Determinación de la actividad antibacteriana del péptido Tma1, proveniente del veneno de escorpión Tityus macrochirus frente a la bacteria Pseudomona aeruginosa

La resistencia bacteriana es un tema que compete a muchos sectores; puesto que ésta es una cuestión de salud pública, pese a no ser una enfermedad como tal, si es una limitación a la hora de tratar alguna, desarrollada por diferentes microorganismos. Por lo que, se ha evidenciado últimamente, el interés por la evaluación de la actividad antimicrobiana presentada por péptidos, debido a su alta respuesta letal frente a bacterias, al entrar en contacto con su membrana celular y provocar en su lipídica la desintegración de su estructura (Bahar & Dacheng , 2013). En el siguiente trabajo de grado, se determinó la actividad antibacteriana del péptido Tma1, proveniente del veneno de escorpión Tityus macrochirus por interacciones con la proteína de membrana Pseudomonas aeruginosa OccD2 (OpdC) con código PDB 3SY9, debido a que esta se localiza en la membrana externa de la bacteria P. aeruginosa, y se caracteriza por ser una proteína que permite la absorción de los nutrientes necesarios tanto para el crecimiento como para la función celular de esta bacteria (OPM, 2005), (Eren, & otros, 2012). Por ello, para el proceso de caracterización del péptido Tma1 fueron utilizadas herramientas como InterPro y ScanProsite, y, de igual manera, mediante el servidor Swiss-Model fue posible el modelamiento de su estructura terciaria, la cual fue aceptable de acuerdo a los criterios de GMQE (Estimación de la calidad del modelo global) = 0,80; QMEANDisCo Global = 0,75±11; y favorabilidad de Ramachandran = 95,0. Finalmente, a través del programa HADDOCK 2.4 se realizó el docking molecular, (debido a que es considerado uno de los sofware insignia del Centro de Excelencia para la investigación molecular), entre el péptido Tma1 y la proteína de membrana 3SY9 de P. aeruginosa OccD2 (OpdC) (Eren, & otros, 2012). Los mejores resultados fueron reunidos en 6 grupos, siendo el grupo 3, el que presentó mejor puntaje en HADDOCK, con el péptido Tma1, de tal forma que posiblemente, este último puede inhibir el crecimiento de la proteína de membrana P. aeruginosa 3SY9 por medio de interacciones hidrofóbicas visualizadas desde los programas LigPlot y UCSF Chimera.

• Autores: Lugo Damián, Angie Carolina; Martínez Loaiza, Erika Manuela
• Tipo de recurso: Trabajo de grado de pregrado
• Fecha de publicación: 2023
• Institución: Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A
• Repositorio: Repositorio Institucional UDCA
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repository.udca.edu.co:11158/5216
• Acceso en línea: https://repository.udca.edu.co/handle/11158/5216; https://repository.udca.edu.co/
• Palabra clave: Tityus macrochirus; Acoplamiento molecular; T mal; Escorpiones; Pseudomonas aeruginosa; Péptidos
• Rights: openAccess
• License: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/legalcode.es