Caracterización molecular del asno criollo colombiano Equus asinus en el departamento de Sucre usando marcadores moleculares tipo RAMs

64 hojas

Autores:
Medina Montes, Adrian
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2019
Institución:
Universidad de Sucre
Repositorio:
Repositorio Unisucre
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unisucre.edu.co:001/986
Acceso en línea:
https://repositorio.unisucre.edu.co/handle/001/986
Palabra clave:
Asno Criollo Colombiano- Investigación
Burro Criollo
Diversidad Genética
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openAccess
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El objetivo del presente trabajo fue caracterizar genéticamente el asno criollo colombiano Equus asinus en el departamento de Sucre, usando microsatélites amplificados al azar. Para ello se utilizaron 100 individuos ubicados en las cinco subregiones del departamento, se extrajo el ADN y se amplificó por PCR siete cebadores RAMs, dos de los cuales fueron monomórficos y excluidos de los análisis. Se encontraron un total de 291 bandas, 11.96±1.45 en promedio por cebador, el valor más alto en CCA (18±2.23) y el menor en TG y GT (8.8±0.44). El cebador más polimórfico (88.09±10.91%) y con mayor He (0.376±0.021) fue CA, mientras que el menor fue GT (34.12±7.06% y 0.101±0.040 para % de loci polimórfico y He, respectivamente), aunque solo en este marcador se encontraron loci poco frecuentes. El análisis intrapoblacional mostró un promedio de 66.50±1.72 bandas de las cuales el 89.86±24.04% fueron polimórficas. La subpoblación GO presento el mayor número de bandas (63) y el menor se encontró en MO (48), sin embargo, el valor más alto % de loci polimórfico (81.16%) y He (0.335±0.022) se encontró en la subpoblación MM, siendo esta la más diversa. El promedio de diversidad genética encontrado fue de 0.351±0.021 para toda la población. El análisis de estructura poblacional mostró, un 10% de variación entre subpoblaciones, con un valor de FST de 0.17±0.01 (p<0.05). Las distancias genéticas entre subpoblaciones ubican a MO y GO como las distantes. Se concluye que los marcadores RAMs con eficientes evaluando la diversidad genética del asno, esta raza criolla tienen medios valores de diversidad genética, además, que la estructura genética encontrada puede ser resultado de las barreras geográficas naturales en las subregiones estudiadas.PregradoZootecnistaapplication/pdfspaUniversidad de SucreFacultad Ciencias AgropecuariasZootecniaDerechos Reservados - Universidad de Sucre, 2019https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Disco de computadoraCaracterización molecular del asno criollo colombiano Equus asinus en el departamento de Sucre usando marcadores moleculares tipo RAMsTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/updatedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttps://purl.org/redcol/resource_type/TPhttp://purl.org/coar/version/c_dc82b40f9837b551Acuña, W. 2016. “Determinación de la diversidad y estructura genética de patos criollos (Cairina moschata L. 1758) de los departamentos de Lambayeque y San Martín mediante el uso de microsatélites”. Grado, Lima, Perú: Universidad Mayor de San Marcos. http://cybertesis.unmsm.edu.pe/handle/cybertesis/5208.Alzate M, Luis Angel. 1978. “Nuestros equinos: caballos, asnos y mulas Aranguren, J, J Jordana, y M Gomez. 2001. “Genetic diversity in Spanish donkey breeds using microsatellite DNA markers”. Genet Sel Evol 33 (4): 433–42.Aranguren, J, R Roman, W Isea, Y Villasmil, y J Jordana. 2005. “Los Microsatélites (STR’s), Marcadores Moleculares de ADN Por Excelencia Para Programas de Conservación: Una Revisión”. Archivos Latinoamericanos de Producción Animal 13 (1): 1–6Bejarano, D, R Martínez, L Pedraza, y J Rocha. 2012. “Variabilidad genética en subpoblaciones comerciales de la raza criolla colombiana Romosinuano”. Corpoica Ciencia y Tecnología Agropecuaria 1 (13): 97–107.Asno Criollo Colombiano- InvestigaciónBurro CriolloDiversidad GenéticaPublicationORIGINALT636.18 M491.pdfT636.18 M491.pdfapplication/pdf762259https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/925b5b4f-9824-46cb-8dd0-8adf22969bf6/downloadba3d68bcd64b84333463d1ba07188589MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81366https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/6ca623f0-762a-4c44-ad64-3d8187af884b/download5f839364c91422e4b2a78812717048fbMD52TEXTT636.18 M491.pdf.txtT636.18 M491.pdf.txtExtracted texttext/plain80079https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/d3d4cd51-ae4e-4ea4-996b-c978b6a8d2c4/downloadf4cd07c2b6846e2086bbd8e9eefb263aMD55THUMBNAILT636.18 M491.pdf.jpgT636.18 M491.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg6519https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/38fa406d-282a-46a6-a461-10069f6bc94c/downloadba7abffca24574d0198b47a267e52b3eMD56001/986oai:repositorio.unisucre.edu.co:001/9862024-04-17 16:31:11.505https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Derechos Reservados - Universidad de Sucre, 2019open.accesshttps://repositorio.unisucre.edu.coRepositorio Institucional Universidad de Sucrebdigital@metabiblioteca.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