Predicción de las interacciones que se presentan entre el péptido Tma1, derivado del veneno de escorpión Tityus macrochirus y la caspasa -3 como inductor apoptótico para las células derivadas de cáncer de próstata y cérvix

El cáncer de cérvix y el de próstata se clasifican como algunos de los canceres con mayor incidencia a nivel mundial y afectan a miles de personas anualmente en Colombia, estos dos tipos de cáncer tienen en común su mediación por la caspasa -3 y se pueden tratar mediante diferentes estrategias terapéuticas, sin embargo, algunas de ellas impiden el desarrollo de la calidad de vida del paciente o no presentan medidas de efectividad destacables debido a la no discriminación de células cancerosas y sanas. Es por ello, que el presente trabajo de investigación pretende estudiar la interacción del péptido Tma1 que se encuentra en el veneno de escorpión Tityus macrochirus, y la caspasa -3, y si esta interacción es capaz de inducir la apoptosis en células derivadas de cáncer. La metodología desarrollada para resolver el objetivo del trabajo emplea múltiples herramientas bioinformáticas, las cuales aportaron a la predicción de la estructura terciaria obtenida por medio de SwissModel, y determinando un modelo favorable, de acuerdo con la evaluación con GMQE (Estimación de la calidad del modelo global) con un puntaje de 0,80, puntaje de MolProbity=1,30 y favorabilidad de Ramachandran de 95,0. Una vez obtenida la estructura tridimensional del péptido Tma1 e identificada la caspasa -3 y el sustrato DEVD en su estructura tridimencional, se realizaron tres acoplamientos moleculares con HADDOCK 2.4 entre el péptido Tma1, la caspasa -3 y el sustrato DEVD, de cada uno de ellos se evaluaron las interacciones obtenidas con el fin de identificar cambios entre las interacciones o conformacionales de las proteínas que pudieran presentarse al momento de la unión del péptido o el sustrato a la proteína. Las interacciones fueron evaluadas por Biovia Discovery Studio, de las cuales se obtuvieron interacciones en su mayoría de tipo no covalentes. Por último, se realizaron tres dinámicas moleculares con cada una de las estructuras resultantes de los acoplamientos moleculares, con el fin de realizar la comparativa en los cambios y las interacciones evaluadas previamente, los cambios identificados al igual que las interacciones demostraron favorabilidad para la inducción de la apoptosis en la caspasa -3 mediante el péptido Tma1, además de demostrar un desplazamiento del sustrato en el sitio activo de la caspasa, elucidando así un posible mecanismo de acción de la caspasa -3 ante el péptido Tma1 del escorpión T. macrochirus

• Autores: Durango Bohórquez, Ana María
• Tipo de recurso: Trabajo de grado de pregrado
• Fecha de publicación: 2023
• Institución: Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A
• Repositorio: Repositorio Institucional UDCA
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repository.udca.edu.co:11158/5530
• Acceso en línea: https://repository.udca.edu.co/handle/11158/5530; https://repository.udca.edu.co/
• Palabra clave: Péptidos; Acoplamiento molecular; Neoplasias del Cuello Uterino; Neoplasias de la Próstata; Dinámica molecular; Escorpiones
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