Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer
90 hojas,
- Autores:
-
Bustamante Díaz, Jesús Darío
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2017
- Institución:
- Universidad de Sucre
- Repositorio:
- Repositorio Unisucre
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unisucre.edu.co:001/836
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unisucre.edu.co/handle/001/836
- Palabra clave:
- Acoplamiento
Molecular
Sitio activo
Alzheimer
CDK5, in silico
- Rights
- openAccess
- License
- Derechos Reservados - Universidad de Sucre
| id |
RUNISUCRE2_60d06383b0198e363c006852b8913ebd |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.unisucre.edu.co:001/836 |
| network_acronym_str |
RUNISUCRE2 |
| network_name_str |
Repositorio Unisucre |
| repository_id_str |
|
| dc.title.spa.fl_str_mv |
Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer |
| title |
Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer |
| spellingShingle |
Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer Acoplamiento Molecular Sitio activo Alzheimer CDK5, in silico |
| title_short |
Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer |
| title_full |
Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer |
| title_fullStr |
Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer |
| title_full_unstemmed |
Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer |
| title_sort |
Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer |
| dc.creator.fl_str_mv |
Bustamante Díaz, Jesús Darío |
| dc.contributor.advisor.spa.fl_str_mv |
Pájaro Castro, Nerlis |
| dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
Bustamante Díaz, Jesús Darío |
| dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Acoplamiento Molecular Sitio activo Alzheimer CDK5, in silico |
| topic |
Acoplamiento Molecular Sitio activo Alzheimer CDK5, in silico |
| description |
90 hojas, |
| publishDate |
2017 |
| dc.date.issued.spa.fl_str_mv |
2017 |
| dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv |
2019-10-03T22:04:34Z |
| dc.date.available.spa.fl_str_mv |
2019-10-03T22:04:34Z |
| dc.type.spa.fl_str_mv |
Trabajo de grado - Pregrado |
| dc.type.coarversion.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_dc82b40f9837b551 |
| dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
| dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/updatedVersion |
| dc.type.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
| dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
| dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
https://purl.org/redcol/resource_type/TP |
| format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
| status_str |
updatedVersion |
| dc.identifier.citation.spa.fl_str_mv |
Bustamante Díaz, J.D.(2017),Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer, Universidad de Sucre, Colombia |
| dc.identifier.uri.spa.fl_str_mv |
https://repositorio.unisucre.edu.co/handle/001/836 |
| identifier_str_mv |
Bustamante Díaz, J.D.(2017),Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer, Universidad de Sucre, Colombia |
| url |
https://repositorio.unisucre.edu.co/handle/001/836 |
| dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.relation.references.spa.fl_str_mv |
Abushouk, Abdelrahman, et al. Bapineuzumab for mild to moderate Alzheimer's disease: a meta-analysis of randomized controlled trials. BMC Neurol [Internet], 2017 [consultado 7 Julio 2017]. Disponible en: <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28376794>. ISSN 1471-2377. Aggleton, John, et al. Thalamic pathology and memory loss in early Alzheimer's disease: moving the focus from the medial temporal lobe to Papez circuit. Brain [Internet], 2016 [consultado 24 Junio 2017]. Disponible en: <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4939698/>. ISSN 1460-2156. AHN, Jae, et al. Defining Cdk5 ligand chemical space with small molecule inhibitors of Tau phosphorylation. Chem Biol [Internet]. 2005 [consultado 24 Julio 2017]. Disponible en: <http://www.cell.com/ccbio/abstract/S1074-5521(05)00157-2>. ISSN 1074-5521. Alam, John y Scheper, Wiep. Targeting neuronal MAPK14/p38α activity to modulate autophagy in the Alzheimer disease brain. Autophagy [Internet], 2016 [consultado 6 Agosto 2017]. Disponible en: <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5173254/>. ISSN 1554-8635. Alonso, Alejandra. Mecanismo de la neurodegeneración inducida por las proteínas tau en la enfermedad de Alzheimer y taupatías relacionadas. Real Invest Demenc [Internet], 2009 [consultado 22 Junio 2017]. Disponible en: <http://www.psiquiatria.com/alzheimer_y_demencia/mecanismo-de-la-neurodegeneracion-inducida-por-las-proteinas-tau-en-la-enfermedad-de-alzheimer-y-taupatias-relacionadas/>. ISSN 1137-1242. |
| dc.rights.spa.fl_str_mv |
Derechos Reservados - Universidad de Sucre |
| dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| dc.rights.uri.spa.fl_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |
| dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| dc.rights.creativecommons.spa.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) |
| rights_invalid_str_mv |
Derechos Reservados - Universidad de Sucre https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ Atribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.spa.fl_str_mv |
Universidad de Sucre |
| dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv |
Facultad Ciencias de la Salud |
| dc.publisher.program.spa.fl_str_mv |
Medicina |
| institution |
Universidad de Sucre |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/018e7d6b-18c8-4fda-9850-9035f2958c8b/download https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/9489e59d-c9a7-4dae-8dfc-5807927b7422/download https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/8932980b-0769-4299-8698-2dce3e660dd7/download https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/1af9b900-7bc2-4445-affd-2710fb289c58/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
a6b9dede74760f8d61dd26f43a1dfca0 5f839364c91422e4b2a78812717048fb 15a8d01ab1f138523a77faefb5ee385b f2157a326c484b4cfed0319152f206c4 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad de Sucre |
| repository.mail.fl_str_mv |
bdigital@metabiblioteca.com |
| _version_ |
1808401158228672512 |
| spelling |
Pájaro Castro, Nerlis2e7e03520b1f8bf32aadfe3e125fff0eBustamante Díaz, Jesús Daríoe7c65149a832e576a03743dbe01c611a2019-10-03T22:04:34Z2019-10-03T22:04:34Z2017Bustamante Díaz, J.D.(2017),Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de Alzheimer, Universidad de Sucre, Colombiahttps://repositorio.unisucre.edu.co/handle/001/83690 hojas,Introducción: La epidemiología global de las demencias va en aumento, se estima una prevalencia cuatro veces mayor para 2050, dentro de estas se encuentra la enfermedad de Alzheimer, demencia para la cual no existe tratamiento, solo se cuenta con fármacos que restablecen, por un tiempo, los procesos cognitivos y conductuales a nivel cerebral, por esta razón, actualmente investigaciones impulsan la inhibición de algunas quinasas para su tratamiento, dentro de las cuales se encuentra la proteína quinasa dependiente de ciclina 5 (CDK5). Objetivo: Identificación de nuevas moléculas con posibilidad de interactuar con la proteína CDK5, inhibiendo su función y otras proteínas relacionadas con la enfermedad de Alzheimer. Metodología: En este trabajo se utilizó un enfoque computacional para lo cual la estructura 3D de la proteína CDK5 fue descargada de Protein Data Bank (PDB) y 911 moléculas de Pubchem, para realizar acoplamientos moleculares mediante Auto Dock Vina. El método fue validado utilizando un inhibidor conocido para la proteína. Además se realizó un acoplamiento inverso con los mejores ligandos seleccionados, para la identificación de otros posibles blancos moleculares relacionado con la enfermedad de Alzheimer. Resultados: Se identificó cinco moléculas que poseen los más altos valores de afinidad, en un rango de -17,7 a 11,6 Kcal/mol, estás se unen al sitio activo de la proteína identificado anteriormente por un inhibidor ya descrito, su interacción fue expuesta con los residuos cisteína 83 y glutamina 81 de CDK5. Conclusiones: A nivel del sitio activo de CDK5 interactúan los ligandos identificado, en consecuencia se infiere que estos podrían intervenir inhibiendo dicha quinasa. Esto abre una futura ventana terapéutica en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer.PregradoMédico(a)application/pdfspaUniversidad de SucreFacultad Ciencias de la SaludMedicinaDerechos Reservados - Universidad de Sucrehttps://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Búsqueda in silico de pequeñas moléculas que interaccionen con la proteína quinasa dependiente de cyclina 5, como un posible tratamiento para la enfermedad de AlzheimerTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/updatedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttps://purl.org/redcol/resource_type/TPhttp://purl.org/coar/version/c_dc82b40f9837b551Abushouk, Abdelrahman, et al. Bapineuzumab for mild to moderate Alzheimer's disease: a meta-analysis of randomized controlled trials. BMC Neurol [Internet], 2017 [consultado 7 Julio 2017]. Disponible en: <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28376794>. ISSN 1471-2377.Aggleton, John, et al. Thalamic pathology and memory loss in early Alzheimer's disease: moving the focus from the medial temporal lobe to Papez circuit. Brain [Internet], 2016 [consultado 24 Junio 2017]. Disponible en: <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4939698/>. ISSN 1460-2156.AHN, Jae, et al. Defining Cdk5 ligand chemical space with small molecule inhibitors of Tau phosphorylation. Chem Biol [Internet]. 2005 [consultado 24 Julio 2017]. Disponible en: <http://www.cell.com/ccbio/abstract/S1074-5521(05)00157-2>. ISSN 1074-5521.Alam, John y Scheper, Wiep. Targeting neuronal MAPK14/p38α activity to modulate autophagy in the Alzheimer disease brain. Autophagy [Internet], 2016 [consultado 6 Agosto 2017]. Disponible en: <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5173254/>. ISSN 1554-8635.Alonso, Alejandra. Mecanismo de la neurodegeneración inducida por las proteínas tau en la enfermedad de Alzheimer y taupatías relacionadas. Real Invest Demenc [Internet], 2009 [consultado 22 Junio 2017]. Disponible en: <http://www.psiquiatria.com/alzheimer_y_demencia/mecanismo-de-la-neurodegeneracion-inducida-por-las-proteinas-tau-en-la-enfermedad-de-alzheimer-y-taupatias-relacionadas/>. ISSN 1137-1242.AcoplamientoMolecularSitio activoAlzheimerCDK5, in silicoPublicationORIGINALT616.831007 B 982.pdfT616.831007 B 982.pdfapplication/pdf2253583https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/018e7d6b-18c8-4fda-9850-9035f2958c8b/downloada6b9dede74760f8d61dd26f43a1dfca0MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81366https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/9489e59d-c9a7-4dae-8dfc-5807927b7422/download5f839364c91422e4b2a78812717048fbMD52TEXTT616.831007 B 982.pdf.txtT616.831007 B 982.pdf.txtExtracted texttext/plain140622https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/8932980b-0769-4299-8698-2dce3e660dd7/download15a8d01ab1f138523a77faefb5ee385bMD55THUMBNAILT616.831007 B 982.pdf.jpgT616.831007 B 982.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg5742https://repositorio.unisucre.edu.co/bitstreams/1af9b900-7bc2-4445-affd-2710fb289c58/downloadf2157a326c484b4cfed0319152f206c4MD56001/836oai:repositorio.unisucre.edu.co:001/8362024-04-17 16:30:49.259https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Derechos Reservados - Universidad de Sucreopen.accesshttps://repositorio.unisucre.edu.coRepositorio Institucional Universidad de Sucrebdigital@metabiblioteca.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 |