Nueva reacción en cadena de la polimerasa múltiple para el diagnóstico específico de especies implicadas en la candidiasis humana
9 p.
- Autores:
-
García Sánchez, Liliana Torcoroma
Luna, Liany Johanna
Velasco, Tania Katherine
Guerra Sierra, Beatriz Elena
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2017
- Institución:
- Universidad de Santander
- Repositorio:
- Repositorio Universidad de Santander
- Idioma:
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- OAI Identifier:
- oai:repositorio.udes.edu.co:001/3206
- Acceso en línea:
- https://repositorio.udes.edu.co/handle/001/3206
- Palabra clave:
- Candidiasis/diagnóstico
Reacción en cadena de la polimerasa
Candida albicans
Diagnóstico molecular
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Candida albicans
Molecular diagnosis
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- Derechos Reservados - Instituto Nacional de Salud, 2017
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Candida albicans is the most prevalent species in both superficial and deep infections, however, the clinical importance of non-albicans Candida has increased during the last decade, driving an urgent need for diagnostic tests that allow for species-level resolution and selection of the optimum therapeutic approach.Objective: To design and to optimize a new multiplex PCR assay for the simultaneous identification of the five most relevant species of Candida involved in human candidiasis etiology.Materials and methods: For primers design, the physical and thermodynamic restrictions that affect multiplex PCR performance were analyzed using Gene Runner and Mult-PSOS. As templates, the internal transcribed region 2 (ITR2) was selected for C. albicans (AJ249486.1), and topoisomerase II (TOPII) for C. parasilopsis (AB049144.1), C. krusei (AB049139.1), C. tropicalis (AB049141.1), andC. guillermondii (AB049145.1). We used ATCC strains of all these five species and clinical isolates as templates.Results: We designed ten oligonucleotides for the simultaneous amplification of the Candida species. The electrophoresis band profile was: C. albicans (206 bp), C. guillermondii (244 bp), C. tropicalis (474 bp), C. parasilopsis (558 bp), and C. krusei (419 bp). Conclusion: The new multiplex PCR assay designed in this study allowed a simultaneous and efficient amplification of the amplicons corresponding to the five species of Candida under study, with an adequate resolution in standard agarose gel.Introducción. Las candidiasis son un grupo de infecciones oportunistas causadas por levaduras del género Candida. Candida albicans es la especie de mayor prevalencia en las infecciones superficiales y profundas. Sin embargo, en la última década, la frecuencia de especies diferentes a C. albicans ha aumentado y, por ende, su relevancia clínica, lo cual exige la utilización de técnicas diagnósticas que permitan su detección y el tratamiento adecuado de los pacientes afectados.Objetivo. Diseñar y optimizar una técnica de reacción en cadena de la polimerasa múltiple (PCR múltiple) considerando parámetros termodinámicos para la detección simultánea de cinco especies de Candidarelevantes en la etiología de la candidiasis humana.Materiales y métodos. Para el diseño de los cebadores se consideraron restricciones físicas y termodinámicas que afectan la PCR múltiple, usando el programa Gene Runner y la herramienta Mult-PSOS. Como plantillas se utilizaron la región transcrita interna 2 (ITS2) (AJ249486.1) para C. albicans y la topoisomerasa II (TOPII) para C. parasilopsis (AB049144.1), C. krusei (AB049139.1), C. tropicalis (AB049141.1) y C. guillermondii (AB049145.1), y como moldes, extractos de ADN total obtenidos de cepas ATCC y de aislamientos clínicos de las especies de Candida.Resultados. Se diseñaron diez cebadores para la amplificación simultánea de las especies de Candida. Se obtuvo el siguiente patrón de bandas: C. albicans (206 pb), C. guillermondii (244 pb), C. tropicalis (474 pb), C. parasilopsis (558 pb) y C. krusei (419 pb).Conclusión. El ensayo diseñado de PCR múltiple permitió la amplificación simultánea y eficiente de todos los amplicones correspondientes a las especies estudiadas de Candida, así como su adecuada resolución en gel de agarosa al 1,3 %.application/pdf10.7705/biomedica.v37i2.32020120-4157https://repositorio.udes.edu.co/handle/001/3206spaBiomedicaDerechos Reservados - Instituto Nacional de Salud, 2017info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://www.revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/3202/3524Candidiasis/diagnósticoReacción en cadena de la polimerasaCandida albicansDiagnóstico molecularCandidiasis/diagnosisPolymerase chain reactionCandida albicansMolecular diagnosisNueva reacción en cadena de la polimerasa múltiple para el diagnóstico específico de especies implicadas en la candidiasis humanaNew multiplex PCR for species-specific diagnosis of human candidiasisArtículo de revistahttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1Textinfo:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85PublicationTHUMBNAILNew multiplex PCR for species-specific diagnosis of human candidiasis.pdf.jpgNew multiplex PCR for species-specific diagnosis of human candidiasis.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1726https://repositorio.udes.edu.co/bitstreams/73d2aa52-92f0-4cae-bf5c-2429e328e534/download7711b090169087048270fe8da2f673f1MD54Nueva reacción en cadena de la polimerasa múltiple para el diagnóstico específico de especies implicadas en la candidiasis humana.pdf.jpgNueva reacción en cadena de la polimerasa múltiple para el diagnóstico específico de especies implicadas en la candidiasis humana.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg12629https://repositorio.udes.edu.co/bitstreams/84a0ac5b-48f1-4f66-9780-d580df32323d/download368662e8e79b89e2c145362412dc41cdMD57LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-859https://repositorio.udes.edu.co/bitstreams/b9b60ffd-6740-4238-a8cf-b814775d1b4f/download38d94cf55aa1bf2dac1a736ac45c881cMD52ORIGINALNueva reacción en cadena de la polimerasa múltiple para el diagnóstico específico de especies implicadas en la candidiasis humana.pdfNueva reacción en cadena de la polimerasa múltiple para el diagnóstico específico de especies implicadas en la candidiasis humana.pdfapplication/pdf354524https://repositorio.udes.edu.co/bitstreams/f39644c1-12d5-4778-b1e5-622b5f80eeed/download120773e352a6a107589bb0c00caca89cMD55TEXTNew multiplex PCR for species-specific diagnosis of human candidiasis.pdf.txtNew multiplex PCR for species-specific diagnosis of human candidiasis.pdf.txtExtracted texttext/plain43623https://repositorio.udes.edu.co/bitstreams/3658454d-dc15-4bf0-b999-b8ce54741a60/downloadf97f7c828a42e916c1aca6a1cf7c452fMD53Nueva reacción en cadena de la polimerasa múltiple para el diagnóstico específico de especies implicadas en la candidiasis humana.pdf.txtNueva reacción en cadena de la polimerasa múltiple para el diagnóstico específico de especies implicadas en la candidiasis humana.pdf.txtExtracted texttext/plain5https://repositorio.udes.edu.co/bitstreams/955f3531-1f29-4c56-909c-8e7acae806b0/download5dbe86c1111d64f45ba435df98fdc825MD56001/3206oai:repositorio.udes.edu.co:001/32062023-10-11 11:03:01.588https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Derechos Reservados - Instituto Nacional de Salud, 2017https://repositorio.udes.edu.coRepositorio Universidad de Santandersoporte@metabiblioteca.comTGljZW5jaWEgZGUgUHVibGljYWNpw7NuIFVERVMKRGlyZWN0cmljZXMgZGUgVVNPIHkgQUNDRVNPCgo= |