Predicción de la estructura secundaria del tRNASer (UCN) mitocondrial del flebotomíneo Lutzomyia hartmani (Diptera: Psychodidae).
Artículo digital.
- Autores:
-
Pérez Doria, Alveiro
Bejarano, Eduar E.
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad de Sucre
- Repositorio:
- Repositorio Unisucre
- Idioma:
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- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unisucre.edu.co:001/849
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unisucre.edu.co/handle/001/849
- Palabra clave:
- Flebotomíneos
Lutzomyia hartmanni
ADN mitocondrial
Leishmaniasis
Colombia
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- Derechos Reservados - Universidad de Sucre, 2019
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The tRNASer gene length was 68 nucleotide pairs, with an average adenine-thymine content of 80,9%. The studied tRNASer differs from other sand fly tRNASer known to date, on the basis of its primary and secondary structure. The observed number of intrachain base pairing was 7 in the acceptor arm, 3 in the dihydrouridine (DHU) arm, 5 in the anticodon arm, and 5 in the ribothymidine-pseudouridine-cytosine (T C) arm. The size of the DHU, anticodon, variable and T C loops was estimated to be 5, 7, 4, and 8 nucleotides, respectively. The notorious absence of non-Watson-Crick base pairs in the four arms of the tRNASer distinguishes that of L. hartmanni from others Lutzomyia spp.Lutzomyia (Helcocyrtomyia) hartmanni es un flebotomíneo implicado en la transmisión de Leishmania (Viannia) colombiensis, uno de los agentes etiológicos de leishmaniasis cutánea en Colombia. El objetivo de este trabajo fue explorar la utilidad potencial del RNA de transferencia mitocondrial para Serina (UCN) (tRNASer), en la discriminación taxonómica de L. hartmanni. El DNA mitocondrial se extrajo, amplificó y secuenció a par- tir de material entomológico recolectado en Envigado, Antioquia, Colombia. El gen tRNASer de L. hartmanni mostró una longitud de 68 pares de bases, con un contenido AT del 80,9%. Éste se diferencia de los demás tRNASer de Lutzomyia conocidos a la fecha tanto por sustituciones en la secuencia primaria de nucleótidos como por los cambios que éstas generan en la estructura secundaria. El número de apareamientos intracate- narios fue siete en el brazo aceptor del aminoácido, tres en el brazo dihidrouridina (DHU), cinco en el brazo del anticodón y cinco en el brazo ribotimidina-pseudouridina- citosina (T C). El tamaño de las lupas DHU, anticodón, variable y T C correspondió a cinco, siete, cuatro y ocho nucleótidos, respectivamente. La ausencia notoria de pares de bases no-Watson-Crick en los cuatro brazos del tRNASer de L. hartmanni, la distingue de otras especies de Lutzomyia.application/pdfspaBogotá, Colombia: Acta Biológica Colombiana , 2011.RevistaALBERTS B, JOHNSON A, LEWIS J, RAFF M, ROBERTS K, WALTER P. Molecular biology of the cell. 4 ed. New York: Garland Science; 2002.ARRIVILLAGA JC, NORRIS DE, FELICIANGELI MD, LANZARO GC. Phylogeography of the neotropical sand fly Lutzomyia longipalpis inferred from mitochondrial DNA sequences. Infect Genet Evol. 2002; 2(2):83-95.BEARD CB, HAMM DM, COLLINS FH. The mitochondrial genome of the mosquito Anopheles gambiae: DNA sequence, genome organization, and comparisons with mitochondrial sequences of other insects. Insect Mol Biol. 1993; 2(2):103-124.BEATI L, CÁCERES AG, LEE JA, MUNSTERMANN LE. Systematic relationships among Lutzomyia sand flies (Diptera: Psychodidae) of Peru and Colombia based on the analysis of 12S and 28S ribosomal DNA sequences. Int J Parasitol. 2004; 34(2): 225-234.BEJARANO EE, ROJAS W, URIBE S, VÉLEZ ID, PORTER CH. Genetic analysis of a recently detected urban population of Lutzomyia evansi (Diptera: Psychodidae) in Colombia. Rev Soc Entomol Argent. 2009; 68 (1-2):1-7.Derechos Reservados - Universidad de Sucre, 2019https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol.Predicción de la estructura secundaria del tRNASer (UCN) mitocondrial del flebotomíneo Lutzomyia hartmani (Diptera: Psychodidae).Prediction of the Secondary Structure of the Mitochondrial tRNASer (UCN) of Lutzomyia hartmanni (Diptera: Psychodidae).Artículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501Texthttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85FlebotomíneosLutzomyia hartmanniADN mitocondrialLeishmaniasisColombiaPublicationORIGINALPredicción de la estructura secundaria del tRNASer (UCN) mitocondrial del flebotomíneo Lutzomyia hartmani (Diptera Psychodidae).pdfPredicción de la estructura secundaria del tRNASer (UCN) mitocondrial del flebotomíneo Lutzomyia hartmani (Diptera Psychodidae).pdfapplication/pdf268124https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/558b0565-4208-411a-a83a-0c03423a32d0/downloade5294393c00bdfd52be5e6c73cd7190fMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81366https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/a0275627-8e33-46cb-9f0c-148c26a71d9c/download5f839364c91422e4b2a78812717048fbMD52TEXTPredicción de la estructura secundaria del tRNASer (UCN) mitocondrial del flebotomíneo Lutzomyia hartmani (Diptera Psychodidae).pdf.txtPredicción de la estructura secundaria del tRNASer (UCN) mitocondrial del flebotomíneo Lutzomyia hartmani (Diptera Psychodidae).pdf.txtExtracted texttext/plain24543https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/8f52d5d0-7a36-404b-970c-d6816b0a0c08/downloaded86d83f1f36ea0f2972ce42e60d13a1MD55THUMBNAILPredicción de la estructura secundaria del tRNASer (UCN) mitocondrial del flebotomíneo Lutzomyia hartmani (Diptera Psychodidae).pdf.jpgPredicción de la estructura secundaria del tRNASer (UCN) mitocondrial del flebotomíneo Lutzomyia hartmani (Diptera Psychodidae).pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg9756https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/35957f26-81fa-4760-80be-b887701fd981/download74881479557502de21be7d638d51e352MD56001/849oai:repositorio.unisucre.edu.co:001/8492024-04-17 16:29:55.973https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Derechos Reservados - Universidad de Sucre, 2019open.accesshttps://repositorio.unisucre.edu.coRepositorio Institucional Universidad de Sucrebdigital@metabiblioteca.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 |