Identificación de isoformas producto de empalme alternativo en el gen ama1 de Toxoplasma gondii
El empalme alternativo de genes produce diferentes transcritos de ARNm a partir de un solo gen. Aunque no se ha valorado su importancia en los genes de Toxoplasma, su alta frecuencia en genes eucariotas sugiere que este es uno de los mecanismos más importantes en el aumento de la diversidad proteica...
- Autores:
-
Hernández de los Ríos, Alejandro
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2008
- Institución:
- Universidad del Quindío
- Repositorio:
- Repositorio Universidad del Quindío
- Idioma:
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- Acceso en línea:
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Isoformas
Toxoplasma gondii
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El empalme alternativo de genes produce diferentes transcritos de ARNm a partir de un solo gen. Aunque no se ha valorado su importancia en los genes de Toxoplasma, su alta frecuencia en genes eucariotas sugiere que este es uno de los mecanismos más importantes en el aumento de la diversidad proteica. Como todas las proteínas de micronemas, AMA1 es secretada por los taquizoítos de Toxoplasma durante el proceso de invasión, siendo una de las piezas indispensables para dicho proceso. |
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MARCO TEORICO 13 3.1 Toxoplasma gondii 13 3.1.1 Ciclo de vida de T. gondii 14 3.1.2 Organelas secretoras de T. gondii 15 3.1.3 Genómica de Toxoplasma gondii 16 3.2 Proteína AMA1 17 3.3 Empalme alternativo de genes 19 3.3.1 Bioinformática y empalme alternativo de genes 23 3.3.2 Evidencia Bioinformática para el empalme alternativo de genes 24 3.3.3 Empalme alternativo y proteínas relacionadas en Toxoplasma gondii 25 4. METODOLOGIA 27 4.1. Herramientas Bioinformáticas 27 4.2. Extracción y Selección de isoformas 28 4.3. Fase experimental 29 4.3.1. Cultivo de parásitos 29 4.3.2. Diseño de cebadores 29 4.3.3. Extracción de ARN del parasito y RT-PCR 31 4.3.4. PCR y Electroforesis 31 5. RESULTADOS 33 5.1. Proteína Tg-AMA1 33 5.1.1. Exones e Intrones del gen Tg-ama1 33 5.1.2. Sitios Donadores y Aceptores del gen Tg-ama1 34 5.1.3. Secuencias ESEs en los exones de Tg-ama1 36 5.1.4. Regiones transmembranales de la proteína Tg-AMA1 37 5.1.5. Señal peptídica y sitios de clivaje 39 5.2. Genes Ortólogos de Tg-AMA1 40 5.3. Identificación de Isoformas del gen Tg-ama1 42 6. DISCUSIÓN 53 6.1. Organización exón-intron del Tg-AMA1 53 6.2. Genes ortólogos de Tg-ama1 54 6.3. Empalme alternativo de Tg-AMA1 56PregradoBiólogoapplication/pdfspaDerechos reservados - Universidad del Quindíohttps://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Identificación de isoformas producto de empalme alternativo en el gen ama1 de Toxoplasma gondiiTrabajo de grado - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionTexthttps://purl.org/redcol/resource_type/TPhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Empalme alternativoIsoformasToxoplasma gondiiAjioka J., et al. 1998. Gene discovery by EST sequencing in Toxoplasma gondii reveals sequences restricted to the Apicomplexa. Genome Res 8, 18-28.Boguski M., et al. 1993. dbEST – database for “expressed sequence tags”. Nat Genet 4, 332-333Bonizzoni P., et al. 2006. Computational methods for alternative splicing prediction. Briefings in functional genomics and proteomics. Vol 5. No I. 46 – 51Boothroyd J., et al. 1997. Genetic and biochemical analysis of development in Toxoplasma gondii. Phil.Trans. R. Soc. Lond. B. 352, 1347^1354Brecht S., et al. 2001. The Toxoplasma micronemal protein Mic4 is an adhesin composed of six conserved apple domains. The Journal of Biology Chemistry. Vol 276, No. 6. Issue of February 9Facultad de Ciencias Básicas y TecnologíasArmenia, QuindíoCiencias Básicas y Tecnologías - BiologíaPublicationORIGINALDocumento final.pdfDocumento final.pdfapplication/pdf1403375https://bdigital.uniquindio.edu.co/bitstreams/93d94aa1-463b-470c-b25f-5e9384060534/download6890698b00c9955581534c28b912b2caMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-814828https://bdigital.uniquindio.edu.co/bitstreams/f23ff781-8e65-4edb-9311-87be270c1b61/download2f9959eaf5b71fae44bbf9ec84150c7aMD52TEXTDocumento final.pdf.txtDocumento final.pdf.txtExtracted texttext/plain111291https://bdigital.uniquindio.edu.co/bitstreams/09395633-1067-4524-9d9b-fe120fd34515/downloadb8a6b95138a2fef010875a12661198d1MD53THUMBNAILDocumento final.pdf.jpgDocumento final.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg7023https://bdigital.uniquindio.edu.co/bitstreams/09c6aab9-846e-48d8-b29b-60915fe48938/download27c64f757ba236a4e893d3f7b1d7f6cbMD54001/5740oai:bdigital.uniquindio.edu.co:001/57402024-06-07 11:08:41.282https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Derechos reservados - Universidad del Quindíorestrictedhttps://bdigital.uniquindio.edu.coBiblioteca Digital Universidad del 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