2704b8e287a933f2bef5 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:bibliotecadigital.usb.edu.co:10819/2155 |
| network_acronym_str |
SANBUENAV2 |
| network_name_str |
Repositorio USB |
| repository_id_str |
|
| dc.title.spa.fl_str_mv |
Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento |
| title |
Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento |
| spellingShingle |
Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento Plugín Sofware Bioinformática Ingeniería Secuenciación de alto rendimiento CIAT biología Diseño de software Desarrollo de software Análisis de datos |
| title_short |
Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento |
| title_full |
Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento |
| title_fullStr |
Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento |
| title_full_unstemmed |
Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento |
| title_sort |
Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento |
| dc.creator.fl_str_mv |
Quintero Lopez, Juan Camilo |
| dc.contributor.advisor.spa.fl_str_mv |
Pardo Calvache, César Jesús |
| dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
Quintero Lopez, Juan Camilo |
| dc.subject.spa.fl_str_mv |
Plugín Sofware Bioinformática Ingeniería Secuenciación de alto rendimiento CIAT biología |
| topic |
Plugín Sofware Bioinformática Ingeniería Secuenciación de alto rendimiento CIAT biología Diseño de software Desarrollo de software Análisis de datos |
| dc.subject.lemb.spa.fl_str_mv |
Diseño de software Desarrollo de software Análisis de datos |
| description |
NGSEP representa una solución importante para los problemas de integración y usabilidad presente en las actuales herramientas de bioinformática, en este sentido, NGSEP es un plugin de software programado en el lenguaje Java con SWT biblioteca de componentes gráficos. Con esta esta herramienta un usuario final puede realizar diferentes procesos de NGS (Next generation Sequencing). NGSEP garantiza tiempo de carga de archivos genéticos, almacenamiento local de archivos genéticos, distribución y mantenimiento de versiones del software. NGSEP integra a NGSTools que es un marco integrado para el descubrimiento de las variantes genómicas de los datos producidos por NGS. Integra algoritmos desarrollados anteriormente para la detección SNPs, CNV con implementaciones en Java, esta librería fue desarrollada por el Dr. Jorge Duitama Castellanos investigador en bioinformática de CIAT. |
| publishDate |
2013 |
| dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2013 |
| dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2014-08-15T15:08:33Z |
| dc.date.available.none.fl_str_mv |
2014-08-15T15:08:33Z |
| dc.date.submitted.none.fl_str_mv |
2014 |
| dc.type.spa.fl_str_mv |
Trabajo de grado - Pregrado |
| dc.type.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
| dc.type.spa.spa.fl_str_mv |
Trabajo de Grado |
| dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
| dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10819/2155 |
| url |
http://hdl.handle.net/10819/2155 |
| dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| rights_invalid_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| dc.format.medium.spa.fl_str_mv |
Recurso en linea |
| dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv |
Ingenierias |
| dc.publisher.program.spa.fl_str_mv |
Ingenieria de Sistemas |
| dc.publisher.sede.spa.fl_str_mv |
Cali |
| institution |
Universidad de San Buenaventura |
| dc.source.instname.spa.fl_str_mv |
Universidad de San Buenaventura - Cali |
| dc.source.other.spa.fl_str_mv |
Biblioteca USB, Cali. T005.12 Q7 CD-ROM |
| dc.source.reponame.spa.fl_str_mv |
Biblioteca Digital Universidad de San Buenaventura |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://bibliotecadigital.usb.edu.co/bitstreams/6905a716-50e6-4969-98af-b43a966740b8/download https://bibliotecadigital.usb.edu.co/bitstreams/40802cc3-edc1-4b3b-92fb-6f6f68a09027/download https://bibliotecadigital.usb.edu.co/bitstreams/9e50c9aa-a1c1-44bc-abb3-b189b938e7fc/download https://bibliotecadigital.usb.edu.co/bitstreams/0e33f614-7396-424e-8f90-14fa518d71b6/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
f1d2cd4b25953533175a6e39ff7dc6dc c810740ad85d8bb23e302c0c1ecdebc0 797c7c0b86549fc709b1bf416c3c194d 5247c4746b4e0075afc10d119efb2cce |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad de San Buenaventura Colombia |
| repository.mail.fl_str_mv |
bdigital@metabiblioteca.com |
| _version_ |
1812932489445900288 |
| spelling |
Comunidad Científica y AcadémicaPardo Calvache, César Jesús9c759b2b-5591-420e-926a-f9f7031b49ce-1Quintero Lopez, Juan Camilo713663cc-b920-4cf7-a96e-4bcae5375e15-12014-08-15T15:08:33Z2014-08-15T15:08:33Z20132014NGSEP representa una solución importante para los problemas de integración y usabilidad presente en las actuales herramientas de bioinformática, en este sentido, NGSEP es un plugin de software programado en el lenguaje Java con SWT biblioteca de componentes gráficos. Con esta esta herramienta un usuario final puede realizar diferentes procesos de NGS (Next generation Sequencing). NGSEP garantiza tiempo de carga de archivos genéticos, almacenamiento local de archivos genéticos, distribución y mantenimiento de versiones del software. NGSEP integra a NGSTools que es un marco integrado para el descubrimiento de las variantes genómicas de los datos producidos por NGS. Integra algoritmos desarrollados anteriormente para la detección SNPs, CNV con implementaciones en Java, esta librería fue desarrollada por el Dr. Jorge Duitama Castellanos investigador en bioinformática de CIAT.Recurso en lineaapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10819/2155spaIngenieriasIngenieria de SistemasCaliPor medio de este formato manifiesto mi voluntad de AUTORIZAR a la Universidad de San Buenaventura, Sede Bogotá, Seccionales Medellín, Cali y Cartagena, la difusión en texto completo de manera gratuita y por tiempo indefinido en la Biblioteca Digital Universidad de San Buenaventura, el documento académico-investigativo objeto de la presente autorización, con fines estrictamente educativos, científicos y culturales, en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, Ley 44 de 1993, Decisión Andina 351 de 1993, Decreto 460 de 1995 y demás normas generales sobre derechos de autor. Como autor manifiesto que el presente documento académico-investigativo es original y se realiza sin violar o usurpar derechos de autor de terceros, por lo tanto, la obra es de mi exclusiva autora y poseo la titularidad sobre la misma. La Universidad de San Buenaventura no será responsable de ninguna utilización indebida del documento por parte de terceros y será exclusivamente mi responsabilidad atender personalmente cualquier reclamación que pueda presentarse a la Universidad. Autorizo a la Biblioteca Digital de la Universidad de San Buenaventura convertir el documento al formato que el repositorio lo requiera (impreso, digital, electrónico o cualquier otro conocido o por conocer) o con fines de preservación digital. Esta autorización no implica renuncia a la facultad que tengo de publicar posteriormente la obra, en forma total o parcial, por lo cual podrá, dando aviso por escrito con no menos de un mes de antelación, solicitar que el documento deje de estar disponible para el público en la Biblioteca Digital de la Universidad de San Buenaventura, así mismo, cuando se requiera por razones legales y/o reglas del editor de una revista.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Universidad de San Buenaventura - CaliBiblioteca USB, Cali. T005.12 Q7 CD-ROMBiblioteca Digital Universidad de San BuenaventuraPlugínSofwareBioinformáticaIngenieríaSecuenciación de alto rendimientoCIAT biologíaDiseño de softwareDesarrollo de softwareAnálisis de datosIngeniero de SistemasDesarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimientoTrabajo de grado - PregradoTrabajo de Gradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fPublicationORIGINALDesarrollo_Plugin_Datos_Rendimiento_Quintero_2013.pdfDesarrollo_Plugin_Datos_Rendimiento_Quintero_2013.pdfTrabajo de Gradoapplication/pdf13709875https://bibliotecadigital.usb.edu.co/bitstreams/6905a716-50e6-4969-98af-b43a966740b8/downloadf1d2cd4b25953533175a6e39ff7dc6dcMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82111https://bibliotecadigital.usb.edu.co/bitstreams/40802cc3-edc1-4b3b-92fb-6f6f68a09027/downloadc810740ad85d8bb23e302c0c1ecdebc0MD52TEXTDesarrollo_Plugin_Datos_Rendimiento_Quintero_2013.pdf.txtDesarrollo_Plugin_Datos_Rendimiento_Quintero_2013.pdf.txtExtracted texttext/plain252471https://bibliotecadigital.usb.edu.co/bitstreams/9e50c9aa-a1c1-44bc-abb3-b189b938e7fc/download797c7c0b86549fc709b1bf416c3c194dMD53THUMBNAILDesarrollo_Plugin_Datos_Rendimiento_Quintero_2013.pdf.jpgDesarrollo_Plugin_Datos_Rendimiento_Quintero_2013.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg6756https://bibliotecadigital.usb.edu.co/bitstreams/0e33f614-7396-424e-8f90-14fa518d71b6/download5247c4746b4e0075afc10d119efb2cceMD5410819/2155oai:bibliotecadigital.usb.edu.co:10819/21552023-02-23 16:24:39.292https://bibliotecadigital.usb.edu.coRepositorio Institucional Universidad de San Buenaventura Colombiabdigital@metabiblioteca.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 |