Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos

Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) es la causante de la cancrosis de los cítricos, enfermedad que afecta a los cultivos del género Citrus de importancia económica. La naranja Pera Río (Citrus sinensis) es moderadamente tolerante a la enfermedad, mientras que el limón galego (Citrus aurantifolia) e...

Full description

Autores:
Suarez Acevedo, Sara Coromoto
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2021
Institución:
UNIVERSIDAD FRANCISCO DE PAULA SANTANDER
Repositorio:
Repositorio Digital UFPS
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.ufps.edu.co:ufps/4250
Acceso en línea:
http://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/4250
Palabra clave:
Cancrosis de los cítricos
Interacción planta
Transcriptoma
Genes diferencialmente expresados
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)
id RUFPS2_d171d1218a3450f78e7771ba52a291cf
oai_identifier_str oai:repositorio.ufps.edu.co:ufps/4250
network_acronym_str RUFPS2
network_name_str Repositorio Digital UFPS
repository_id_str
spelling Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Rodas Mendoza, Elkin Fernandodeb4a8b5e5babcc31e3d4b611dba5c11300Chaves Bedoya, Giovannid6f3caa72764e9e0d0c59ab88d2a763d500López Barrera, German Luciano8f41ace82610cd74839934b679ad2cc3300Meza Osorio, Hernando Augusto5c81020966a9653f6ddd309e91353817300Suarez Acevedo, Sara Coromotoacdad02395458a1c91bc7d6622515de65002021-12-10T18:21:18Z2021-12-10T18:21:18Z2021http://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/4250instname:Universidad Francisco de Paula Santanderreponame:Repositorio Digital UFPSrepourl:https://repositorio.ufps.edu.co/PMCB V00001/2021Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) es la causante de la cancrosis de los cítricos, enfermedad que afecta a los cultivos del género Citrus de importancia económica. La naranja Pera Río (Citrus sinensis) es moderadamente tolerante a la enfermedad, mientras que el limón galego (Citrus aurantifolia) es altamente susceptible. Para comprender mejor los mecanismos moleculares que subyacen en las diferentes respuestas de Xac, su perfil transcriptómico infectando ambos genotipos fue comparado usando RNA-Seq. 839 y 982 genes diferencialmente expresados (GDE) fueron identificados en Xac durante su interacción con la naranja y el limón, respectivamente. De estos, 607 fueron comunes en ambos genotipos. La anotación de los GDE reveló que Xac induce genes del sistema de secreción tipo III y efectores, enzimas degradadoras de paredes celulares, respuesta a estrés oxidativo, síntesis de goma Xantano, entre otros, en ambos hospederos. Asimismo, análisis demostraron que mutantes de los genes inducidos hrpX, mltB, ugd y una proteína hipotética (XAC_RS01780), relacionada con un regulador transcripcional, presentaron una significativa reducción de los síntomas de la enfermedad, sugiriendo su relevancia en el proceso infeccioso de Xac. Este estudio brindó información sobre el ambiente intercelular de Xac y las posibles estrategias utilizadas por la bacteria para desarrollar la enfermedad.MaestríaMagíster en Ciencias Biológicasapplication/pdf138 páginasspaUniversidad Francisco de Paula SantanderFacultad de Ciencias BásicasSan José de CúcutaMaestría en Ciencias Biológicashttp://alejandria.ufps.edu.co/descargas/tesis/2400008.pdfIdentificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricosTrabajo de grado - MaestríaTextinfo:eu-repo/semantics/mastherThesishttp://purl.org/redcol/resource_type/TMinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionCancrosis de los cítricosInteracción plantaTranscriptomaGenes diferencialmente expresadosORIGINAL2400008.pdfapplication/pdf2154938http://repositorio.ufps.edu.co/bitstream/ufps/4250/1/2400008.pdf2235156b580ace15a45785a4101a3e9dMD51open accessTEXT2400008.pdf.txt2400008.pdf.txtExtracted texttext/plain7342http://repositorio.ufps.edu.co/bitstream/ufps/4250/2/2400008.pdf.txt151ff8d7781e701c5a43c7159779adcfMD52open accessTHUMBNAIL2400008.pdf.jpg2400008.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg16603http://repositorio.ufps.edu.co/bitstream/ufps/4250/3/2400008.pdf.jpg138b4bb7cb9b07e1e3cae522ce17c60bMD53open accessufps/4250oai:repositorio.ufps.edu.co:ufps/42502021-12-11 03:31:11.894An error occurred on the license name.|||https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open accessRepositorio Universidad Francisco de Paula Santanderbdigital@metabiblioteca.com
dc.title.spa.fl_str_mv Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos
title Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos
spellingShingle Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos
Cancrosis de los cítricos
Interacción planta
Transcriptoma
Genes diferencialmente expresados
title_short Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos
title_full Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos
title_fullStr Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos
title_full_unstemmed Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos
title_sort Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos
dc.creator.fl_str_mv Suarez Acevedo, Sara Coromoto
dc.contributor.advisor.spa.fl_str_mv Rodas Mendoza, Elkin Fernando
Chaves Bedoya, Giovanni
López Barrera, German Luciano
Meza Osorio, Hernando Augusto
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Suarez Acevedo, Sara Coromoto
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv Cancrosis de los cítricos
Interacción planta
Transcriptoma
Genes diferencialmente expresados
topic Cancrosis de los cítricos
Interacción planta
Transcriptoma
Genes diferencialmente expresados
description Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) es la causante de la cancrosis de los cítricos, enfermedad que afecta a los cultivos del género Citrus de importancia económica. La naranja Pera Río (Citrus sinensis) es moderadamente tolerante a la enfermedad, mientras que el limón galego (Citrus aurantifolia) es altamente susceptible. Para comprender mejor los mecanismos moleculares que subyacen en las diferentes respuestas de Xac, su perfil transcriptómico infectando ambos genotipos fue comparado usando RNA-Seq. 839 y 982 genes diferencialmente expresados (GDE) fueron identificados en Xac durante su interacción con la naranja y el limón, respectivamente. De estos, 607 fueron comunes en ambos genotipos. La anotación de los GDE reveló que Xac induce genes del sistema de secreción tipo III y efectores, enzimas degradadoras de paredes celulares, respuesta a estrés oxidativo, síntesis de goma Xantano, entre otros, en ambos hospederos. Asimismo, análisis demostraron que mutantes de los genes inducidos hrpX, mltB, ugd y una proteína hipotética (XAC_RS01780), relacionada con un regulador transcripcional, presentaron una significativa reducción de los síntomas de la enfermedad, sugiriendo su relevancia en el proceso infeccioso de Xac. Este estudio brindó información sobre el ambiente intercelular de Xac y las posibles estrategias utilizadas por la bacteria para desarrollar la enfermedad.
publishDate 2021
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2021-12-10T18:21:18Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2021-12-10T18:21:18Z
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2021
dc.type.none.fl_str_mv Trabajo de grado - Maestría
dc.type.content.none.fl_str_mv Text
dc.type.driver.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/mastherThesis
dc.type.redcol.none.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/TM
dc.type.version.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
status_str acceptedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/4250
dc.identifier.instname.none.fl_str_mv instname:Universidad Francisco de Paula Santander
dc.identifier.reponame.none.fl_str_mv reponame:Repositorio Digital UFPS
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv repourl:https://repositorio.ufps.edu.co/
dc.identifier.signature.spa.fl_str_mv PMCB V00001/2021
url http://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/4250
identifier_str_mv instname:Universidad Francisco de Paula Santander
reponame:Repositorio Digital UFPS
repourl:https://repositorio.ufps.edu.co/
PMCB V00001/2021
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.license.none.fl_str_mv Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)
dc.rights.uri.none.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.format.extent.spa.fl_str_mv 138 páginas
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad Francisco de Paula Santander
dc.publisher.faculty.none.fl_str_mv Facultad de Ciencias Básicas
dc.publisher.place.spa.fl_str_mv San José de Cúcuta
dc.publisher.program.none.fl_str_mv Maestría en Ciencias Biológicas
dc.source.none.fl_str_mv http://alejandria.ufps.edu.co/descargas/tesis/2400008.pdf
institution UNIVERSIDAD FRANCISCO DE PAULA SANTANDER
bitstream.url.fl_str_mv http://repositorio.ufps.edu.co/bitstream/ufps/4250/1/2400008.pdf
http://repositorio.ufps.edu.co/bitstream/ufps/4250/2/2400008.pdf.txt
http://repositorio.ufps.edu.co/bitstream/ufps/4250/3/2400008.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 2235156b580ace15a45785a4101a3e9d
151ff8d7781e701c5a43c7159779adcf
138b4bb7cb9b07e1e3cae522ce17c60b
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Universidad Francisco de Paula Santander
repository.mail.fl_str_mv bdigital@metabiblioteca.com
_version_ 1804859711967723520