Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos
Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) es la causante de la cancrosis de los cítricos, enfermedad que afecta a los cultivos del género Citrus de importancia económica. La naranja Pera Río (Citrus sinensis) es moderadamente tolerante a la enfermedad, mientras que el limón galego (Citrus aurantifolia) e...
- Autores:
-
Suárez Acevedo, Sara Coromoto
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad Francisco de Paula Santander
- Repositorio:
- Repositorio Digital UFPS
- Idioma:
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.ufps.edu.co:ufps/7664
- Acceso en línea:
- https://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/7664
- Palabra clave:
- Cancrosis de los cítricos
Interacción planta-patógeno
Transcriptoma
Genes diferencialmente expresados
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Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) es la causante de la cancrosis de los cítricos, enfermedad que afecta a los cultivos del género Citrus de importancia económica. La naranja Pera Río (Citrus sinensis) es moderadamente tolerante a la enfermedad, mientras que el limón galego (Citrus aurantifolia) es altamente susceptible. Para comprender mejor los mecanismos moleculares que subyacen en las diferentes respuestas de Xac, su perfil transcriptómico infectando ambos genotipos fue comparado usando RNA-Seq. 839 y 982 genes diferencialmente expresados (GDE) fueron identificados en Xac durante su interacción con la naranja y el limón, respectivamente. De estos, 607 fueron comunes en ambos genotipos. La anotación de los GDE reveló que Xac induce genes del sistema de secreción tipo III y efectores, enzimas degradadoras de paredes celulares, respuesta a estrés oxidativo, síntesis de goma Xantano, entre otros, en ambos hospederos. Asimismo, análisis demostraron que mutantes de los genes inducidos hrpX, mltB, ugd y una proteína hipotética (XAC_RS01780), relacionada con un regulador transcripcional, presentaron una significativa reducción de los síntomas de la enfermedad, sugiriendo su relevancia en el proceso infeccioso de Xac. Este estudio brindó información sobre el ambiente intercelular de Xac y las posibles estrategias utilizadas por la bacteria para desarrollar la enfermedad. |
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Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)Derechos Reservados - Universidad Francisco de Paula Santander, 2021https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Rodas Mendoza, Elkin Fernandodeb4a8b5e5babcc31e3d4b611dba5c11Chaves Bedoya, Giovannid94b18725e8f1adffa3a8bd2c4b49d29500Suárez Acevedo, Sara Coromotob309f80149a7ed663dbdf9a94e584249-1López Barrera, German LucianoMeza Osorio, Hernando Augusto2024-06-13T20:44:51Z2024-06-13T20:44:51Z2021https://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/7664instname:Universidad Francisco de Paula Santanderreponame:Repositorio Digital UFPSrepourl:https://repositorio.ufps.edu.co/PMCB V00001/2021Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) es la causante de la cancrosis de los cítricos, enfermedad que afecta a los cultivos del género Citrus de importancia económica. La naranja Pera Río (Citrus sinensis) es moderadamente tolerante a la enfermedad, mientras que el limón galego (Citrus aurantifolia) es altamente susceptible. Para comprender mejor los mecanismos moleculares que subyacen en las diferentes respuestas de Xac, su perfil transcriptómico infectando ambos genotipos fue comparado usando RNA-Seq. 839 y 982 genes diferencialmente expresados (GDE) fueron identificados en Xac durante su interacción con la naranja y el limón, respectivamente. De estos, 607 fueron comunes en ambos genotipos. La anotación de los GDE reveló que Xac induce genes del sistema de secreción tipo III y efectores, enzimas degradadoras de paredes celulares, respuesta a estrés oxidativo, síntesis de goma Xantano, entre otros, en ambos hospederos. Asimismo, análisis demostraron que mutantes de los genes inducidos hrpX, mltB, ugd y una proteína hipotética (XAC_RS01780), relacionada con un regulador transcripcional, presentaron una significativa reducción de los síntomas de la enfermedad, sugiriendo su relevancia en el proceso infeccioso de Xac. Este estudio brindó información sobre el ambiente intercelular de Xac y las posibles estrategias utilizadas por la bacteria para desarrollar la enfermedad.Introducción 1. Objetivos 1.1 Objetivos General 1.2 Objetivos Específicos 2. Estado del Arte 2.1 El género Xanthomonas. 2.2 Xanthomonas citri subsp. citri. 2.3 Cancrosis de los Cítricos 2.4 Interacción Planta-Patógeno 2.5 Análisis Transcripcionales 3. Materiales y Métodos 3.1 Bases de Datos Transcriptómicos de Xac in vivo. 3.2 Análisis de los Genes Diferencialmente Expresados (GDE) 3.3 Validación del Transcriptoma por qRT-PCR. 3.4 Anotación Funcional de Genes y Enriquecimiento de Vías Metabólicas 3.5 Diseño del Modelo Representativo del Proceso Infeccioso de Xac 24 hdi. 3.6 Validación Funcional de Algunos Genes Inducidos 3.7 Medición de Peróxido de Hidrógeno en Planta 3.8 Modelamiento de la Proteína XAC_RS01780 4. Resultados 11 15 15 15 16 16 18 20 23 25 27 27 27 28 29 29 29 30 30 32 4.1 El transcriptoma Global de Xac in vivo Direcciona la Identificación de GDE Involucrados en el Desarrollo de la Cancrosis de los Cítricos 4.2 Genes Diferencialmente Expresados en Xac Revelan Indicios sobre su Adaptación en el Apoplasto y sus Principales Mecanismos de Patogenicidad en el Estadio Inicial de la Enfermedad 4.3 Sistema de Secreción Tipo 3 y Efectores 4.4 Genes de Xac Inducidos Específicamente en los Hospederos Cítricos Estudiados 4.5 Diferencias Transcripcionales en Genes de Xac Asociados a Respuesta a Estrés Oxidativo en los Genotipos Estudiados 4.6 Descripción General del Mecanismo de Adaptación de Xac al Interior de los Genotipos Estudiados 4.7 Validación Funcional de los Genes Inducidos de Xac. 4.8 La Proteína Hipotética XAC_RS01780 es un Posible Regulador Transcripcional Asociado a la Familia MarR/DUF24 5. Discusión 6. Conclusiones Referencias Bibliográficas Anexos 32 34 39 40 43 45 46 47 53 64 65 90Archivo Medios ElectrónicosMaestríaMagíster en Ciencias Biológicasapplication/pdf138 páginas. ilustraciones. 2.929 KBUniversidad Francisco de Paula SantanderFacultad de Ciencias BásicasSan José de CúcutaMaestría en Ciencias Biológicashttps://catalogobiblioteca.ufps.edu.co/descargas/tesis/2400008.pdfIdentificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricosTrabajo de grado - MaestríaTextinfo:eu-repo/semantics/mastherThesishttp://purl.org/redcol/resource_type/TMinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionCancrosis de los cítricosInteracción planta-patógenoTranscriptomaGenes diferencialmente expresadosCancrosis de los cítricosInteracción plantaTranscriptomaGenes diferencialmente expresadosufps/7664oai:repositorio.ufps.edu.co:ufps/76642024-09-25 15:54:52.235An error occurred on the license name.|||https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/metadata only accessRepositorio Universidad Francisco de Paula Santanderbdigital@metabiblioteca.com |