Comparación y utilidad de tres métodos de extracción de ADN a partir de potenciales vectores de enfermedades rickettsiales (Acari: Ixodidae) en Colombia.
Artículo digital.
- Autores:
-
Guevara Vega, Marco
Paternina, Luis E.
Blanco Tuiran, Pedro
Vertel Morinson, Melba
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad de Sucre
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- Repositorio Unisucre
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- Acceso en línea:
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Acción gubernamental
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In this study, three methods were compared DNA extraction from ticks complex Rhipicephalus sanguineus based on: chaotropic guanidine thiocyanate (method 1), high salt (method 2) and an extraction method based on commercially available columns (Method 3). The DNA was quantified and the quality of each extract in the amplification of the 16S gene ticks (360pb) was evaluated, a nonparametric Kruskal-Wallis one-way analysis was performed, while comparing the amplification efficiency of mitochondrial gene was performed by Dunn test range. Method 3 allowed the amplification of the 16S gene of ticks in 100% (30/30) followed by method 1 with 93.33% (28/30) and finally with method 2 86.66% (26/30). The three methods are efficient at extracting genetic material of high quality tick-borne studies since their performance in amplification of mitochondrial genes tick agents.El estudio de enfermedades transmitidas por garrapatas como rickettsiosis, es de gran interés a nivel médico-veterinario y requiere la utilización de extractos de ADN de buena calidad para posteriores análisis de amplificación de genes de estos agentes patógenos. En este estudio se compararon tres métodos de extracción de ADN a partir de garrapatas del complejo Rhipicephalus sanguineus basados en: agente caotrópico Tiocianato de Guanidina (método 1), alta concentración de sales (método 2) y un método de extracción basado en columnas disponible comercialmente (método 3). El ADN obtenido fue cuantificado y se evaluó la calidad de cada extracto en la amplificación del gen 16S de garrapatas (360pb), se realizó una prueba no paramétrica de Kruskal-Wallis, mientras que la comparación de la eficiencia de amplificación del gen mitocondrial fue realizada por una prueba de rango de Dunn. Con el método 3 permitió la amplificación del gen 16S de garrapatas en 100% (30/30), seguida por el método 1 con 93.33% (28/30) y finalmente el método 2 con 86.66% (26/30). Los tres métodos son eficientes en la extracción de material genético de alta calidad para estudios de agentes transmitidos por garrapatas dado su desempeño en la amplificación de genes mitocondriales de garrapatas.application/pdfspaBogotá, Colombia: Memorias XXV Simposio Internacional De Estadística, 2015.Revista.Aljanabi S, Martinez I. 1997. Universal and rapid salt-extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques. Nucleic Acids Research. 25 (22): 4692-4693.Chomkzynski P. 1993. 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Journal of Computational and Graphical Statistics, 5(3):299–314.Derechos Reservados - Universidad de Sucre, 2019https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2simposioestadistica.unal.edu.co › memorias › MEMORIAS_2015.Comparación y utilidad de tres métodos de extracción de ADN a partir de potenciales vectores de enfermedades rickettsiales (Acari: Ixodidae) en Colombia.Comparison and usefulness of three methods of DNA extraction from potential vectors of rickettsial diseases (Acari: Ixodidae) in Colombia.Artículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501Texthttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Trabajo infantilNiñosAcción gubernamentalPublicationORIGINALComparación y utilidad de tres métodos de extracción de ADN a partir de potenciales vectores de enfermedades rickettsiales (Acari Ixodidae) en Colombia..pdfComparación y utilidad de tres métodos de extracción de ADN a partir de potenciales vectores de enfermedades rickettsiales (Acari Ixodidae) en Colombia..pdfapplication/pdf280430https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/2466447e-0c60-4108-adf1-cac610df4668/downloadafaa519c37a18112195eb9d2ea0e4bb8MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81366https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/3621b10e-303a-4b93-b790-6c275c88068f/download5f839364c91422e4b2a78812717048fbMD52TEXTComparación y utilidad de tres métodos de extracción de ADN a partir de potenciales vectores de enfermedades rickettsiales (Acari Ixodidae) en Colombia..pdf.txtComparación y utilidad de tres métodos de extracción de ADN a partir de potenciales vectores de enfermedades rickettsiales (Acari Ixodidae) en Colombia..pdf.txtExtracted texttext/plain9458https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/4653c58a-8c06-4cf4-9dd6-e1a647ced864/download6ff7db4e88af594cf724b98474c094beMD55THUMBNAILComparación y utilidad de tres métodos de extracción de ADN a partir de potenciales vectores de enfermedades rickettsiales (Acari Ixodidae) en Colombia..pdf.jpgComparación y utilidad de tres métodos de extracción de ADN a partir de potenciales vectores de enfermedades rickettsiales (Acari Ixodidae) en Colombia..pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg12813https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/0022edd0-0468-4293-82f8-7d4503320bb7/download2733e9eeedf4efa2d124693e4ed2ddf5MD56001/967oai:repositorio.unisucre.edu.co:001/9672024-04-17 16:31:16.015https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Derechos Reservados - Universidad de Sucre, 2019open.accesshttps://repositorio.unisucre.edu.coRepositorio Institucional Universidad de Sucrebdigital@metabiblioteca.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 |