Estudio teórico de acoplamiento molecular de Alquil benzoquinonas y Alqil fenoles con el dominio BIR3 de la proteina XIAP

Los inhibidores de apoptosis (IAP) son un grupo de ocho proteinas (Apollon, cIAP1, cIAP2, XIAP, NAIP, Survivin, Livin y ILP-2) que poseen una funcion conservada evolutivamente para regular la muerte celular programada en las celulas animales desde insectos hasta los seres humanos. Dentro de la familia de las IAP se encuentra XIAP (X-linked inhibitor of apoptosis), proteina anti-apoptotica que es considerada como el inhibidor mas potente por su alta selectividad en la inhibicion de las caspasas 3, 7 y 9, que son las principales proteinas iniciadoras y ejecutoras de apoptosis. Naturalmente, XIAP es inhibida por la proteina mitocondrial Smac/DIABLO que tiene como funcion principal la regulacion de los inhibidores de apoptosis. Sin embargo, debido a la sobre expresion de la proteina anti-apoptotica XIAP en células de muchos tipos de cáncer, la cantidad de Smac liberado desde la mitocondria no es su ciente para controlar los niveles de XIAP evitando que la célula entre en proceso de muerte celular programada. Basado en la perturbacion del mecanismo de apoptosis debido a la sobre expresion XIAP, y en búsqueda de bloquear su capacidad inhibidora, en este estudio se evaluaron 16 moléculas que se distribuyen en dos moléculas con núcleo alquil benzoquinona y catorce con núcleo alquil fenol mediante la metodologia de docking molecular con el paquete computacional AutoDock 4.2, con el objetivo de determinar el complejo más estable que indique la inhibición de la proteina anti-apoptotica. En este estudio se hace uso de la metodologia de docking molecular debido a que permite hacer la prediccion de la conformacion preferida de una molecula (ligante) con respecto a una macromolecula de estructura conocida (receptor) y de esta forma determinar la estabilidad de este complejo. La optimizacion de geometria de las moléculas ligante se realizó usando el paquete computacional Gaussian 09 bajo la teoria de los funcionales de la densidad (DFT), al nivel de teor a B3LYP/6-31G. En este estudio, se obtuvo como resultado que las mol eculas MS4, MS6, MS10, MS11 y MS13 presentan la mayor a nidad con el receptor, siendo MS11 (-6,52 kcal/mol) el ligante que forma el complejo mas af n. Se encontr o que el ligante puede presentar a nidad con otros sitios sobre la super ficie de la proteina, por esta razon la localizacion inicial del ligante con respecto al receptor debe ser evaluada realizando variaciones de las coordenadas iniciales del grid para establecer el sitio activo con la mayor exactitud.xi

• Autores: Hernández Hernández, Michael Alexander
• Tipo de recurso: Trabajo de grado de pregrado
• Fecha de publicación: 2015
• Institución: Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A
• Repositorio: Repositorio Institucional UDCA
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repository.udca.edu.co:11158/4495
• Acceso en línea: https://repository.udca.edu.co/handle/11158/4495; https://repository.udca.edu.co
• Palabra clave: Apoptosis; Muerte Celular; Quinonas; Fenoles
• Rights: closedAccess
• License: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/legalcode.es