Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento

NGSEP representa una solución importante para los problemas de integración y usabilidad presente en las actuales herramientas de bioinformática, en este sentido, NGSEP es un plugin de software programado en el lenguaje Java con SWT biblioteca de componentes gráficos. Con esta esta herramienta un usu...

Full description

Autores:
Quintero Lopez, Juan Camilo
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2013
Institución:
Universidad de San Buenaventura
Repositorio:
Repositorio USB
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:bibliotecadigital.usb.edu.co:10819/18514
Acceso en línea:
https://hdl.handle.net/10819/18514
Palabra clave:
Diseño de software
Desarrollo de software
Análisis de datos
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description NGSEP representa una solución importante para los problemas de integración y usabilidad presente en las actuales herramientas de bioinformática, en este sentido, NGSEP es un plugin de software programado en el lenguaje Java con SWT biblioteca de componentes gráficos. Con esta esta herramienta un usuario final puede realizar diferentes procesos de NGS (Next generation Sequencing). NGSEP garantiza tiempo de carga de archivos genéticos, almacenamiento local de archivos genéticos, distribución y mantenimiento de versiones del software. NGSEP integra a NGSTools que es un marco integrado para el descubrimiento de las variantes genómicas de los datos producidos por NGS. Integra algoritmos desarrollados anteriormente para la detección SNPs, CNV con implementaciones en Java, esta librería fue desarrollada por el Dr. Jorge Duitama Castellanos investigador en bioinformática de CIAT.
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