Búsqueda de nuevas proteínas con función de adhesión en protozoos infecciosos encontradas con una máquina de aprendizaje (ApiPredictorUniQ_E)
Muchos protozoos afectan negativamente al hombre y animales de importancia económica, provocando parasitosis que causan problemas de salud pública y pérdidas comerciales. Existen proteínas con función desconocida (hipotéticas) en protozoos parásitos que son importantes en las etapas de infección sob...
- Autores:
-
Rios Londoño, Mariana
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2016
- Institución:
- Universidad del Quindío
- Repositorio:
- Repositorio Universidad del Quindío
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- Acceso en línea:
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Muchos protozoos afectan negativamente al hombre y animales de importancia económica, provocando parasitosis que causan problemas de salud pública y pérdidas comerciales. Existen proteínas con función desconocida (hipotéticas) en protozoos parásitos que son importantes en las etapas de infección sobre sus hospedadores; nosotros buscamos proteínas con función adhesinas en 26 proteomas de protozoos infecciosos (Entamoeba histolytica, Cryptosporidium parvum, Giardia, Microsporidia salmonicida, M. nematocida parisii, M. Spraguea lophii, Theileria annulata, Plasmodium berghei, P. falciparum, P. vivax, P. yoelii, Eimeria tenella, Neospora caninum liverpool, Toxoplasma gondii GT1, T. gondii ME49, Leishmania braziliensis, L. major, L.infantum, L. mexicana, L. donovanii, T.brucei y T. cruci). Nosotros analizamos 10865 proteínas, de las cuales 1585 se identificaron con función de adhesión según el análisis de las secuencias de aminoácidos minadas por el software ApiPredictorUniQ_E, siendo de estas 515 hipotéticas. |
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AGUDO PENA, Sonia. Estudio molecular de los factores de virulencia y de la resistencia a claritromicina en la infección por Helicobacter pylori. Madrid, 2010; 197p. Tesis de grado (Doctor). Universidad Computense de Madrid. Facultad de medicina departamento de microbiología. ISBN: 978- 84-693-7739-0 ARENAS, Ailand, SALCEDO, Gladys, MONCADA, Diego, ERAZO, Diego, OSORIO, Juan y GÓMEZ, Jorge Enrique. Análisis de conglomerado para identificar las características de composición de aminoácidos que indican proteínas adhesinas de Toxoplasma gondii. En: Bioinformación. 8(19): 916- 923 (2012) BAI, Tao; BECKER, Michael, GUPTA, Aditi, STRIKE, Phillip, MURPHY, Vince, MILLER Louis. (2005) Estructura de AMA1 de Plasmodium falciparum revela una agrupación de polimorfismos que rodean un bolsillo hidrofóbico conservado. 12736–12741 _ PNAS _ Septimebre 6, _ vol. 102 _ no. 36 www.pnas.org_cgi_doi_10.1073_pnas.0501808102 BROWN, Philip J; GILL, Andrew C; NUGENT, Philip, McVey, John y TOMLEY, Fiona. Dominios de proteínas de invasión de los organelos de parásitos Apicomplejos son homólogos con dominios de Apple y factor de Coagulacion XI y precalicreína del plasma y miembros de la superfamilia PAN. FEBS Lett. 2001 18 de mayo; 497 (1): 31-38. 0014-5793 / 01 / $20.00 ß 2001. Publicado por Elsevier científico B.V. De la Federación de Sociedades Europeas de Bioquímica. PII: S 0 0 1 4 - 5 7 9 3 ( 0 1 ) 0 2 4 2 4 – 3 CHEN, Zhong. HARB, Omar. S. y ROOS, David. S. (2008). Identificación In Silico de organelos especializados en la secreción de proteínas en parásitos Apicomplejos y validación In Vivo en Toxoplasma gondii. PLoS ONE, 3(10), e3611. http://doi.org/10.1371/journal.pone.0003611 CRAWFORD, J., GRUJIC, O., BRUIC, E., CZJZEK, M., GRIGG, M. E., Y BOULANGER, M. J. (2009). Caracterización estructural de la superficie bradizoíto antígeno (BSR4) de Toxoplasma gondii, una adición única a la antígeno de superficie de la glucoproteína 1 relacionado con Superfamilia. La revista de química biológica, 284 (14), 9192 a 9198. GRANDA, Sonia y JIMÉNEZ, Marta PALUDISMO: el desarrollo de una vacuna Granda.Servicio de Microbiología. Hospital Clínico Universitario de Valencia.Control de Calidada SEIM. P 1 de 10. Consultado 2016 en: www.seimc.org/contenidos/ccs/revisionestematicas/parasitologia/VacuMal.p df MILLON, Pascal, WOLLEY, Ian, WOOD, Erica, KASTENS, W, ZIMMERMAN, Peter y ADAMS, John. Heterocigocidad del promotor nulo Duffy reduce la expresión DARC y anula la adhesión del ligando de P. vivax requerido para el estadío sanguíneo de infección. FEBS. Federación de las Sociedades Europeas de Bioquímica. Publicado por Elsevier. Cartas. 495 (2001) 111-114. QIANG, Zhong, HARB, Omar y ROSS, David. Identificación in silico de proteínas secretadas por organelos en parásitos Apicomplejos y validación in vivo en Toxoplasma gondii. PLoS ONE 3(10): e3611 (2008). doi:10.1371/journal.pone.0003611 SMITH, Joseph, CHITNIS, Chetan, CRAIG, Alister, ROBERTS, David, HUDSON-TAYLOR, Diana, PETERSON, David, PINCHES, Robert, NEWBOLD, Chris y MILLER, Louis. Interruptores en la expresión de genes VW de Plasmodium falciparum correlacionados con cambios en fenotipos citoadherentes y antigénicos de la infección de eritrocitos. Cell, Vol. 82, 101-110, Julio 14, 1995, por Cell Press TREJOS-SUAREZ, Juanita y CASTAÑO-OSORIO, Jhon Carlos. Factores de virulencia del patógeno intestinal Entamoeba histolytica. Infect. [En línea]. 2009, vol.13, n.2 [cited 2015-08-05], pp. 100-110 .Disponible 2016 en: (http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0123- 93922009000200005&lng=en&nrm=iso). ISSN 0123-9392. Chitnis CE. Signos moleculares dentro de receptores usados por parásitos de la malaria para la invasión de eritrocitos. Curr Opin Hematol 2001;8(2):85–91. |
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Spraguea lophii, Theileria annulata, Plasmodium berghei, P. falciparum, P. vivax, P. yoelii, Eimeria tenella, Neospora caninum liverpool, Toxoplasma gondii GT1, T. gondii ME49, Leishmania braziliensis, L. major, L.infantum, L. mexicana, L. donovanii, T.brucei y T. cruci). Nosotros analizamos 10865 proteínas, de las cuales 1585 se identificaron con función de adhesión según el análisis de las secuencias de aminoácidos minadas por el software ApiPredictorUniQ_E, siendo de estas 515 hipotéticas.1.Introducción 6-- 2. Materiales y métodos 51-- 3. Resultados 53-- 4. Discusión 58--5. Conclusiones 68-- 6. Bibliografía --71PregradoBiólogo177 páginasapplication/pdfspahttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Búsqueda de nuevas proteínas con función de adhesión en protozoos infecciosos encontradas con una máquina de aprendizaje (ApiPredictorUniQ_E)Trabajo de grado - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisTexthttps://purl.org/redcol/resource_type/TPhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bccemodelos ocultos markovprotozoos patógenosAGUDO PENA, Sonia. Estudio molecular de los factores de virulencia y de la resistencia a claritromicina en la infección por Helicobacter pylori. Madrid, 2010; 197p. Tesis de grado (Doctor). Universidad Computense de Madrid. Facultad de medicina departamento de microbiología. ISBN: 978- 84-693-7739-0ARENAS, Ailand, SALCEDO, Gladys, MONCADA, Diego, ERAZO, Diego, OSORIO, Juan y GÓMEZ, Jorge Enrique. Análisis de conglomerado para identificar las características de composición de aminoácidos que indican proteínas adhesinas de Toxoplasma gondii. En: Bioinformación. 8(19): 916- 923 (2012)BAI, Tao; BECKER, Michael, GUPTA, Aditi, STRIKE, Phillip, MURPHY, Vince, MILLER Louis. (2005) Estructura de AMA1 de Plasmodium falciparum revela una agrupación de polimorfismos que rodean un bolsillo hidrofóbico conservado. 12736–12741 _ PNAS _ Septimebre 6, _ vol. 102 _ no. 36 www.pnas.org_cgi_doi_10.1073_pnas.0501808102BROWN, Philip J; GILL, Andrew C; NUGENT, Philip, McVey, John y TOMLEY, Fiona. Dominios de proteínas de invasión de los organelos de parásitos Apicomplejos son homólogos con dominios de Apple y factor de Coagulacion XI y precalicreína del plasma y miembros de la superfamilia PAN. FEBS Lett. 2001 18 de mayo; 497 (1): 31-38. 0014-5793 / 01 / $20.00 ß 2001. 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Trabajo de grado Búsqueda de nuevas proteínas con función de adhesión en protozoos infecciosos encontradas con una máquina de aprendizaje (ApiPredictorUniQ_E)application/pdf1876059https://bdigital.uniquindio.edu.co/bitstreams/edd66ec5-2a2b-4e3d-98f4-f737d998509c/download37c4141f98a09d5ab61bd5d60723d9a6MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-814828https://bdigital.uniquindio.edu.co/bitstreams/b06fb9ee-ef5a-47b0-9c4f-5f7fec56fbfd/download2f9959eaf5b71fae44bbf9ec84150c7aMD52TEXTTrabajo de grado Mariana Rios.pdf.txtTrabajo de grado Mariana Rios.pdf.txtExtracted texttext/plain217041https://bdigital.uniquindio.edu.co/bitstreams/2f17baa6-6e71-40d1-9865-97d08c2f5ef1/downloada669f98432d7b3bc29e179a9f6092f85MD53THUMBNAILTrabajo de grado Mariana Rios.pdf.jpgTrabajo de grado Mariana Rios.pdf.jpgGenerated 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